2019 / 01

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2019.007

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Выявление мутации Ser450Leu в гене rpoB Mycobacterium tuberculosis методом аллель-специфичной изотермической петлевой амплификации ДНК

М. Л. Филипенко1, И. П. Оскорбин1, Е. А. Храпов1, Д. А. Шамовская1, А. Г. Чередниченко2, Я. Ш. Шварц2
Информация об авторах

1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, Россия

2 Новосибирский научно-исследовательский институт туберкулеза, Новосибирск, Россия

Для корреспонденции: Максим Леонидович Филипенко
Проспект академика Лаврентьева, д. 8/2, г. Новосибирск, 630090; moc.liamg@oknepiliflm

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при финансовой поддержке проекта базового бюджетного финансирования № VI.62.1.5 «Синтетическая биология: разработка средств манипуляции генетическим материалом и создание перспективных препаратов для терапии и диагностики» (0309-2018-0003).

Вклад авторов в работу: М. Л. Филипенко — общий замысел работы, планирование экспериментов, анализ результатов экспериментов, написание статьи; И. П. Оскорбин — написание статьи; Е. А. Храпов — проведение экспериментов; Д. В. Шамовская — проведение экспериментов; А. Г. Чередниченко — анализ результатов экспериментов; Я. Ш. Шварц — планирование и анализ результатов экспериментов.

Статья получена: 07.12.2018 Статья принята к печати: 25.02.2019 Опубликовано online: 09.03.2019
|
Рис. 1. Схематичное изображение разных принципов аллель-специфичной изотермической петлевой амплификации (AS-LAMP): аллель-специфичный праймер FIP (А), аллель-специфичный праймер F3 (Б)
Рис. 2. Кривые накопления флуоресценции продуктов AS-LAMP. Кривые, выделенные окружностями, соответствуют FIP-AS-LAMP, крестами — F3-AS-LAMP
Рис. 3. Выявление мутации TCG/TTG (S450L) гена rpoB методом AS-LAMP c визуализацией продуктов амплификации добавлением интеркалирующего красителя SYBR Green I при естественном освещении (А) и UV-освещении 280 нм (Б). Образцы 1, 4, 5 содержат мутацию, 2 и 3 — нет, их амплифицировали с праймером, специфичным для мутации, пробирки с «К» амплифицировали с праймером, специфичным для нормы
Таблица 1. Список олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченных зондов, использованных в работе
Таблица 2. Спектр выявленных с помощью секвенирования по Сенгеру мутаций гена rpoB у изолятов МТБ и результаты выявления мутации TCG/TTG (S450L) с помощью AS-LAMP