2023 / 03

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2023.017

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Роль кавказского, иранского и степного населения в формировании многообразия аутосомного генофонда Восточного Кавказа

Е. В. Балановская1,2, И. О. Горин1, В. С. Петрушенко1, Г. Ю. Пономарёв1, Р. О. Белов1, Э. А. Почешхова1,3, В. А. Салаев1, Н. А. Искандаров1, В. Ю. Пылёв1,2
Информация об авторах

1 Медико-генетический научный центр, Москва, Россия

2 Биобанк Северной Евразии, Москва, Россия

3 Кубанский государственный медицинский университет, Краснодар, Россия

Для корреспонденции: Владимир Юрьевич Пылёв
ул. Москворечье, д. 1, 115522, г. Москва, Россия; ur.xednay@tsurteerf

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено при поддержке гранта РНФ №21-74-00156 (биоинформационный анализ генофондов Восточного Кавказа и Закавказья), Государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ для Медико-генетического научного центра им. академика Н. П. Бочкова (картографический анализ, интерпретация результатов), Биобанка Северной Евразии (экспедиционное исследование).

Благодарности: авторы благодарят всех участников экспедиционного обследования (доноров образцов), АНО «Биобанк Северной Евразии» — за предоставление коллекций ДНК и результатов генотипирования.

Вклад авторов: Е. В. Балановская — руководство, дизайн и написание статьи, организация и проведение экспедиционного обследования народов Дагестана; И. О. Горин, В. С. Петрушенко — биоинформатический анализ; Г. Ю. Пономарев — работа с ДНК-коллекциями, картографический анализ; Р. О. Белов — работа с ДНК-коллекциями, оформление статьи; Э. А. Почешхова — проведение экспедиционного обследования народов Дагестана; В. А. Салаев — организация и проведение обследования талышей Азербайджана; Н. А. Искандаров — организация и проведение обследования азербайджанцев Азербайджана; В. Ю. Пылёв — организация генотипирования, статистический анализ.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Медико-генетического научного центра имени Н. П. Бочкова (протокол № 1 от 29 июня 2020 г.).

Статья получена: 26.04.2023 Статья принята к печати: 13.05.2023 Опубликовано online: 29.05.2023
|
  1. Yunusbayev B, Metspalu M, Järve M, Kutuev I, Rootsi S, Metspalu E, et al. The Caucasus as an asymmetric semipermeable barrier to ancient human migrations. Molecular biology and evolution. 2012; 29 (1): 359–65.
  2. Jeong C, Balanovsky O, Lukianova E, Kahbatkyzy N, Flegontov P, Zaporozhchenko V, at al. The genetic history of admixture across inner Eurasia. Nature ecology & evolution. 2019; 3 (6): 966–76.
  3. Yunusbayev B, Metspalu M, Metspalu E, Valeev A, Litvinov S, Valiev R, at al. The genetic legacy of the expansion of Turkicspeaking nomads across Eurasia. PLoS Genetics. 2015; 11 (4): e1005068.
  4. Behar DM, Metspalu M, Baran Y, Kopelman NM, Yunusbayev B, Gladstein A, et al. No evidence from genome-wide data of a Khazar origin for the Ashkenazi Jews. Human biology. 2013; 85 (6): 859–900.
  5. Lazaridis I, Patterson N, Mittnik A, Renaud G, Mallick S, Kirsanow K, et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature. 2014; 513 (7518): 409–13.
  6. Fattahi Z, Beheshtian M, Mohseni M, Poustchi H, Sellars E, Nezhadi SH, et al. Iranome: A catalog of genomic variations in the Iranian population. Human mutation. 2019; 40 (11): 1968–84.
  7. Kars ME, Başak AN, Onat OE, Bilguvar K, Choi J, Itan Y, et al. The genetic structure of the Turkish population reveals high levels of variation and admixture. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2021; 118 (36): e2026076118.
  8. Балановская Е. В., Агджоян А. Т., Горин И. О., Петрушенко В. С., Пылёв В. Ю., Кулемин Н. А., и др. В поисках аланского следа: генетическая история Северного Кавказа по полногеномным данным об аутосомном генофонде. Вестник Московского университета. Серия 23. Антропология. 2022 (3): 48–62.
  9. Behar DM, Yunusbayev B, Metspalu M, Metspalu E, Rosset S, Parik J, et al. The genome-wide structure of the Jewish people. Nature. 2010; 466 (7303): 238–42.
  10. Chang CC, Chow CC, Tellier LC, Vattikuti S, Purcell SM, Lee JJ. Second-generation PLINK: rising to the challenge of larger and richer datasets. Gigascience. 2015; 4: 1–16.
  11. Manichaikul A, Mychaleckyj JC, Rich SS, Daly K, Sale M, Chen WM. Robust relationship inference in genome-wide association studies. Bioinformatics. 2010; 26 (22): 2867–73.
  12. Price AL, Patterson NJ, Plenge RM, Weinblatt ME, Shadick NA, Reich D. Principal components analysis corrects for stratification in genome-wide association studies. Nature genetics. 2006; 38 (8): 904–9.
  13. McKinney W. Data structures for statistical computing in python. InProceedings of the 9th Python in Science Conference. 2010; 28–445 (1): 51–56.
  14. Hunter JD. Matplotlib: A 2D graphics environment. Computing in science & engineering. 2007; 9 (03): 90–5.
  15. Waskom M, Botvinnik O, O'Kane D, Hobson P, Lukauskas S, Gemperline DC, et al. Mwaskom/Seaborn: V0. 8.1. Zenodo. 2017.
  16. Alexander DH, Novembre J, Lange K. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals. Genome research. 2009; 19 (9): 1655–64.