ОБЗОР

Количественный и безошибочный анализ данных массированного секвенирования с использованием молекулярного баркодирования

Информация об авторах

1 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

2 Группа структурной организации Т-клеточного иммунитета, отдел геномики адаптивного иммунитета, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, Москва

Для корреспонденции: Дмитрий Михайлович Чудаков
117997, Москва, ул. Островитянова, д. 1; ur.liam@mdvokaduhc

Информация о статье

Финансирование: работа поддержана Российским научным фондом, грант №14-35-00105.

Статья получена: 28.09.2015 Статья принята к печати: 22.10.2015 Опубликовано online: 05.01.2017
|

За последние несколько лет технологии высокопроизводительного секвенирования (High Throughput Sequencing, HTS) прочно вошли в обиход современной биологии и медицины. Открылись принципиально новые возможности для секвенирования геномов и глубокого анализа различных ДНК- и РНК-библиотек. В то же время новые технологии содержат и новые подводные камни — ограничения в получении достоверной количественной и качественной информации при глубоком анализе сложных библиотек. Четкое понимание этих ограничений необходимо как для корректной интерпретации получаемой информации, так и для поиска технологических решений, позволяющих минимизировать их влияние. В обзоре мы показываем, как молекулярное баркодирование позволяет нормировать образцы и устранять ошибки полимеразной цепной реакции (ПЦР) и секвенирования при сохранении реального разнообразия библиотек в ходе HTS-анализа сложных библиотек.

Ключевые слова: высокопроизводительное секвенирование, молекулярное баркодирование, ДНК-библиотека, РНК-библиотека, анализ библиотек

КОММЕНТАРИИ (0)