ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Устойчивость карбапенемрезистентных штаммов Klebsiella pneumoniae к колистину: молекулярные механизмы и бактериальный фитнес

О. В. Шамина1, О. А. Крыжановская1, А. В. Лазарева1, Н. М. Алябьева1, Н. А. Маянский2
Информация об авторах

1 Национальный медицинский исследовательский центр здоровья детей, Москва, Россия

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Ольга Вячеславовна Шамина
Ломоносовский проспект, д. 2, стр. 1, г. Москва, 119991; ur.xobni@animahs.aglo

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено при поддержке гранта Российского научного фонда (проект № 20-15-00235).

Благодарности: авторы благодарят С. В. Поликарпову из Городской клинической больницы № 15 имени О. М. Филатова и О. В. Карасеву из Научно- исследовательского института неотложной детской хирургии и травматологии за предоставление изолятов K. pneumoniae.

Вклад авторов: О. В. Шамина — планирование и проведение исследования, анализ литературы, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка текста публикации; О. А. Крыжановская, А. В. Лазарева, Н. М. Алябьева — планирование и проведение исследования; Н. А. Маянский — научное руководство, планирование и проведение исследования, анализ литературы, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка и редактирование рукописи.

Статья получена: 18.05.2020 Статья принята к печати: 02.06.2020 Опубликовано online: 12.06.2020
|
Рис. 1. Типичные кривые роста изолятов K. pneumoniae в среде без колистина. Заштрихованная область — площадь под кривой роста (ПКР). Красная линия — кривая роста кол-Ч-изолята; зеленая линия — кривая роста кол-Р-изолята
Рис. 2. Репрезентативный эксперимент по оценке конкурентоспособности колистинрезистентных K. Pneumoniae. Кол-Ч — колистинчувствительные; кол-Р — колистинрезистентные; кол-Ч /кол-Р — смесь колистинчувствительных и колистинрезистентных изолятов; КОЕ — колониеобразующие единицы. Фотографии чашек Петри демонстрируют характер роста кол-Ч-изолятов (А, Г), кол-Р-изолятов (Б, Д) и смеси кол-Р / кол-Ч-изолятов (В, Е) K. pneumoniae на агаре LB без колистина (АВ) и агаре LB с содержанием 10 мг/л колистина (ГЕ). Цифры указывают число КОЕ на каждой чашке. Индекс конкурентоспособности (ИК) рассчитан как число КОЕ на LB + колистин / (число КОЕ на LB — число КОЕ на LB + колистин), т. е. КОЕ «Е» / (КОЕ «В» — КОЕ «Е»)
Таблица 1. Генотипы, фенотип и механизмы устойчивости к колистину у карба-Р-изолятов K. Pneumoniae (n = 26)
Примечание: ST — сиквенс-тип; МПК — минимальная подавляющая концентрация; а — в скобках указана нуклеотидная позиция встраивания вставочного элемента; б — изменения PmrB (T157P); в — изменения PmrA (A141T) и PmrB (L213M, G256R); г — изменения PmrB (делеция 27–30 (QLIS)).
Таблица 2. Влияние устойчивости к колистину на бактериальный фитнес (кинетику роста и индекс конкуренции) карба-Р-изолятов K. Pneumonia
Примечание: МПК — минимальная подавляющая концентрация; ПКР — площадь под кривой роста; Ме — медиана; Р25 и Р75 — 25-й и 75-й перцентили; ИК — индекс конкуренции; СО — стандартное отклонение; кол-Ч — колистинчувствительные; кол-Р — колистинрезистентные; НП — не применимо; ар = 0,842 при сравнении с ПКР кол-Ч-изолятов; бр = 0,19 при сравнении с ПКР кол-Р-изолятов при концентрации колистина 0 мг/л; вр = 0,016 при сравнении с ПКР кол-Р-изолятов при концентрации колистина 0 мг/л; гр < 0,001 при сравнении с ПКР кол-Р-изолятов при концентрации колистина 0 мг/л; д — р > 0,05 при сравнении с ПКР кол-Р-изолятов с поврежденным mgrB; еn = 26; жn = 11; зn = 15; иp = 0,283 при сравнении с ИК кол-Р-изолятов с поврежденным mgrB.
Таблица 3. Индекс конкуренции кол-Р- и кол-Ч-изолятов карба-Р K. Pneumoniae одинаковых сиквенс-типов
Примечание: ИК — индекс конкуренции; СО — стандартное отклонение.