Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Новый вирулентный бактериофаг Klebsiella pneumoniae KPPK108.1, инфицирующий штаммы серотипа K108
1 Институт биохимии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Москва, Россия
2 Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия
3 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
4 Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, Москва, Россия
Для корреспонденции: Михаил Маркович Шнейдер
ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10, г. Москва, 117997, Россия; ur.liam@nhs_mm
Финансирование: работа выполнена при финансовой поддержке Министерства здравоохранения Российской Федерации (ЕГИСУ НИОКТР № 121052800048-3).
Благодарности: авторы благодарят Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины РНИМУ им. Н. И. Пирогова за консультации по методической части исследования.
Вклад авторов: Д. А. Шагин — концептуализация, руководство исследованием, редактирование рукописи; П. В. Евсеев, А. А. Шеленков — формальный анализ данных секвенирования, редактирование рукописи; М. М. Шнейдер — методология, руководство исследованием; Ю. В. Михайлова — секвенирование, валидация данных; Ю. Г. Янушевич, А. Моисеенко, М. Г. Карлова — методология; О. С. Соколова — электронная микроскопия, методология.
Мультирезистентные штаммы Klebsiella pneumoniae являются одной из самых серьезных причин внутрибольничных инфекций, вызванных бактериями, устойчивыми к антибиотикам. Существуют различные варианты борьбы с этой угрозой, один из них — клиническое использование бактериофагов. Целью работы было выделить и детально охарактеризовать вирулентный бактриофаг, имеющий потенциал для терапевтического применения. Использовали стандартные методы фаговой биологии, биоинформатики, включая современные способы предсказания белковых структур (программа AlphaFold), электронную микроскопию. Из образцов сточных вод был выделен вирулентный подовирус KPPK108.1, относящийся к роду Drulisvirus, специфично инфицирующий штаммы K. pneumoniae, имеющие капсулярный полисахарид типа KL108, определена последовательность его генома, исследованы его биологические свойства и дана генетическая характеристика.
Ключевые слова: бактериофаг, Klebsiella pneumoniae, деполимераза, капсулярный полисахарид