2019 / 06

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2019.084

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Мутант фототоксичного белка KillerRed, не формирующий DsRed-подобного хромофора

Д. А. Горбачев, К. С. Саркисян
Информация об авторах

Институт биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Карен Сергеевич Саркисян
ул. Миклухо-Маклая, 16/10, оф. 34/632, г. Москва, 117997; moc.liamg@naysikras.s.nerak

Информация о статье

Финансирование: работа не была бы опубликована без поддержки грантом РФФИ 18-04-01173 и грантом Президента РФ 075-15-2019-411. Исследования частично выполнены на оборудовании ЦКП ИБХ РАН.

Благодарности: авторы признательны Центру высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины (Москва) за помощь в методах исследования.

Вклад авторов в работу: К. С. Саркисян, Д. А. Горбачев — планирование проекта, проведение экспериментов, анализ данных, подготовка рукописи статьи. Вклад авторов в работу равнозначен на всех этапах.

Статья получена: 08.12.2019 Статья принята к печати: 18.12.2019 Опубликовано online: 20.12.2019
|
  1. Chudakov DM, Matz MV, Lukyanov S, Lukyanov KA. Fluorescent proteins and their applications in imaging living cells and tissues. Physiol Rev. 2010; (9)0: 1103–63. DOI:10.1152/ physrev.00038.2009/=.
  2. Bulina ME, Chudakov DM, Britanova OV, Yanushevich YG, Staroverov DB, Chepurnykh TV, et al. A genetically encoded photosensitizer. Nat Biotechnol. 2006; (24): 95–9. DOI:10.1038/ nbt1175.
  3. Pletneva NV, Pletnev VZ, Sarkisyan KS, Gorbachev DA, Egorov ES, Mishin AS, et al. Crystal Structure of Phototoxic Orange Fluorescent Proteins with a Tryptophan-Based Chromophore. PLoS One. 2015; (10): e0145740. DOI:10.1371/journal.pone.0145740.
  4. Pletnev S, Gurskaya NG, Pletneva NV, Lukyanov KA, Chudakov DM, Martynov VI, et al. Structural basis for phototoxicity of the genetically encoded photosensitizer KillerRed. J Biol Chem. 2009; (284): 32028–39. DOI:10.1074/jbc.M109.054973.
  5. Serebrovskaya EO, Gorodnicheva TV, Ermakova GV, Solovieva EA, Sharonov GV, Zagaynova EV, et al. Light-induced blockage of cell division with a chromatin-targeted phototoxic fluorescent protein. Biochem J. 2011; (435): 65–71. DOI:10.1042/BJ20101217.
  6. Lan L, Nakajima S, Wei L, Sun L, Hsieh C-L, Sobol RW, et al. Novel method for site-specific induction of oxidative DNA damage reveals differences in recruitment of repair proteins to heterochromatin and euchromatin. Nucleic Acids Res. 2014; (42): 2330–45. DOI:10.1093/nar/gkt1233.
  7. Shirmanova MV, Serebrovskaya EO, Lukyanov KA, Snopova LB, Sirotkina MA, Prodanetz NN, et al. Phototoxic effects of fluorescent protein KillerRed on tumor cells in mice. J Biophotonics. 2013; (6): 283–90. DOI:10.1002/jbio.201200056.
  8. Kuznetsova DS, Shirmanova MV, Dudenkova VV, Subochev PV, Turchin IV, Zagaynova EV, et al. Photobleaching and phototoxicity of KillerRed in tumor spheroids induced by continuous wave and pulsed laser illumination. J Biophotonics. 2015; 9999. DOI:10.1002/jbio.201400130.
  9. Yan L, Kanada M, Zhang J, Okazaki S, Terakawa S. Photodynamic Treatment of Tumor with Bacteria Expressing KillerRed. PLoS One. 2015; (10): e0131518. DOI:10.1371/journal.pone.0131518.
  10. Takemoto K, Matsuda T, Sakai N, Fu D, Noda M, Uchiyama S, et al. SuperNova, a monomeric photosensitizing fluorescent protein for chromophore-assisted light inactivation. Sci Rep. 2013; (3): 2629. DOI:10.1038/srep02629.
  11. Sarkisyan KS, Zlobovskaya OA, Gorbachev DA, Bozhanova NG, Sharonov GV, Staroverov DB, et al. KillerOrange, a Genetically Encoded Photosensitizer Activated by Blue and Green Light. PLoS One. 2015; (10): e0145287. DOI:10.1371/journal.pone.0145287.
  12. Riani YD, Matsuda T, Takemoto K, Nagai T. Green monomeric photosensitizing fluorescent protein for photo-inducible protein inactivation and cell ablation. BMC Biol. 2018; (16): 50. DOI:10.1186/s12915-018-0514-7.
  13. Shu X, Lev-Ram V, Deerinck TJ, Qi Y, Ramko EB, Davidson MW, et al. A genetically encoded tag for correlated light and electron microscopy of intact cells, tissues, and organisms. PLoS Biol. 2011; (9): e1001041. DOI:10.1371/journal.pbio.1001041.
  14. Torra J, Burgos-Caminal A, Endres S, Wingen M, Drepper T, Gensch T, et al. Singlet oxygen photosensitisation by the fluorescent protein Pp2FbFP L30M, a novel derivative of Pseudomonas putida flavin-binding Pp2FbFP. Photochem Photobiol Sci. 2015; (14): 280–7. DOI:10.1039/c4pp00338a.
  15. Acharya A, Bogdanov AM, Grigorenko BL, Bravaya KB, Nemukhin AV, Lukyanov KA, et al. Photoinduced Chemistry in Fluorescent Proteins: Curse or Blessing? Chem Rev. 2017; (117): 758–95. DOI:10.1021/acs.chemrev.6b00238.
  16. Alieva NO, Konzen KA, Field SF, Meleshkevitch EA, Hunt ME, Beltran-Ramirez V, et al. Diversity and evolution of coral fluorescent proteins. PLoS One. 2008; (3): e2680. DOI:10.1371/journal. pone.0002680.