ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Генотипическая характеристика штаммов Bordetella pertussis — кандидатов для получения коклюшного компонента вакцинных препаратов (сообщение I)

Информация об авторах

1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва, Россия

2 Научный центр экспертизы средств медицинского применения Минздрава России, Москва, Россия

3 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Ольга Юрьевна Борисова
ул. Адмирала Макарова, д. 10, 125212, г. Москва, Россия; ur.liam@avosirobglo

Информация о статье

Вклад авторов: О. Ю. Борисова — молекулярно-генетические исследования, анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; И. Ю. Андриевская — молекулярно-генетические исследования, анализ данных, подготовка рукописи; А. С. Пименова, Н. Т. Гадуа, И. А. Чагина, И. А. Алексеева — микробиологические исследования, подготовка рукописи; А. Б. Борисова, Л. И. Кафарская — анализ литературы, анализ данных, подготовка рукописи; А. В. Чаплин — биоинформатический и филогенетический анализ, подготовка рукописи.

Статья получена: 09.04.2024 Статья принята к печати: 24.04.2024 Опубликовано online: 30.04.2024
|
  1. Петрова М. С., Попова О. П., Борисова О. Ю., Абрамова Е. Н., Вартанян Р. В., Келли Е. И. Коклюш у детей раннего возраста. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2012; 6: 19–24. DOI: 10.17816/EID40704.
  2. Бабаченко И. В., Нестерова Ю. В., Чернышова Ю. Ю., Карасев В. В., Починяева Л. М., Калисникова Е. Л. Клиникоэпидемиологические аспекты коклюша у детей в условиях массовой вакцинопрофилактики. Журнал инфектологии. 2019; 11 (2): 88–96. DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-2-88-96.
  3. Краснов В. В., Ильяненков К. Ф., Павлович Л. Р., Кузмичева М. В. Коклюш у детей первого года жизни. Детские инфекции. 2018; 1 (1): 12–17. DOI: 10.22627/2072-8107-2018-17-1-12-17.
  4. Об организации проведения внешнего контроля качества исследований по диагностике дифтерии и коклюша в 2024 году в Дальневосточном и Уральском федеральных округах. Информационное письмо № 02/1860-2024-27 от 06.02.2024. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор).
  5. Басов А. А., Высочанская С. О., Цвиркун О. В., Белова Т. Р., Адугюзелов С. Э., и др. Критерии оценки эпидемиологической ситуации по коклюшу в Российской Федерации. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2024; 23 (2): 4–13. DOI: 10.31631/2073-3046-2024-23-1-4-13.
  6. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2021 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2022; 340 с.
  7. Нестерова Ю. В., Медкова А. Ю., Бабаченко И. В., Семин Е. Г., Калисникова Е. Л., Синяшина Л. Н. Клинико-диагностическое значение генетических маркеров Bordetella pertussis у контактных лиц в семейных очагах. Журнал инфектологии. 2019; 11 (1): 17–24. DOI: 10.22625/2072-6732-2019-11-1-17-24.
  8. Philipson K, Goodyear-Smith F, Grant CC, Chong A, Turner N, Stewart J. When is acute persistent cough in school-age children and adults whooping cough? British Journal of General Practice. 2013; 63 (613): 573–9. DOI: 10.3399/bjgp13X670705.
  9. Пименова А. С., Борисова О. Ю., Цвиркун О. В., Басов А. А., Алешкин В. А., Афанасьев С. С., и др. Эффективность применения молекулярно-генетической диагностики при обследовании очагов коклюшной инфекции. Инфекция и иммунитет. 2017; 7 (2): 162–70. DOI: 10.15789/2220-7619-2017-2-162-170.
  10. Скирда Т. А., Борисова О. Ю., Петрова М. С., Борисова А. Б. Серологическая диагностика коклюша у лиц старшего возраста. Клиническая лабораторная диагностика. 2020; 65 (8): 492–5. DOI: 10.18821/0869-2084-2020-65-8-492-495.
  11. Esposito S, Stefanelli P, Fry NK, Fedele G, He Q, Paterson P, et al. Pertussis prevention: reasons for resurgence, and differences in the current acellular pertussis vaccines. Frontiers in Immunology. 2019; 10: 1344. DOI: 10.3389/fimmu.2019.01344.
  12. Mooi FR, Van Der Maas NA, De Melker HE. Pertussis resurgence: waning immunity and pathogen adaptation — two sides of the same coin. Epidemiol Infect. 2014; 142 (4): 685–94. DOI: 10.1017/S0950268813000071.
