Оригинальное исследование Распространение вариантов с частыми мутациями в гене капсидного белка N в российских изолятах SARS-CoV-2
С. А. Кирьянов, Т. А. Левина, М. Ю. Кириллов
SARS-CoV-2 представляет собой РНК-вирус семейства β-коронавирусов, вызвавший пандемию тяжелого острого респираторного синдрома (COVID-19). Предполагают, что эволюционные изменения генома ныне преобладающих исходных клонов могут быть обусловлены географическими особенностями, поэтому для штаммов разного происхождения могут быть характерны различные паттерны мутаций. Целью исследования было провести мутационный и филогенетический анализы геномов SARS-CoV-2 российского происхождения в разные периоды и в разных регионах, а также охарактеризовать мутационные профили изолятов, используя подходы биоинформатики. Проведено сравнение накопления мутаций в 86 полногеномных последовательностях SARS-CoV-2 из России и 220 из Европы и Северной Америки для выявления характерных генных вариаций, возможных паттернов селективного отбора. Помимо известных мутаций в генах структурных белков, типичных для изолятов европейского происхождения, выявлены дополнительные синонимичные мутации российского происхождения, в том числе в гене M (C26750Т). Двойная мутация R203K и G204R в гене нуклеокапсида, ранее появившаяся в Европе, распространилась и быстро (в течение месяца) стала доминирующим вариантом в России. Полученные результаты свидетельствуют о том, что геном значительной части изолятов SARS-CoV-2 из России эволюционирует с накоплением новых мутаций, способствующих повышению трансмиссивности вируса. Данные о специфичных мутационных паттернах генома SARS-CoV-2 могут быть использованы для выявления вируса, отслеживания и контроля его распространенности.
Статья получена: 26.06.2020
Опубликовано online: 27.07.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.045
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6796
Оригинальное исследование Анализ микробиоты долгожителей Москвы с использованием высокопроизводительного секвенирования
Д. А. Каштанова, Н. С. Клименко, И. Д. Стражеско, О. Н. Ткачева, Е. В. Старикова, О. Е. Глущенко, Е. А. Гудков, Е. Н. Ильина
Старение населения ставит перед медицинским обществом задачу изучения здорового долголетия, предрасполагающих к нему биомаркеров и характерных особенностей. В настоящей работе рассмотрен один из таких факторов — микробиота кишечника. Целью исследования было изучить состав микробиоты кишечника долгожителей и провести сравнительный анализ с группой относительно здоровых более молодых лиц, проживающих на территории г. Москвы. В одномоментное исследование были включены 20 человек в возрасте 97–100 лет, средний возраст 98 ± 1 год, в качестве группы сравнения была выбрана группа из 92 человек 53 ± 13 лет. Для участников исследования обеих групп проводили секвенирование V3–V4 вариабельных участков гена 16S рРНК микробиоты кишечника. Для первичного анализа, фильтрации ридов и идентификации операционных таксономических единиц использовали QIIME 1.9, для реконструкции метаболических путей — алгоритм PICRUSt. Статистический анализ проводили с использованием языка Python v. 3.2. При межгрупповом сравнении были обнаружены значимые различия в микробиоте долгожителей и относительно здоровых лиц: в составе микробиоты первых были достоверно более представлены Bifidobacterium (р = 0,026) и Coprococcus eutactus (р = 0,026), в то время как у относительно здоровых лиц выявлено больше Bacteroides (р = 0,003) и Prevotella (р = 0,002). Потенциал синтеза масляной кислоты был выше в группе долгожителей (р = 0,048). Состав микробиоты кишечника долгожителей оказался неожиданно благополучным, с большей представленностью полезных бактерий. Кроме того, можно говорить о возможном наличии у долгожителей более выраженного «противовоспалительного» потенциала микробиоты кишечника ввиду лучшей способности микробиоты синтезировать масляную кислоту.
