
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Генетический полиморфизм области процессинга р105/р50 NF-kB1 при туберкулезе легких
Кемеровский государственный медицинский университет, Кемерово, Россия
Для корреспонденции: Алина Викторовна Мейер
ул. Ворошилова 22а, г. Кемерово, 650056, Россия; ur.xednay@anila-opahs
Финансирование: работа выполнена в рамках базового бюджетного источника финансирования работ государственного задания Минздрава РФ (Соглашение № 056-03-2023-050 от 17.01.2023).
Вклад авторов: А. В. Мейер, М. Б. Лавряшина — разработка концепции и дизайна исследования, подготовка и окончательное утверждение рукописи; Б. А. Тхоренко — генотипирование, статистический анализ, работа с базой данных; Д. О. Имекина — генотипирование, статистический анализ, техническое редактирование; А. П. Дутченко — поиск литературы, подготовка рукописи; Т. В. Пьянзова — организация исследования, сбор клинического и биологического материала, окончательное утверждение рукописи; К. Б. Карабчуков — сбор клинического анамнеза.
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом ФГБОУ ВО КемГМУ Минздрава России (протокол № 301 от 08 февраля 2023 г.), проведено согласно этическим принципам, изложенным в Хельсинкской декларации ВМА; от всех пациентов получено добровольное письменное согласие на участие.
Туберкулез легких (ТБ) — социально значимое заболевание, общемировая проблема здравоохранения. NF-kB-сигнальный путь вовлечен в дифференциальную экспрессию генов, задействованных в иммунных реакциях и регулирующих воспаление в ответ на инфицирование. Целью исследования было изучить ассоциации с ТБ аллельных вариантов гена NFKB1 по панели SNP (rs4648050, rs4648051, rs4648055, rs4648058, rs4648068, rs1609993), локализованных в зоне процессинга NF-kB1 р105→р50. Тотальную ДНК выделяли из образцов крови (метод фенол-хлороформной экстракции) пациентов, больных ТБ (n = 93), и группы популяционного контроля (n = 96) жителей Кемеровской области. Генотипирование проводили методом ПЦР в режиме реального времени, обработку результатов — с использованием ресурсов программ Statictica, SNPStats, Arlequin. Продемонстрированы этнические особенности (p < 0,05) русского населения Сибири (группа популяционного контроля) по частотам аллелей rs4648050 и rs4648051. Отмечено отличие (p < 0,05) генетического профиля выборки пациентов с туберкулезом легких от общемировой и европейской популяций по всему комплексу SNP, за исключением rs1609993. Показано различие (p < 0,05) аллельных частот rs4648068 между выборкой популяционного контроля и пациентов с туберкулезом легких. Установлена ассоциация с подверженностью туберкулезу легких для генотипов АА*rs4648055 (OR = 2,51; p = 0,05) и GG*rs4648068 (OR = 2,16; p = 0,03). Полученные результаты косвенно свидетельствуют о модифицирующем влиянии SNP, локализованных в зоне процессинга, в гене NFKB1 и его возможном вкладе в баланс белков NF-kB1 р105/р50 и иммунный ответ на микобактериальную инфекцию.
Ключевые слова: воспаление, генетический полиморфизм, туберкулез легких, NFKB1, транскрипционные факторы