ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Полиморфизмы rs17713054 и rs1800629 генов LZTFL1 и TNF ассоциированы с тяжестью течения COVID-19
1 «Система-БиоТех», Москва, Россия
2 Диагностический центр (Центр лабораторных исследований) Департамента здравоохранения города Москвы, Москва, Россия
3 Научно-исследовательский институт скорой помощи имени Н. В. Склифосовского, Москва, Россия
Для корреспонденции: Наталья Вячеславовна Позднякова
1-я Курьяновская ул., д. 34, кор.11, Москва, Россия; ur.hcetoibametsis@avokayndzop.n
Финансирование: исследование профинансировано главным акционером компании ООО «Система-БиоТех», АФК «Система». Исследование профинансировано в рамках двойного слепого клинического исследования Департаментом здравоохранения г. Москвы.
Благодарности: авторы благодарят заместителя руководителя Департамента здравоохранения г. Москвы Ю. О. Антипову за организацию исследования; за предоставление образцов биологических материалов пациентов ГБУЗ «Диагностический центр (Центр лабораторных исследований) г. Москвы».
Вклад авторов: Н. В. Позднякова, С. В. Поярков — концепция и дизайн исследования; М. М. Минашкин — выполнение молекулярно-генетических работ, лабораторная постановка; С. В. Поярков, А. А. Траспов — обзор литературы, написание статьи; А. А. Траспов — статистическая обработка и редактирование статьи; А. Г. Комаров — руководство, планирование эксперимента, анализ данных; И. А. Штинова, Г. И. Спешилов и И. А. Карбышев — предоставление клинического материала и метаданных; М. А. Годков — контроль за сбором образцов, предоставление обезличенных данных.
Соблюдение этических стандартов: одобрение этического комитета не требовалось в связи с работой с обезличенными данными пациентов и двойным слепым форматом исследования.
Генетические и негенетические факторы ответственны за высокую межиндивидуальную вариабельность ответа на SARS-CoV-2. Хотя многочисленные генетические полиморфизмы были идентифицированы как факторы риска тяжелого течения COVID-19, они остаются недостаточно изученными в российской популяции. Целью данного исследования было выявить генетические детерминанты, ассоциированные с тяжелым течением COVID-19 на выборке пациентов из Российской Федерации. Проведена оценка связи генетических полиморфизмов rs17713054 в гене LZTFL1 и rs1800629 в гене TNF (фактор некроза опухоли) с тяжестью COVID-19. Были исследованы образцы ДНК 713 пациентов (324 мужчины и 389 женщины) возрастом 18‒95 лет с COVID-19, протекавшей с разной степенью тяжести. Идентифицированы rs1800629 TNF (OR = 1,5; p = 0,02) и rs17713054 LZTFL1 (OR = 1,60; p = 0,0043) как факторы риска тяжелого течения. Полиморфизмы TNF rs1800629 и LZTFL1 rs17713054 могут быть потенциальным предиктивным и предиктивным биомаркерами. Показана сильная ассоциация rs17713054 G > A с тяжелым течением. Полученные данные могут в дальнейшем стать основой для разработки тест-систем предсказания рисков тяжести течения вирусных заболеваний респираторного тракта.
Ключевые слова: SNP, SARS-CoV-2, COVID-19, LZTFL1, TNF, тяжесть течения, генетические детерминанты