Статья получена: 01.07.2020
Опубликовано online: 26.07.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.044
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7199
Оригинальное исследование Изменение ЭЭГ в частотном диапазоне α-ритма у детей с детским церебральным параличом при применении роботизированной терапии
Н. В. Ларина, М. А. Начарова, Л. Л. Корсунская, С. В. Власенко, В. Б. Павленко
Курс нейрореабилитации с применением комплекса «неинвазивный интерфейс мозг–компьютер и экзоскелет кисти» в сочетании с традиционным курортным лечением приводит у детей с ДЦП к значимому улучшению показателей движений, однако характеристики ЭЭГ не были проанализированы. Целью работы было определить особенности реактивности ЭЭГ пациентов в частотном диапазоне α-ритма при прохождении курса из 10 сеансов роботизированной терапии. ЭЭГ регистрировали в 21 отведении в условиях покоя и кинестетического воображения движений разгибания пальцев рук у 32 детей обоего пола в возрасте 10–18 лет, имеющих диагноз «лево- и правосторонний гемипарез». Во время первого сеанса паттерны реактивности α-ритма при воображении движений у групп детей с лево- и правосторонним гемипарезом различались, причем различия достигали статистической значимости в отведении Р2 при воображении движений левой кисти (F1, 30 = 5,10; p < 0,05). Паттерн реактивности α-ритма во время десятого сеанса отличался замещением реакций синхронизации в ряде отведений на десинхронизацию, что свидетельствует об увеличении активации неокортекса. Наиболее выраженными были изменения ЭЭГ у детей с левосторонним гемипарезом (F20, 300 =1,84; p < 0,05). По завершении курса степень различия показателей ЭЭГ у пациентов с лево- и правосторонним гемипарезом уменьшилась. Выявленные перестройки паттерна ЭЭГ в частотной полосе α-ритма можно рассматривать как проявление процессов благоприятной реорганизации нейронных цепей, контролирующих планирование и выполнение сложных движений рук.
Статья получена: 16.06.2020
Опубликовано online: 16.07.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.043
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 68874
Обзор МикроРНК и сосудистая патология глаза
Л. К. Мошетова, С. А. Ушарова, К. И. Туркина, Д. А. Сычев, И. Н. Сабурина
С момента открытия первой микроРНК несколько десятилетий назад представления о данных молекулах как о биомаркерах и потенциальных терапевтических мишенях различных заболеваний значительно расширились. В современном научном обществе активно обсуждают возможность применения микроРНК для диагностики сердечно-сосудистых заболеваний. Более того, ряд недавно проведенных исследований доказывает, что уровни определенных микроРНК варьируют и при сосудистых заболеваниях глаза, включающих возрастную макулярную дегенерацию и диабетическую ретинопатию. Однако, несмотря на прогресс в исследовании роли некоторых микроРНК в диагностике ряда офтальмологических патологий, информации о возможности использования микроРНК в качестве биомаркеров окклюзии центральной вены сетчатки на сегодняшний день нет. Возможно, что поиск и идентификация данных молекул смогут облегчить постановку диагноза и улучшить качество оказываемой медицинской помощи.
Статья получена: 26.06.2020
Опубликовано online: 15.07.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.042
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6455
Оригинальное исследование Изменения в стенке желудка после гастропликации у пациентов с морбидным ожирением
О. В. Галимов, В. О. Ханов, Р. А. Зиангиров, Е. С. Галимова, Д. М. Минигалин, Д. О. Галимов
Морбидное ожирение — самостоятельное заболевание, ведущее к метаболическим нарушениям и развитию многих серьезных хронических заболеваний, поэтому его эффективное лечение является актуальной проблемой современной медицины. На сегодняшний день морбидное ожирение и ассоциированные с ним заболевания представляют собой все возрастающую проблему, связанную со значительным риском заболеваемости и смертности. Целью исследования было изучить морфофункциональные изменения в стенке желудка после выполнения гастропликации в новом варианте, разработанном на базе кафедры хирургических болезней и новых технологий Башкирского государственного медицинского университета. Гастропликацию выполнили 15 кроликам-самцам породы «Серый великан» в возрасте 12–16 месяцев, весившим 3050–5380 г. Животных выводили из эксперимента через 3, 6 и 12 месяцев с последующим гистологическим изучением стенки пликированного участка желудка. Изменения, происходившие в слизистой и мышечном слое стенки желудка после гастропликации, носили адаптивный характер и не сопровождались серьезными морфологическими нарушениями. Это позволило применить способ в клинической практике у 15 пациентов с морбидным ожирением, 9 женщин и 6 мужчин в возрасте 42 ± 2,1 лет. В дальнейшем у большинства (13 пациентов, 86,7%) удалось достичь стойкого снижения массы тела в течение первых 2–12 месяцев. Отдаленные результаты лечения отслеживали в течение двух лет. Было установлено, что разработанная методика лапароскопической гастропликации не вызывает патологических изменений стенки желудка в пликированной ее части, поэтому ее можно применять в клинической практике для лечения пациентов с морбидным ожирением как технически простую и экономически эффективную.
