Большая палитра фармакогенов выявлена при анализе континентальных массивов данных и характеризует население мира в целом. Но для локальных регионов не все ДНК-маркеры из общей палитры фармакогенов могут оказаться одинаково значимыми для фармакогенетики. Цель исследования — выявить регионально значимые фармакогены. Определены частоты 24 фармакогенов сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ, 1541 геном) и семи фармакогенов туберкулеза (ТБ, 1437 геномов) в коренном населении Центральной России. В анализ включены 19 популяций 10 этнических групп: башкир, коми-пермяков, марийцев, мишарей, татар казанских, удмуртов, чувашей, мокши, шокши и эрзи Мордовии, девять популяций русских. Созданы геногеографические карты распространения фармакогенов в регионе и проведен их картографо-статистический анализ методами главных компонент, генетических расстояний, корреляционного анализа. Показано, что из изученного массива фармакогенов лишь четверть ДНК-маркеров (пять ССЗ; два ТБ) играет ведущую роль в генетических основах лекарственного ответа ССЗ и ТБ в данном регионе. Выявлено полное отсутствие связи между распространением ДНК-маркеров ССЗ и ТБ (корреляция r = 0). Ведущим фактором для фармакогенов ССЗ оказалась история формирования генофондов народонаселения Центральной России. Этот вывод подтвержден максимально высокой корреляцией (r = 0,9) между ДНК-маркерами ССЗ и селективно-нейтральными ДНК-маркерами (цвет глаз, цвет волос, гаплогруппы Y-хромосомы), отражающими этногенез населения региона. Отсутствие закономерностей в распространении фармакогенов ТБ указывает на преобладание социальных и медико-санитарных факторов. При недостатке финансирования и невозможности выявить индивидуальные генотипы, фармакогенетика может ориентироваться на регионально значимые фармакогены.