Оригинальное исследование Сравнительный анализ биотопа эякулята и цервикального канала методом ПЦР-РВ с тестами «Андрофлор» и «Фемофлор» в супружеских парах
Д. Г. Почерников, И. С. Галкина, Н. Т. Постовойтенко, А. М. Герасимов
Многие инфекции, передающиеся половым путем, вызываются бактериями. Роль ряда микроорганизмов в этиологии урогенитальных инфекций хорошо известна, однако далеко не всех. Во врачебном сообществе также принято считать, что микробиота урогенитального тракта у половых партнеров одинакова, в связи с чем им следует назначать одинаковое лечение. В данной статье сообщается о результатах исследования биотопа эякулята и цервикального канала в 50 супружеских парах, живших без барьерной контрацепции и приема антибактериальных препаратов не менее чем 3 месяца до участия в исследовании. Все пары обратились к врачу по поводу первичного или вторичного бесплодия, привычного невынашивания беременности или предгравидарной подготовки. Средний возраст мужчин составил 34,8 ± 7,8 лет, женщин — 30,4 ± 6,2 лет. Эякулят и отделяемое цервикального канала исследовали методом полимеразной цепной реакции в режиме «реального времени» (ПЦР-РВ) с использованием тестов «Андрофлор» (у мужчин) и «Фемофлор» (у женщин). В биотопе цервикального канала достоверно чаще, чем в биотопе эякулята, встречались Lactobacillus spp. (p < 0,005), Eubacterium spp. (p = 0,002), Gardnerella vaginalis (p = 0,002), Megasphaera spp./Velionella spp./Dialister spp. (p = 0,004). Ureaplasma spp. в 3 раза чаще встречалась у женщин, а Mycoplasma hominis — в 4 раза чаще у мужчин, но различия статистически недостоверны. В 4 (8 %) супружеских парах у обоих партнеров была абсолютно нормальная микрофлора эякулята и цервикального канала; в 23 (46 %) парах были выявлены совпадения между биотопами по одному и более микроорганизмам; также в 23 парах биотопы полностью не совпадали. Полученные данные указывают на необходимость обследовать обоих партнеров в паре для выбора эффективного лечения каждого из них. Метод ПЦР-РВ с тестами «Андрофлор» и «Фемофлор», являясь качественным и количественным, позволяет получить врачу все данные, необходимые для планирования терапии.
Статья получена: 08.04.2017
Опубликовано online: 31.05.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-05
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 8223
Метод Особенности подготовки библиотек для метагеномного секвенирования образцов на платформе Illumina
А. Ю. Красненко, А. Ю. Елисеев, Д. И. Борисевич, К. Ю. Цуканов, А. И. Давыдова, В. В. Ильинский
Метагеномное секвенирование, позволяющее определять таксономическую принадлежность и долю прокариотических организмов в сообществах в разных средах, широко используется не только в научной деятельности, но и в медицинской практике. В настоящее время для изучения микробиома человека применяется так называемое метагеномное секвенирование маркерных генов, при котором секвенируется не весь геном, а лишь те его регионы, по которым можно установить родовую и иногда видовую принадлежность микроорганизмов. Чаще всего для амплификации выбирают участки гена 16S рибосомальной РНК (16S рРНК), последовательность которого, с одной стороны, высококонсервативна, а с другой — содержит вариабельные участки, которые отличаются однонуклеотидными заменами в случае с разными микроорганизмами. При этом для амплификации таких участков генома возможен подбор универсальных праймеров, что значительно снижает стоимость и время исследования. Точность секвенирования в этом случае обеспечивается точностью подбора универсальных праймеров и оптимальностью условий проведения ПЦР на этапе подготовки библиотеки для секвенирования. В статье мы описываем подход к подобру универсальных праймеров и условий ПЦР для амплификации регион-специфической части V3 и V4 участков гена 16S рРНК для дальнейшего секвенирования образцов на платформах Illumina.