Статья получена: 12.06.2020
Опубликовано online: 12.07.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.041
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6005
Мнение Анализ внеклеточной фракции РНК плазмы как инструмент диагностики в онкологии
Е. А. Лоломадзе, В. В. Кометова, В. В. Родионов
Одна из ключевых задач современной онкодиагностики — поиск ранних предикторов злокачественных новообразований (ЗНО) при анализе наиболее доступных видов биоматериала. Жидкостная биопсия представляет собой одну из неинвазивных методик и включает в себя обнаружение и выделение циркулирующих опухолевых клеток, циркулирующих опухолевых нуклеиновых кислот и экзосом из плазмы крови у пациентов со злокачественными заболеваниями. Множество работ посвящено исследованию внеклеточной фракции ДНК при ЗНО. Вместе с тем активную пролиферацию трансформированных клеток при развитии опухолей сопровождают значительные изменения экспрессии определенных генов. Обнаружение тканеспецифичных транскриптов в составе внеклеточной РНК плазмы крови (внРНК) позволяет предположить, что представленность циркулирующих в плазме РНК связана с развитием патологического процесса непосредственно в первичном очаге. На наш взгляд, внРНК плазмы крови представляют практическую ценность в качестве молекулярно-генетических маркеров ранней диагностики в онкологии.
Статья получена: 23.06.2020
Опубликовано online: 30.06.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.040
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7137
Оригинальное исследование Диагностическая значимость выявления Lactobacillus spp. в эякуляте
Д. Г. Почерников, Н. Т. Постовойтенко, В. В. Гетьман, И. С. Галкина
В последние годы благодаря внедрению метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) значительно расширился спектр микроорганизмов, выявляемых в мочеполовом тракте мужчин, детализировано представление о структуре бактериальных компонентов микробиома. Одной из наименее изученных групп микроорганизмов остается Lactobacillus spp. При ведении пациентов с репродуктивными нарушениями авторами накоплен клинический опыт, демонстрирующий возможную взаимосвязь изменения уровня половых гормонов и основных показателей спермограммы с наличием Lactobacillus spp. в эякуляте. Целью работы было сравнить уровни лютеинизирующего гормона, фолликулостимулирующего гормона, тестостерона, эстрадиола, пролактина, прогестерона, а также глобулина, связывающего половые гормоны (ГСПГ), в сыворотке крови и изменения показателей спермограммы у 210 мужчин при выявлении в эякуляте Lactobacillus spp. и при их отсутствии. В основную группу были включены 105 мужчин, в эякуляте которых по данным ПЦР-РВ выявлены Lactobacillus spp. в количестве (Lg) ≥ 103. Контрольная группа включала 105 мужчин, у которых отсутствовали Lactobacillus spp. и структура бактериального компонента микробиома эякулята соответствовала норме. В основной группе по сравнению с контрольной у мужчин чаще встречались гормональные нарушения: отклонение от нормы уровней трех и более гормонов (р = 0,04), гиперэстрадиолемия (р = 0,05) и повышение уровня ГСПГ (р = 0,01). Установлено, что наличие Lactobacillus spp. в эякуляте мужчин основной группы ассоциировано с олигоастенотератозооспермией (р < 0,01), со снижением концентрации сперматозоидов (р = 0,01), с ухудшением их подвижности (р < 0,01) и нарушением морфологии (р < 0,01). Таким образом, присутствие в эякуляте Lactobacillus spp. может служить дополнительным маркером нарушения гормонального фона и фертильности у мужчин.
Статья получена: 29.05.2020
Опубликовано online: 29.06.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.039
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 25899
Оригинальное исследование Диагностика и лечение острых хирургических заболеваний у пациентов с COVID-19
В. И. Вечорко, В. Д. Аносов, Б. В. Силаев
Экстренная хирургическая помощь в условиях инфекционного стационара — актуальная проблема во время пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19. Городская клиническая больница № 15 имени О. М. Филатова оказывает экстренную хирургическую помощь в условиях перепрофилирования с 27 марта 2020 г. по настоящее время. Специалистами больницы накоплен большой практический опыт: в апреле 2020 г. выполнено 194, а в мае — 289 оперативных пособий. В статье представлен опыт работы экстренной хирургической службы на этапе перепрофилирования в инфекционный стационар. Среди всех госпитализированных пациентов 482 (5,29%) имели острую хирургическую патологию, потребовавшую экстренного оперативного вмешательства. У 472 (98%) экстренно прооперированных пациентов присутствовала вызванная COVID-19 внебольничная пневмония разной степени тяжести. В статье рассмотрены некоторые особенности острой хирургической патологии и осложнения, встречающиеся у пациентов с COVID-19. Особенности хирургической помощи в перепрофилированном стационаре — это строгое соблюдение эпидемиологического режима, минимизация численности персонала в операционной, возможная минимизация числа оперативных пособий и сокращение их длительности. Наиболее важной задачей в условиях пандемии COVID-19 является безопасность персонала.
Статья получена: 15.06.2020
Опубликовано online: 29.06.2020
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.038
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 7088