Вестник РГМУ

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики

Е. И. Иванова¹, Ю. П. Джиоев², А. Ю. Борисенко², Н. П. Перетолчина², Л. А. Степаненко², Е. В. Григорова¹, А. И. Парамонов¹, У. М. Немченко¹, Т. В. Туник¹, Е. А. Кунгурцева¹

Информация об авторах

¹ Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека, Иркутск

² Институт биомедицинских технологии, Иркутский государственный медицинский университет, Иркутск

Для корреспонденции: Елена Иннокентьевна Иванова
ул. Тимирязева, д. 16, г. Иркутск, 664003; moc.liamg@mei.avonavi

Информация о статье

Статья получена: 15.03.2018 Статья принята к печати: 24.03.2018 Опубликовано online: 27.06.2018

Рис. 1. Cas-гены (А) и их расположение в геноме (Б) E. coli HS (№ CP000802), обнаруженные при помощи MacSyFinder и визуализированные через MacSyView

Рис. 2. Структурные и функциональные характеристики белков Сas E. coli HS (№ CP000802), обнаруженные при помощи MacSyFinder

Рис. 3. Консенсусная схема чередующихся повторов в геноме штамма E. coli HS (№ CP000802), полученных при помощи приложения «CRISPI: a CRISPR Interactive database». Размер нуклеотидных символов свидетельствует о величине вариабельности нуклеотида в последовательности повтора — чем меньше его высота, тем он более изменчив

Рис. 4. Расположение cas-генов и CRISPR-кассеты в геноме штамма E. coli HS (№ CP000802)

Таблица 1. Список последовательностей в CRISPR-кассете: спейсерные участки (spacer) разделенные повторами (repeat-unit), обнаруженные при помощи «CRISPI: a CRISPR Interactive database» в геноме штамма E. coli HS (№ CP000802)

Таблица 2. Спект фаговых рас, выявленных по комплементарным структурам спейсерных последовательностей CRISPR-кассеты штамма E. coli HS (№ CP000802)

На указанные почтовые адреса будет отправлена ссылка на статью:

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики

Е. И. Иванова, Ю. П. Джиоев, А. Ю. Борисенко, Н. П. Перетолчина, Л. А. Степаненко, Е. В. Григорова, А. И. Парамонов, У. М. Немченко, Т. В. Туник, Е. А. Кунгурцева

Опубликовано в журнале "Вестник РГМУ" 2, 2018

Отправить копию письма мне на e-mail

Vancouver style

Иванова Е.И., Джиоев Ю.П., Борисенко А.Ю., Перетолчина Н.П., Степаненко Л.А., Григорова Е.В. и др. Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики. Вестник РГМУ. 2018; (2): 28–34. DOI: 10.24075/vrgmu.2018.019

Harvard style

Иванова, Е. И., Джиоев, Ю. П., Борисенко, А. Ю., Перетолчина, Н. П., Степаненко, Л. А., Григорова, Е. В. и др. (2018), "Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики", Вестник РГМУ, №2, с. 28–34. DOI: 10.24075/vrgmu.2018.019

ГОСТ

Иванова, Е. И., Джиоев, Ю. П., Борисенко, А. Ю., Перетолчина, Н. П., Степаненко, Л. А., Григорова, Е. В. и др. Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики // Вестник РГМУ. 2018. №2. С. 28–34. DOI: 10.24075/vrgmu.2018.019

Запомнить меня

Забыли пароль?

Я соглашаюсь с редакционной политикой журнала

Архив

2018 / 02

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Поиск и анализ CRISPR-Cas системы в штамме Escherichia coli HS и детектируемых спейсерами его CRISPR-кассеты фаговых рас методами биоинформатики