2020 / 05

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.064

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Микробиота эякулята: кластерный анализ результатов, полученных при исследовании методом ПЦР-РВ

Е. С. Ворошилина1,2, Д. Л. Зорников1, А. В. Иванов3,4, Д. Г. Почерников5, Е. А. Паначева1,2
Информация об авторах

1 Уральский государственный медицинский университет, Екатеринбург, Россия

2 Медицинский центр «Гармония», Екатеринбург, Россия

3 Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б. Н. Ельцина, Екатеринбург, Россия

4 Институт математики и механики имени Н. Н. Красовского Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, Россия

5 Ивановская государственная медицинская академия, Иваново, Россия

Для корреспонденции: Екатерина Сергеевна Ворошилина
ул. Фурманова, д. 30, г. Екатеринбург, 620142; moc.liamg@anilihsorov

Информация о статье

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Уральского государственного медицинского университета (протокол № 7 от 20 сентября 2019 г.). Все участники исследования подписали добровольное информированное согласие на проведение исследования.

Благодарности: авторы благодарят директора медицинского центра «Гармония» (г. Екатеринбург) В. Н. Хаютина за возможность выполнения исследования на базе центра.

Вклад авторов: Е. С. Ворошилина — организация исследования, анализ данных, написание статьи; Д. Л. Зорников — анализ данных, написание статьи; А. В. Иванов — статистическая обработка, анализ данных, написание статьи; Д. Г. Почерников — клиническая характеристика пациентов, сбор клинических данных, анализ данных, написание статьи; Е. А. Паначева — анализ литературы, проведение ПЦР, анализ данных, написание статьи.

Статья получена: 21.09.2020 Статья принята к печати: 09.10.2020 Опубликовано online: 28.10.2020
|
Рис. 1. Результаты кластерного анализа микробиоты эякулята, исследованного методом ПЦР-РВ (n = 350). По оси ординат приведены значения признаков в центроиде. Красными прямоугольниками обведены диаграммы размаха преобладающих групп микроорганизмов. Кластер 1 (n = 172; рис. А) характеризуется преобладанием облигатных анаэробов, кластер 2 (n = 78; рис. Б) — преобладанием Lactobacillus spp., кластер 3 (n = 62; рис. В) — преобладанием грамположительных факультативных анаэробов, кластер 4 (n = 38; рис. Г) — преобладанием Enterobacteriaceae spp. / Enterococcus spp.
Рис. 1 (окончание). Результаты кластерного анализа микробиоты эякулята, исследованного методом ПЦР-РВ (n = 350). По оси ординат приведены значения признаков в центроиде. Красными прямоугольниками обведены диаграммы размаха преобладающих групп микроорганизмов. Кластер 1 (n = 172; рис. А) характеризуется преобладанием облигатных анаэробов, кластер 2 (n = 78; рис. Б) — преобладанием Lactobacillus spp., кластер 3 (n = 62; рис. В) — преобладанием грамположительных факультативных анаэробов, кластер 4 (n = 38; рис. Г) — преобладанием Enterobacteriaceae spp. / Enterococcus spp.
Рис. 2. Результаты исследования устойчивости кластеров 1 (А), 2 (Б), 3 (В) и 4 (Г). Серым цветом обозначен индекс устойчивости кластера на случайной подвыборке, красным — медиана индексов устойчивости, рассчитанная на 1000 случайных подвыборках объема ƒ, синим — индекс устойчивости кластера на множестве объема ƒ
Таблица 1. Частота выявления отдельных групп МО в надпороговых значениях (n = 634)*
Примечание: * — для групп Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Mycoplasma hominis надпороговые значения > 0, для остальных групп МО ≥ 103 ГЭ/мл
Таблица 2. Значения показателей качества кластеризации