Статья получена: 12.04.2017
Опубликовано online: 31.05.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-04
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 9504
Мнение Серин-треониновые протеинкиназы бактерий — потенциальная мишень для регуляции состава микробиоты человека
Н. В. Захаревич, В. Н. Даниленко
Серин-треониновые протеинкиназы (СТПК) участвуют в передаче сигналов у бактерий, вовлечены в процессы роста и деления клетки, образование биопленок и формирование вирулентности. Они встречаются как у патогенных бактерий, так и у симбионтов микробиоты человека. Нами была разработана классификация СТПК грамположительных бактерий, в основе которой лежит сигнатура из 9 аминокислотных остатков, расположенных в области связывания аденина. На основе сигнатуры протеинкиназы и содержащие их роды и виды бактерий были разделены на 20 групп. Было выдвинуто предположение, что СТПК с одинаковой сигнатурой будут взаимодействовать со сходными низкомолекулярными веществами, которые могут быть использованы в качестве селективных ингибиторов СТПК для снижения скорости роста и вирулентности определенных групп бактерий кишечной микробиоты (КМ) человека. КМ, представленная более чем 400 видами бактерий, играет ключевую роль в поддержании гомеостаза организма человека. В норме состав КМ сбалансирован по видам и родам, но при различных заболеваниях таксономический баланс нарушается. Предполагается, что такого рода изменения могут являться триггерами заболеваний. В связи с этим разрабатываются различные подходы по регуляции состава микробиоты человека. В статье предложена концепция, основанная на использовании ингибиторов бактериальных СТПК в качестве «мягкой силы» для коррекции таксономического дисбаланса КМ, вызванного неинфекционными заболеваниями, а также для воздействия на патогенные микроорганизмы (снижения их вирулентности) при минимальном воздействии на протеинкиназы человека.
Статья получена: 28.03.2017
Опубликовано online: 31.05.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-03
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 8456
Оригинальное исследование Идентификация аминогликозидфосфотрансфераз клинических штаммов бактерий в микробиоте жителей России
А. С. Ковтун, М. Г. Алексеева, О. В. Аверина, В. Н. Даниленко
Устойчивость бактерий к антибиотикам является одной из самых серьезных проблем в современной медицине. Эффективность антимикробной терапии снижается вследствие работы бактериальных ферментов — аминогликозидфосфотрансфераз (Aph). Гены aph аннотированы в геномах многих бактерий, в том числе комменсалов микробиоты кишечника, из геномов которых они могут попадать в геномы клинически значимых штаммов. Анализ in silico 11 метагеномов кишечника здоровых людей из России показал наличие в 7 образцах микробиоты 3 генов aph из 21, включенного в каталог, составленный для исследования: aph(3'')-Ib, aph(3')-IIIa и aph(2'')-Ia. Наиболее распространенным оказался ген  aph(3')-IIIa, найденный в 6 исследованных метагеномах. Важно, что этот ген впервые был обнаружен у Enterococcus faecalis, но в данной работе он был идентифицирован в генетическом окружении, характерном для комменсальной бактерии Ruminococcus obeum и условно-патогенных бактерий Enterococcus faecium, Roseburia hominis, Streptococcus pyogenes и Staphylococcus epidermidis.  То же наблюдали для гена aph(2'')-Ia: он был обнаружен для Clostridium difficile,  а не для E. faecalis. Полученные результаты согласуются с литературными данными, указывающими на значимое влияние географического происхождения людей на распространенность aph-генов. Также, учитывая данные исследования, представляется обоснованным при клиническом обследовании пациентов с инфекционными заболеваниями и назначении антибиотиков для их лечения анализировать антибиотикорезистентность не только бактерии-возбудителя, но и микробиоты пациента.
Статья получена: 29.03.2017
Опубликовано online: 29.05.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-02
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 8919
Обзор Микробиом человека
А. В. Чаплин, Д. В. Ребриков, М. Н. Болдырева
Симбиотическая микрофлора играет огромную роль в обеспечении здорового состояния нашего организма. Она защищает от патогенов, поддерживает иммунитет, обеспечивает производство важных компонентов питания. Микробиота человека включает, по всей видимости, несколько тысяч видов грибов, эубактерий, архей и вирусов. Суммарное количество клеток только эубактерий в составе микробиоты превышает десять триллионов, что в сто раз больше числа собственных клеток организма человека. С появлением методов высокопроизводительного секвенирования исследователи получили возможность очень точной и комплексной оценки всего микробного сообщества с глубиной до тысячных долей процента (по содержанию микроба). Это позволило выйти на новый уровень понимания взаимосвязи здоровья человека и состояния его микробиома. В данном обзоре представлено современное состояние исследований ключевых микробных биоценозов человека — пищеварительного и урогенитального трактов. Менее изученные биоценозы носа и носоглотки, слухового канала, глаз, кожи и ряд других в обзор не вошли.
