ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Взаимодействие генофондов русского и финноязычного населения Тверской области: анализ 4 млн SNP-маркеров

Информация об авторах

1 Институт общей генетики имени Н. И. Вавилова, Москва, Россия

2 Медико-генетический научный центр, Москва, Россия

3 Биобанк Северной Евразии, Москва, Россия

4 Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины, Москва, Россия

Для корреспонденции: Олег Павлович Балановский
ул. Губкина, д. 3, г. Москва, 119991; ur.xobni@yksvonalab

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено при финансовой поддержке Министерства науки и образования РФ (Госконтракт # 011–17 от 26.09.2017) в рамках научно-технической программы Союзного государства «ДНК-идентификация» (работы по генотипированию), Государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ для Медико-генетического научного центра им. Н. П. Бочкова (биоинформатический анализ данных), гранта Российского фонда фундаментальных исследований № 20-09-00479 а (анализ генеалогической информации, интерпретация результатов, написание текста).

Благодарности: мы благодарим всех доноров образцов, которые принимали участие в данном исследовании, АНО «Биобанк Северной Евразии» за предоставление коллекций ДНК и члена-корреспондента РАН В. В. Напольских за консультации при интерпретации результатов.

Статья получена: 10.10.2020 Статья принята к печати: 27.10.2020 Опубликовано online: 25.11.2020
|

Генофонды популяций Тверской области (русских и карел) изучены по широкогеномной панели из 4 млн аутосомных SNP-маркеров, типированной на суммарной выборке из 41 образца. Эти данные по популяции тверских карел (n = 11) и русских из западных, центральных и восточных районов Тверской области (n = 30) проанализированы на широком фоне русских популяций соседних областей, карел Карелии и других популяций Северо-Восточной Европы с целью изучения феномена взаимопроникновения генофондов славянского и финноязычного населения. Такое изучение генофондов населения России по наиболее обширной из существующих широкогеномных панелей важно для каталогизации геномного разнообразия населения России и характеристики региональных генофондов и имеет практическое применение в фармакогеномике и судебной медицине. Методами главных компонент, ADMIXTURE, d- и f3-статистик показано, что генофонд тверских карел, несмотря на их проживание среди преобладающего русского населения в течение 3–5 веков и 20-кратное сокращение численности в течение последнего столетия, сохраняет наибольшую близость к генофонду карел Карелии. Но при этом генофонд тверских карел более сходен с русским генофондом, чем генофонд других карельских популяций. Сближение генофондов русских и карел Тверской области происходит за счет более интенсивного потока генов от русских к карелам и при малозаметном потоке генов от карел к русским: тверские русские оказались столь же генетически отличны от карел, как, например, псковские. Сходство тверских карел с карелами Карелии по аутосомным маркерам (при небольшом смещении в сторону русского генофонда) согласуется с опубликованными данными по Y-хромосоме (отсутствие детектированного смешения тверских карел с русскими).

Ключевые слова: генофонд, широкогеномные панели, SNP-маркер, чип Illumina, карелы, русские, Тверская область, центральная Россия

КОММЕНТАРИИ (0)