Оригинальное исследование Уточнение статуса некоторых мутаций, считающихся патогенными, с помощью признаков безвредных мутаций
Д. И. Борисевич, Л. В. Шаталова, Д. О. Коростин, В. В. Ильинский
Важной задачей современной биоинформатики является предсказание патогенности мутации и ее влияния на фенотип. Она особенно трудна для однонуклеотидных полиморфизмов, чей эффект сложнее всего предсказать. Патогенные мутации берут из курируемых баз данных, таких как Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) и The Human Gene Mutation Database (HGMD), куда включают данные из экспериментальных статей. Однако поскольку различные авторы вкладывают разный смысл в понятие «патогенность мутации», необходимо контролировать данные баз перед их использованием. Мы проанализировали качество данных базы HGMD с помощью наиболее часто используемых биоинформатических инструментов: snpEff, polyphen2 и SIFT. В исследовании мы опирались на признаки, характерные для безвредных мутаций: высокую частоту в популяции, слабое влияние на аминокислотную последовательность белка, низкую патогенность по оценке вычислительных методов. В результате среди мутаций базы нами выявлены однозначно безвредные варианты, а также варианты со спорным значением, для которых тип мутации зависит от используемых для анализа признаков и инструментов.
Статья получена: 10.02.2016
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-03
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 8616
Оригинальное исследование Полиморфизм гена Т-кадгерина (CDH13) ассоциирован с характером манифестации ишемической болезни сердца
А. В. Балацкий, Ф. Р. Чотчаева, А. Д. Иванов, Л. М. Самоходская, В. А. Ткачук
Ряд исследований показал, что белок Т-кадгерин, кодируемый геном CDH13 и являющийся одновременно рецептором липопротеидов низкой плотности и адипоцитарного гормона адипонектина, играет роль в развитии атеросклероза и ишемической болезни сердца (ИБС). Некоторые однонуклеотидные замены в гене CDH13 влияют на экспрессию Т-кадгерина, уровни адипонектина и липидов плазмы крови, однако связь между данными заменами и развитием ИБС не исследована. В настоящей работе изучали роль однонуклеотидных замен rs12051272, rs4783244, rs12444338 и rs11646213 в развитии ИБС и характере ее манифестации. В исследование включили мужчин в возрасте до 55 лет: 79 пациентов со стабильной стенокардией напряжения без инфаркта миокарда, 107 человек, перенесших инфаркт миокарда как дебют ИБС, и 99 здоровых лиц. Всем исследуемым проводили клинико-лабораторное обследование и генотипирование. Результаты генотипирования оценивали с помощью онлайн-программы SNPStats. В настоящей работе взаимосвязи полиморфизма гена CDH13 с развитием ИБС не выявлено, однако показано, что замена rs12051272 ассоциирована с характером дебюта заболевания: генотип GT выявили у 13 (16,5 %) пациентов со стабильной стенокардией напряжения и только у 3 (2,8 %) человек с инфарктом миокарда (отношение шансов — 7,54; 95 % доверительный интервал — 2,01–28,35). Таким образом, показано, что полиморфизм гена CDH13 может влиять на процессы атерогенеза и характер манифестации ИБС.
Статья получена: 29.12.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-04
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6961
Оригинальное исследование Диагностические преимущества многосуточного холтеровского мониторирования электрокардиограммы перед стандартным 24-часовым исследованием
Ю. Н. Горожанцев
Повышение диагностической ценности холтеровского мониторирования ЭКГ при увеличении длительности исследования убедительно доказано в основном в отношении пароксизмальной фибрилляции предсердий. Цель исследования — изучение диагностической эффективности метода многосуточного мониторирования ЭКГ в выявлении различных видов аритмий, оценка неравномерности распределения аритмий между различными сутками наблюдения. Обследованы 27 пациентов (13 мужчин, 14 женщин, средний возраст — 42,8 ± 10,8 года) с жалобами, вызывающими подозрение на наличие различных видов тахи- и брадиаритмии. В исследовании использованы малогабаритные кардиорегистраторы и оригинальное программное обеспечение. Длительность регистрации ЭКГ составила 5–7 сут. С использованием предложенных количественных критериев, характеризующих степень неравномерности межсуточного распределения аритмий, подтверждены преимущества многосуточных исследований перед 24-часовым наблюдением в отношении таких аритмий, как паузы более 2,5 с, АВ-блокада II степени, пароксизмальная суправентрикулярная тахикардия, одиночные желудочковые экстрасистолы, парные и групповые желудочковые экстрасистолы, желудочковая тахикардия.
Статья получена: 11.09.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-05
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6202
Обзор Биометрическая идентификация, основанная на ЭКГ: некоторые современные подходы
А. А. Астапов, Д. В. Давыдов, А. И. Егоров, Д. В. Дроздов, Е. М. Глуховский
Уникальность электрической активности сердца каждого человека побуждает использовать электрокардиограмму в качестве биометрического параметра в различных системах безопасности и аутентификации в связи с легкостью и дешевизной извлечения сигнала, а также сложностью его подделки и недобровольного извлечения. На данный момент применяют различные подходы к исследованию возможности идентификации человека по ЭКГ. Режим идентификации включает в себя следующие стадии: сбор данных, обработка, извлечение характерных признаков, классификация. На каждом из этих этапов группы исследователей используют различные математические алгоритмы: метод главных компонент, вейвлеты, нейронные сети и т. п. В статье рассмотрены наиболее значимые исследования в области идентификации человека по ЭКГ. Проведено сравнение результатов и точности концептуальных подходов.