Статья получена: 16.04.2017
Опубликовано online: 27.05.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-01
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 11619
Оригинальное исследование Ключевые показатели результативности деятельности научных организаций в сфере здравоохранения за 2011–2015 гг.
А. С. Анискевич, Р. А. Хальфин
Определены 16 ключевых критериев результативности деятельности научных организаций в сфере здравоохранения, характеризующих результативность и востребованность научных исследований, развитие кадрового потенциала, интеграцию в мировое научное пространство, распространение научных знаний и повышение престижа науки, ресурсное обеспечение деятельности организаций. В рамках классификационного подхода рассмотрены медицинские научные учреждения, показаны их особенности. Представлена системная оценка результативности деятельности научных организаций в сфере здравоохранения. Продемонстрирована высокая значимость показателей, отражающих результативность и востребованность научных исследований. Отмечены недостаточность применяемых параметров и отсутствие системного подхода к анализу кадрового потенциала. Доказана важная роль дополнительных критериев оценки, составивших 37,5 % общей доли ключевых показателей.
Статья получена: 10.02.2017
Опубликовано online: 14.03.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-01-10
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6794
Оригинальное исследование Лечение ран экстрактом из листьев трансгенного каланхоэ с цекропином P1 (гистологическое исследование)
А. С. Белоус, А. Б. Шевелев, Е. В. Трубникова, Ю. К. Бирюкова, Е. С. Мишина, Е. А. Лойко, А. А. Лебедева, Н. С. Захарченко
Проблема лечения гнойных ран актуальна в хирургии в связи с распространенностью ран различной этиологии, частотой гнойных осложнений, высокой летальностью, появлением антибиотикорезистентных штаммов бактерий. В работе исследована эффективность фармакотерапии раневого процесса экстрактом листьев трансгенного каланхоэ перистого с антимикробным пептидом цекропином P1. Гнойную рану моделировали на крысах линии Wistar с внесением в рану культуры Staphylococcus aureus. Сформировали 4 группы по 10 животных в каждой. Во всех группах раны обрабатывали ежедневно однократно 3 % раствором перекиси водорода и дополнительным препаратом, кроме группы 1 (контрольной). В группе 2 использовали 10 % раствор цефазолина, в группе 3 — сок каланхоэ, в группе 4 — сок каланхоэ с цекропином P1. Гистологическое исследование раневых биоптатов производили на 3, 10 и 14 сутки с начала лечения после выведения крыс из эксперимента путем передозировки наркоза. Результаты лечения через 3 сут были схожими во всех группах. Через 10 сут для ран крыс контрольной группы была отмечена незавершенность фазы экссудации, группы 2 — переход фазы экссудации в фазу регенерации, а групп 3 и 4 — покрытие грануляционной тканью. Несмотря на восстановление эпидермиса по краям ран в группах 2 и 3, кое-где сохранялся струп, а грануляционная ткань была менее зрелой, чем в группе 4. Результаты позволяют рекомендовать экстракт листьев трансгенного каланхоэ перистого с цекропином P1 для широкого клинического изучения.
Статья получена: 05.02.2017
Опубликовано online: 13.03.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-01-09
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 8490
Оригинальное исследование Выявление оккультного гепатита B при тестировании донорской крови
Ж. Г. Еремеева, В. Х. Фазылов
Эпидемиологическую опасность представляют лица с оккультным (латентным) гепатитом B. Исследование крови доноров только на поверхностный антиген вируса (hepatitis B virus, HBV) HBsAg не может обеспечить полную инфекционную безопасность крови, следствием чего может быть посттрансфузионная передача инфекции. Это объясняется тем, что вирус присутствует в организме даже при отрицательном HBsAg. В работе проанализированы данные 61 155 доноров Республиканского центра крови (Казань), полученные в 2010–2014 гг. Анализировали результаты тестирования на HBsAg, anti-HBc-total, anti-HBc IgM (методом иммуноферментного анализа) и определения ДНК вируса в крови (методом полимеразной цепной реакции в «реальном времени»). Установлено, что доноры с оккультным гепатитом B выявляются ежегодно, хотя и отмечена тенденция к снижению их числа. Для предотвращения распространения вируса в популяции рекомендуется ввести в стандарт диагностики HBV-инфекции определение маркера anti-HBc-total.
Статья получена: 01.02.2017
Опубликовано online: 13.03.2017
DOI: 10.24075/brsmu.2017-01-08
Комментарии 0
ПРОСМОТРЫ 6921