ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Полиморфизм гена dtxR у современных штаммов Сorynebacterium diphtheriae
Информация об авторах
1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва
2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
Для корреспонденции: Андрей Викторович Чаплин
ул. Островитянова, д. 1, г. Москва, 117997; moc.liamg@kidemoloko
Информация о статье
Финансирование: исследование выполнено в рамках Отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора на 2016–2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями» по проектам № А16-116021550311-2 «Изучение роли микробиоценозов ротоглотки и крови человека при дифтерии, коклюше и других инфекционно-воспалительных заболеваниях» и № АААА-А16-116101810127-7 «Разработка молекулярно-генетических методов лабораторной диагностики дифтерии и коклюша».
Вклад авторов в работу: И. А. Чагина — анализ литературы, сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Ю. С. Переварова, В. В. Переваров — анализ литературы, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Д. А. Чаплин — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; О. Ю. Борисова — планирование исследования, сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Л. И. Кафарская — интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; С. С. Афанасьев, В. А. Алешкин — планирование исследования, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.
Статья получена: 02.02.2017
Статья принята к печати: 18.02.2017
Опубликовано online: 11.03.2017
|
Дендрограмма филогенетических взаимоотношений гена dtxR у штаммов С. diphtheriae
Дерево изображено в масштабе, с длинами ветвей в тех же эволюционных расстояниях, которые использовались для построения филогенетического дерева. Масштаб соответствует 0,1 замене на 200 п. н. Последователь- ности внутри групп полностью идентичны.
Таблица 1. Частота встречаемости замен нуклеотидов в гене dtxR у исследованных штаммов C. diphtheriae относительно штамма PW8
Таблица 2. Комбинации полиморфизмов гена dtxR у штаммов C. diphtheria
Примечание. * — совпадение нуклеотида; T, А — полиморфизм с заменой аминокислоты.
Таблица 3. Состав групп в соответствии с комбинацией полиморфизмов в гене dtxR у штаммов C. diphtheriae
Примечание. * — МЛСТ не проводили, ‒ — ST не обнаружен в базе данных.