  13. Скирда Т. А., Борисова О. Ю., Борисова А. Б., Комбарова С. Ю., Пименова А. С., Гадуа Н. Т., и др. Определение противококлюшных антител у школьников с длительным кашлем. Журнал инфектологии. 2023; 15 (1): 93–100. DOI: 10.22625/2072-6732-2023-15-1-93-100.
  14. Борисова О. Ю., Гадуа Н. Т., Пименова А. С., Петрова М. С., Попова О. П., Алешкин В. А., и др. Структура популяции штаммов возбудителя коклюша на территории России. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016; 4: 22–28. DOI: 10.31631/2073-3046-2016-15-4-22-28.
  15. Андриевская И. Ю., Борисова О. Ю., Пименова А. С., Борисова А. Б., Гадуа Н. Т., Чагина И. А. Генотипирование возбудителя коклюша из клинических образцов. Материалы XVI Ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням имени академика В.И. Покровского к 300-летию Российской академии наук, Москва, 25–27 марта 2024 г. М.: Медицинское маркетинговое агентство, 2024; 250 с: 19–20. ISBN 978-5-6048391-2-6.
  16. Андриевская И. Ю., Пименова А. С., Гадуа Н. Т., Чагина И. А., Борисова О. Ю. Аллельное типирование ptxP Bordetella pertussis в клинических образцах. Материалы конгресса с международным участием «Молекулярная диагностика и биобезопасность – 2024», Москва, 16 – 17 апреля 2024 г. М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2024; 266 с.: 36. DOI: 10.36233/978-5-6048873-9-4.
  17. Kentaro K, ShuMan Y, Chuen-Sheue C, Phung TBT, Do TTN, et al. Genotyping and macrolide-resistant mutation of Bordetella pertussis in East and South-East Asia. J Glob Antimicrob Resist. 2022; 31: 263–9. DOI: 10.1016/j.jgar.2022.10.007.
  18. Barkoff AM, Mertsola J, Pierard D, Dalby T, Hoegh SV, Guillot S, et al. Surveillance of Circulating Bordetella pertussis Strains in Europe during 1998 to 2015. J Clin Microbiol. 2018; 56 (5): e01998-17. DOI: 10.1128/JCM.01998-17.
  19. Moosa F, du Plessis M, Weigand MR, Peng Y, Mogale D, de Gouveia L, et al. Genomic characterization of Bordetella pertussis in South Africa, 2015–2019. Microb Genom. 2023; 9 (12): 001162. DOI: 10.1099/mgen.0.001162.
  20. Fu P, Zhou J, Yang C, Nijiati Y, Zhou L, Yan G, et al. Molecular Evolution and Increasing Macrolide Resistance of Bordetella pertussis, Shanghai, China, 2016–2022. Emerg Infect Dis. 2023; 30 (1): 29–38. DOI: 10.3201/eid3001.221588.
  21. Weigand MR, Williams MM, Peng Y, Kania D, Pawloski LC, Tondella ML. Genomic Survey of Bordetella pertussis Diversity, United States, 2000–2013. Emerg Infect Dis. 2019; 25 (4): 780–3. DOI: 10.3201/eid2504.180812.
  22. Zomer A, Otsuka N, Hiramatsu Y, Kamachi K, Nishimura N, Ozaki T, et al. Bordetella pertussis population dynamics and phylogeny in Japan after adoption of acellular pertussis vaccines. Microb Genom. 2018; 4 (5): 000180. DOI: 10.1099/mgen.0.000180
  23. Mir-Cros A, Moreno-Mingorance A, Martín-Gómez MT, Codina G, Cornejo-Sánchez T, Rajadell M, et al. Population dynamics and antigenic drift of Bordetella pertussis following whole cell vaccine replacement, Barcelona, Spain, 1986– 2015. Emerg Microbes Infect. 2019; 8 (1): 1711–20. DOI: 10.1080/22221751.2019.1694395.
  24. Althouse BM, Scarpino SV. Asymptomatic transmission and the resurgence of Bordetella pertussis. BMC Med. 2015; 13: 146. DOI: 10.1186/s12916-015-0382-8.
  25. Mooi FR, van Loo IH, van Gent M, He Q, Bart MJ, Heuvelman KJ, et al. Bordetella pertussis strains with increased toxin production associated with pertussis resurgence. Emerg Infect Dis. 2009; 15 (8): 1206–13. DOI: 10.3201/eid1508.081511.
  26. Методические указания «Лабораторная диагностика коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами». МУК 4.2.3701-21. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. 2021.
  27. Mooi FR, Hallander H, Wirsing von König CH, Hoet B, Guiso N. Epidemiological Typing of Bordetella pertussis Isolates: Recommendations for a Standard Methodology. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2000; 19: 174–81.
  28. Gordana D, Teemu K, Annika E, Pljesa T, Vignjevic-Krastavcevic M, He Q. Bordetella pertussis vaccine strains and circulating isolates in Serbia Vaccine. 2010; 28 (5): 1188–92. DOI: 10.1016/j.vaccine.2009.11.036.
  29. Alai S, Ghattargi VC, Gautam M, Patel K, Pawar SP, Dhotre DP, et al. Comparative genomics of whole-cell pertussis vaccine strains from India. BMC Genomics. 2020; 21 (1): 345. DOI: 10.1186/s12864-020-6724-8.