ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Микробиота эякулята: кластерный анализ результатов, полученных при исследовании методом ПЦР-РВ
1 Уральский государственный медицинский университет, Екатеринбург, Россия
2 Медицинский центр «Гармония», Екатеринбург, Россия
3 Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б. Н. Ельцина, Екатеринбург, Россия
4 Институт математики и механики имени Н. Н. Красовского Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, Россия
5 Ивановская государственная медицинская академия, Иваново, Россия
Для корреспонденции: Екатерина Сергеевна Ворошилина
ул. Фурманова, д. 30, г. Екатеринбург, 620142; moc.liamg@anilihsorov
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Уральского государственного медицинского университета (протокол № 7 от 20 сентября 2019 г.). Все участники исследования подписали добровольное информированное согласие на проведение исследования.
Благодарности: авторы благодарят директора медицинского центра «Гармония» (г. Екатеринбург) В. Н. Хаютина за возможность выполнения исследования на базе центра.
Вклад авторов: Е. С. Ворошилина — организация исследования, анализ данных, написание статьи; Д. Л. Зорников — анализ данных, написание статьи; А. В. Иванов — статистическая обработка, анализ данных, написание статьи; Д. Г. Почерников — клиническая характеристика пациентов, сбор клинических данных, анализ данных, написание статьи; Е. А. Паначева — анализ литературы, проведение ПЦР, анализ данных, написание статьи.
Микробиота эякулята до сих пор недостаточно изучена, а клиническая значимость выявления отдельных групп микроорганизмов окончательно не установлена. Целью работы было провести кластерный анализ микробиоты эякулята, выявленной методом ПЦР-РВ. Исследовали 634 образца эякулята мужчин репродуктивного возраста. Микробную ДНК в количестве не менее 103 ГЭ/мл обнаружили в 460 (72,5%) образцов. В 350 (55,2%) пробах выявили от 1 до 14 групп микроорганизмов в надпороговых значениях (частота выявления отдельных групп составила 3,3–21,0%). Среди 350 образцов выделили четыре устойчивых кластера микробиоты, в каждом из которых преобладала определенная группа микроорганизмов: облигатных анаэробов (кластер 1, n = 172; частота выявления — 49,1%), Lactobacillus spp. (кластер 2, n = 78; частота выявления — 22,3%) грамположительных факультативных анаэробов (кластер 3, n = 62; частота выявления — 17,7%), Enterobacteriaceae/Enterococcoccus (кластер 4, n = 38; частота выявления — 10,9%). Кластер 1 характеризовался меньшей устойчивостью и большим видовым разнообразием в сравнении с другими кластерами.
Ключевые слова: кластерный анализ, ПЦР-РВ, микробиота эякулята, спермограмма