2017 / 04

Следующая статья
DOI: 10.24075/brsmu.2017-04-02

МЕТОД

Анализ соматических мутаций в генах RAS-каскада свободно циркулирущей ДНК плазмы крови пациентов с колоректальным раком методом усиленной аллель-специфической

Е. Н. Телышева, Г. П. Снигирева
Информация об авторах

Лаборатория молекулярной биологии и цитогенетики,
Российский научный центр рентгенорадиологии, Москва

Для корреспонденции: Снигирева Галина Петровна
ул. Профсоюзная, д. 86, г. Москва, 117997; ur.liam@lag_ins

Информация о статье

Благодарности: авторы благодарят Андрея Зарецкого из компании «Евроген» (Москва) за помощь и ценные советы при проведении молекулярно- генетического исследования.

Вклад авторов в работу: Е. Н. Телышева — анализ литературы, планирование исследования, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Г. П. Снигирева — планирование исследования, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи.

Статья получена: 08.08.2017 Статья принята к печати: 17.08.2017 Опубликовано online: 29.10.2017
|
  1. Зборовская И. Б. Современные стратегии исследования маркеров опухолевого роста в клинической практике. Успехи молекулярной онкологии. 2014; 2: 4–15. DOI: 10.17650/2313-805X.2014.1.2.4-15.
  2. Manne U, Jadhav T, Putcha BK. Molecular Biomarkers of Colorectal Cancer and Cancer Disparities: Current Status and Perspective. Curr Colorectal Cancer Rep. 2016; 12 (6): 332–44. DOI: 10.1007/s11888-016-0338-1.
  3. Overman MJ, Modak J, Kopetz S, Murthy R, Yao JC, Hicks ME et al. Use of research biopsies in clinical trials: Are risks and benefits adequately discussed? J Clin Oncol. 2013 Jan 1; 31 (1): 17–22. DOI: 10.1200/JCO.2012.43.1618.
  4. Gerlinger M, Rowan AJ, Horswell S, Math M, Larkin J, Endesfelder D et al. Intratumor heterogeneity and branched evolution revealed by multiregion sequencing. N Engl J Med. 2012 Mar 8; 366 (10): 883–92. DOI: 10.1056/NEJMoa1113205. Erratum in N Engl J Med. 2012 Sep 6; 367 (10): 976.
  5. Fleischhacker M, Schmidt B. Circulating nucleic acids (CNAs) and cancer – A survey. Biochim Biophys Acta. 2007 Jan; 1775 (1): 181–232. DOI: 10.1016/j.bbcan.2006.10.001.
  6. Gonzalez JA, Garcia-Olmo D, Garcia-Olmo DC. Circulating nucleic acids in plasma and serum (CNAPS): applications in oncology. OncoTargets Ther. 2013 Jul 8; 6: 819–32. DOI: 10.2147/OTT.S44668.
  7. Ma M, Zhu H, Zhang C, Sun X, Gao X, Chen G. “Liquid biopsy” – ctDNA detection with great potential and challenges. Ann Transl Med. 2015 Sep; 3 (16): 235. DOI: 10.3978/j.issn.2305-5839.2015.09.29.
  8. Diaz LA Jr, Bardelli A. Liquid Biopsies: Genotyping Circulating Tumor DNA. J Clin Oncol. 2014 Feb 20; 32 (6): 579–86. DOI: 10.1200/JCO.2012.45.2011.
  9. Beije N, Helmijr JC, Weerts MJA, Beaufort CM, Wiggin M, Marziali A et al. Somatic mutation detection using various targeted detection assays in paired samples of circulating tumor DNA, primary tumor and metastases from patients undergoing resection of colorectal liver metastases. Mol Oncol. 2016 Dec; 10 (10): 1575–84. DOI: 10.1016/j.molonc.2016.10.001.
  10. Diehl F, Schmidt K, Choti MA, Romans K, Goodman S, Li M et al. Circulating mutant DNA to assess tumor dynamics. Nat Med. 2008 Sep; 14 (9): 985–90. DOI: 10.1038/nm.1789.
  11. Holdhoff M, Schmidt K, Donehower R, Diaz LA. Analysis of circulating tumor DNA to confirm somatic KRAS mutations. J Natl Canc Inst. 2009; 101 (18): 1284-–5. DOI: 10.1093/jnci/djp240.
  12. Chen KZ, Lou F, Yang F, Zhang JB, Ye H, Chen W et al. Circulating tumor DNA detection in early-stage non-small cell-lung cancer patients by targeted sequencing. Sci Rep. 2016 Aug 24; 6: 31985. DOI: 10.1038/srep31985.
  13. Rachiglio AM, Abate RE, Sacco A, Pasquale R, Fenizia F, Lambiase M et al. Limits and potential of targeted sequencing analysis of liquid biopsy in patients with lung and colon carcinoma. Oncotarget. 2016 Oct 11; 7 (41): 66595–605. DOI: 10.18632/oncotarget.10704.
  14. Tu M, Chia D, Wei F, Wong D. Liquid biopsy for etection of actionable oncogenic mutations in human cancers and electric field induced release and measurement liquid biopsy (eLB). Analyst. 2016 Jan 4; 141 (2): 393–402. DOI: 10.1039/c5an01863c.
  15. Белоусова А. В., Дрозд О. В., Зарецкий А. Р. Мутационно-специфическая полимеразная цепная реакция для анализа мутаций в «горячих точках» генов K-Ras и B-Raf в биологических образцах онкологических больных. В сб.: Тезисы конференции «Современные принципы диагностики и лечения колоректального рака», посвященной памяти проф. В. И. Кныша; 26–27 мая 2011 г.; Москва. М.: 2011. с. 16.
  16. Телышева Е. Н. Идентификация молекулярно-генетических онкомаркеров с применением инвазивных и неинвазивных методов исследования. Поволжский онкологический вестник. 2014; 3: 60–4.
  17. Kim K, Shin DG, Park MK, Baik SH, Kim TH, Kim S et al. Circulating cell-free DNA as a promising biomarker in patients with gastric cancer: diagnostic validity and significant reduction of cfDNA after surgical resection. Ann Surg Treat Res. 2014 Mar; 86 (3): 136–42. DOI: 10.4174/astr.2014.86.3.136.
  18. Qin Z, Ljubimov VA, Zhou C, Tong Y, Liang J. Cell‑free circulating tumor DNA in cancer. Chin J Cancer. 2016 Apr 7; 35: 36. DOI: 10.1186/s40880-016-0092-4.
  19. Захаренко А. А., Зайцев Д. А., Беляев М. А., Трушин А. А., Тен О. А., Натха А. С. Возможности жидкой биопсии при раке желудка. Вопросы онкологии. 2016; 62 (4): 379–85.
  20. Тамкович С. Н., Власов В. В., Лактионов П. П. Циркулирующие ДНК крови и их использование в медицинской диагностике. Молекулярная биология. 2008; 42 (1): 12–23.
  21. Васильева И. Н., Беспалов В. Г. Роль внеклеточной ДНК в возникновении и развитии злокачественных опухолей и возможности ее использования в диагностике и лечении онкологических заболеваний. Вопросы онкологии. 2013; 59 (6): 673–81.
  22. Немцова М. В., Пальцева Е. М., Бабаян А. Ю., Михайленко Д. С., Бабенко О. В., Самофалова О. Ю. И др. Молекулярно-генетический анализ клональной внутриопухолевой гетерогенности в колоректальных карциномах. Молекулярная биология. 2008; 42 (6): 1040–7.