ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Определение частоты встречаемости мутаций в гене PAH с применением комбинации технологий ПЦР «в реальном времени» и высокопроизводительного секвенирования у больных фенилкетонурией Московского региона

А. И. Никифорова1, Д. Д. Абрамов1, В. В. Кадочникова1, Г. Ю. Зобкова1, К. А. Огурцова2, Н. О. Брюханова2, Е. А. Шестопалова2, Т. О. Кочеткова3, Е. С. Шубина, А. Е. Донников1, Д. Ю. Трофимов1
Информация об авторах

1 ООО «ДНК-Технология», Москва, Россия

2 Морозовская детская городская клиническая больница, Москва

3 Лаборатория молекулярно-генетических методов,
Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика
В. И. Кулакова, Москва

Для корреспонденции: Никифорова Алёна Игоревна
Каширское ш., д. 24, г. Москва, 115478; ur.ygolonhcet-and@avorofikin

Информация о статье

Вклад авторов в работу: А. И. Никифорова — планирование исследования, проведение NGS-секвенирования, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика и редактирование рукописи; Д. Д. Абрамов — планирование исследования, разработка диагностической панели, анализ и интерпретация данных, редактирование рукописи; В. В. Кадочникова — проведение ПЦР-исследования, анализ данных; Г. Ю. Зобкова — анализ литературы, интерпретация данных, редактирование рукописи; К. А. Огурцова, Н. О. Брюханова — сбор и анализ данных; Е. А. Шестопалова — планирование исследования, сбор и анализ данных, редактирование рукописи; Т. О. Кочеткова — проведение NGS-секвенирования, анализ данных; Е. С. Шубина — биоинформатический анализ данных, редактирование рукописи; А. Е. Донников — планирование исследования, интерпретация данных, редактирование рукописи; Д. Ю. Трофимов — планирование исследования, концепция и дизайн NGS-секвенирования.

Статья получена: 07.08.2017 Статья принята к печати: 16.08.2017 Опубликовано online: 30.10.2017
|
Кривые плавления для разных вариантов генотипа, полученные при определении мутации p.R408W\c.1222C>T. Кривые: 1 — гомозигота по мутации p.R408W\c.1222C>T; 2 — гетерозигота по мутации p.R408W\c.1222C>T, заметны характерные двойные пики на кривых плавления; 3 — гомозигота дикого типа
Таблица 1. Спектр и частоты встречаемости патогенных вариантов (мутаций) гена PAH среди пациентов Морозовской ДГКБ, n = 71
Примечание. КАТ — каталитический домен ФАГ, РЕГ — регуляторный, ТЕТ — тетрамеризующий.
Таблица 2. Результаты генотипирования пациентов Морозовской ДГКБ, n = 71
Примечание. Х — неустановленный патогенный вариант. * — приводится на основе данных базы BIOPKUdb [14].