Статья получена: 07.12.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-06
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7546
Оригинальное исследование Поверхностный фенотип лимфоцитов крови у детей с осевой миопией средней степени при наличии и отсутствии вторичного иммунодефицита
Н. В. Хамнагдаева, Л. Ю. Семенова, С. А. Обрубов, Ж. М. Салмаси, Г. В. Порядин, И. В. Рогожина, А. Н. Казимирский
Изучение влияния вторичного иммунодефицита на развитие близорукости у детей — перспективное направление исследований. Нами был изучен поверхностный фенотип лимфоцитов крови у здоровых детей и детей с осевой миопией средней степени при наличии и отсутствии клинических признаков вторичного иммунодефицита. Средний возраст участников исследования составил 16 ± 0,25 года. В контрольную группу и в каждую из двух опытных подгрупп включили по 8 детей. Изучали экспрессию антигенов CD3, CD4, CD8, CD16, CD56, CD20, CD72, CD38, CD25, CD71, HLA-DR, CD95, mIgM, mIgG, ICAM-1 методом непрямой иммунофлюоресценции. Для детей с близорукостью и вторичным иммунодефицитом выявили лишь одно достоверное (p < 0,05) отличие от показателей контрольной группы — сниженную экспрессию антигена CD4. Для детей с близорукостью и без вторичного иммунодефицита отметили достоверное (p < 0,05) усиление экспрессии антигена CD20 и снижение экспрессии антигена ICAM-1.
Статья получена: 03.11.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-07
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6956
Оригинальное исследование Содержание витаминов в организме городских и сельских школьников и особенности свободнорадикальных реакций в их сыворотке крови
Н. П. Сетко, С. И. Красиков, Е. В. Булычева
Уровень свободнорадикальных реакций в организме является одним из маркеров стресса. Способность организма противостоять окислительным процессам определяется различными факторами, в том числе витаминной обеспеченностью. Витамины А, Е, С и витамины группы В прямо или косвенно влияют на степень антиоксидантной защиты. Нами была изучена витаминная обеспеченность городских (n&nbsp;=&nbsp;250) и сельских (n = 200) школьников в возрасте 12–17 лет и уровень свободнорадикальных реакций в их сыворотке крови (методом индуцированной хемилюминесценции). Дефицит витаминов А и Е, обладающих антиоксидантными свойствами, был выявлен у учащихся как городских, так и сельских школ, однако у первых он был выше. Это согласуется с данными хемилюминесцентного анализа: значения всех показателей хемилюминесценции у городских школьников были в 2,2–7,6 раза выше, чем у сельских, что свидетельствует о более высокой интенсивности окислительных процессов в их организме. Также был выявлен недостаток витаминов группы В в организме сельских школьников за исключением рибофлавина в возрастной подгруппе 15–17 лет.
Статья получена: 25.09.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-08
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7160
Метод Тканевая хемилюминесценция как метод оценки супероксид радикал-продуцирующей способности митохондрий
А. А. Джатдоева, А. М. Полимова, Е. В. Проскурнина, Ю. А. Владимиров
Дисфункция митохондрий лежит в основе развития многих заболеваний человека, включая дегенеративные. Одно из следствий митохондриальной дисфункции — апоптоз функционально-активных клеток. На начальной стадии апоптоза отмечается усиление продукции супероксид анион-радикала (САР). Перспективным методом обнаружения САР в клетках и тканях является метод хемилюминесценции (ХЛ), прежде всего — в присутствии люцигенина, специфичного для САР химического активатора ХЛ. В исследовании был предложен способ усовершенствования метода, а также оценена его эффективность при определении уровня образования САР в переживающих тканях лабораторных животных при моделировании гипоксии и паркинсонизма. Предложенные для аэрации опытных образцов кислород- содержащая (O<sub>2</sub> — 15 %, CO<sub>2</sub> — 5 %, N<sub>2</sub> — 80 %) и бескислородная (CO<sub>2</sub> — 5 %, N<sub>2</sub> — 95 %) газовые смеси обеспечивали постоянство pH 7,4, необходимое для корректной регистрации ХЛ. С помощью изучаемого метода было показано достоверное увеличение уровня образования САР в ткани сердца крыс при циклах гипоксии длительностью 150 и 240 мин — в 1,8 и 2,0 раза. При паркинсонизме уровень образования САР в ткани мозга мышей, содержащей стриатум и черную субстанцию, через 12 ч после введения последней дозы пронейротоксина оказался выше в 1,7 и 1,3 раза соответственно в сравнении с контролем.
Статья получена: 01.10.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-09
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7652
Обзор Сывороточный альбумин как источник и мишень свободных радикалов в патологии
М. М. Созарукова, Е. В. Проскурнина, Ю. А. Владимиров
Окислительный стресс, вызванный избыточным накоплением прооксидантов и/или истощением антиоксидантов, является важным патогенетическим фактором. Он вызывает окислительную модификацию макромолекул, и одной из мишеней окислителей являются белки. Среди антиоксидантов в плазме крови человека особый интерес в качестве мишени для активных форм кислорода представляет сывороточный альбумин. В нашем кратком обзоре он рассмотрен как мишень для свободных радикалов и антиоксидант, а также как источник свободных радикалов в комплексе с ионами меди. Проанализированы возможные мишени свободных радикалов в структуре белка и последствия воздействия радикалов на них. Уделено внимание роли гликозилирования как одного из факторов, способствующих окислительной модификации белков. Приведены собственные экспериментальные данные об изменениях в структуре альбумина при разных моделях окислительного стресса, полученные спектрофлуориметрическим методом, проиллюстрировано усиление антиоксидантных свойств альбумина при физической модели окислительного стресса (ультрафиолетовое облучение).
Статья получена: 30.09.2015
Опубликовано online: 05.01.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2016-01-10
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7877