ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Следы взаимодействия финноязычного, славянского и тюркоязычного населения в современном генофонде и их отражение в фармакогенетике

Е. В. Балановская1,2,3, И. О. Горин1, Г. Ю. Пономарев2, В. Ю. Пылёв1,3, В. С. Петрушенко1, Н. В. Маркина2, А. Д. Мамаева2, А. К. Ларин4, А. Т. Агджоян2
Информация об авторах

1 Медико-генетический научный центр имени Н. П. Бочкова, Москва, Россия

2 Институт общей генетики имени Н. И. Вавилова, Москва, Россия

3 Биобанк Северной Евразии, Москва, Россия

4 Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства, Москва, Россия

Для корреспонденции: Елена Владимировна Балановская
ул. Москоречье, д. 1, 115522, г. Москва, Россия; ur.liam@aksvonalab

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено при поддержке грантов РФФИ №20-29-01017 Древняя ДНК (биоинформационный анализ), РНФ №21-14-00363 (анализ фармакогенетических маркеров), а также Государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ для Института общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН (картографический анализ) и Медико-генетического научного центра им. академика Н. П. Бочкова (интерпретация результатов).

Благодарности: авторы благодарят всех доноров образцов, которые принимали участие в данном исследовании, АНО «Биобанк Северной Евразии» за предоставление коллекций ДНК.

Статья получена: 01.04.2022 Статья принята к печати: 16.04.2022 Опубликовано online: 26.04.2022
|
Риc. 1. Вклад предковых компонент ADMIXTURE в индивидуальные геномы изученных популяций при k = 3, k =7, k = 8 предковых компонент. Каждая предковая компонента обозначена своим цветом; каждая вертикальная линия — индивидуальный геном с палитрой вкладов в него предковых компонент; совокупность индивидуальных геномов популяции отделена от другой популяции белой линией; названия и состав популяций приведены в таблице
Риc. 2. Пространственная изменчивость трех предковых компонент ADMIXTURE при k = 3 предковых компонент. Распространение «западной» (А), «уральской» (Б) и «восточной» (В) предковых компонент. Высокие значения предковой компоненты обозначены коричнево-фиолетовыми тонами, низкие — зелеными, шкала переходов приведена в легенде под картой; изученные популяции обозначены красными кружками
Риc. 3. Пространственная изменчивость трех предковых компонент ADMIXTURE при k = 7 предковых компонент. Распространение «славянской» (А), «мордовской-1» (Б) и «мордовской-2» (В) предковых компонент. Высокие значения предковой компоненты обозначены коричнево-фиолетовыми тонами, низкие — зелеными, шкала переходов приведена в легенде под картой; изученные популяции обозначены красными кружками
Риc. 4. Доля индивидуальных геномов (%), в которых обнаружены предковые компоненты «Мордовская-1» и «Мордовская-2» (русские популяции)
Риc. 5. Фармакогенетический ландшафт региона (генетические расстояния от русских Рязанской области по фармакогенетическим маркерам). Минимальные генетические расстояния (близость к генофонду русских Рязанской области) обозначены зелеными тонами; максимальные генетические расстояния (несходство с генофондом русских Рязанской области) обозначены красно-фиолетовыми тонами
Таблица. Оценка вклада каждой из десяти предковых компонент ADMIXTURE при k = 3 и k = 7 в геномы каждой из изученных популяций