2022 / 06

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2022.059

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Роль генетических маркеров лекарственной устойчивости mef и ermB при подборе доноров фекальной микробиоты

А. В. Господарик1, Л. А. Улаханова1, С. С. Есиев1, Е. В. Полякова1, Я. Д. Шанский1, Ю. А. Беспятых1,2,3
Информация об авторах

1 Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины имени Ю. М. Лопухина Федерального медико-биологического агентства, Москва, Россия

2 Российский химико-технологический университет имени Д. И. Менделеева, Москва, Россия

3 Национальный научно-исследовательский институт общественного здоровья имени Н. А. Семашко, Москва, Россия

Для корреспонденции: Алина Владимировна Господарик
Красногорское шоссе, д. 15, г. Одинцово, Московская обл., 143007, Россия; gro.mcpcr@kiradopsog.anila

Информация о статье

Финансирование: Грант АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении» (№ 2412-31).

Вклад авторов: А. В. Господарик — подбор участников исследования, анализ биологических образцов методом ПЦР, анализ литературы, написание статьи; Л. А. Улаханова — анализ литературы, написание статьи, бактериологический посев кала, бактериологический анализ; С. С. Есиев — анализ литературы, выделение нуклеиновых кислот из биологических образцов; Е. В. Полякова — практическая часть бактериологического анализа, выделение нуклеиновых кислот из биологических образцов; Я. Д. Шанский — статистическая обработка данных; Ю. А. Беспятых — концепция исследования, консультирование, написание и редактирование статьи.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России (протокол номер 2022/05/31 от 31 мая 2022 г.). Добровольное информированное согласие подписано всеми участниками исследования.

Статья получена: 20.10.2022 Статья принята к печати: 25.11.2022 Опубликовано online: 16.12.2022
|
  1. Cammarota G, Ianiro G, Tilg H, Rajilić-Stojanović M, Kump P, Satokari R, et al. European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. 2017; 66 (4): 569–80. DOI: 10.1136/gutjnl-2016-313017.
  2. Baunwall SMD, Lee MM, Eriksen MK, Mullish BH, Marchesi JR, Dahlerup JF, et al. Faecal microbiota transplantation for recurrent Clostridioides difficile infection: An updated systematic review and meta-analysis. EClinicalMedicine. 2020; 23: 29–30. PMID: 33437951; PMCID: PMC7788438. DOI: 10.1016/j.eclinm.2020.100642.
  3. Wang Y, Zhang S, Borody T, Zhang F. Encyclopedia of fecal microbiota transplantation: a review of effectiveness in the treatment of 85 diseases. Chinese Medical Journal. 2022; 10.1097/CM9.0000000000002339 DOI: 10.1097/ CM9.0000000000002339.
  4. Surawicz CM, Brandt LJ, Binion DG, Ananthakrishnan AN, Curry SR, Gilligan PH, et al. Guidelines for diagnosis, treatment, and prevention of Clostridium difficile infections. Am J Gastroenterol. 2013; 108 (4): 478–98.
  5. Debast SB, Bauer MP, Kuijper EJ, European Society of Clinical M, Infectious D: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases: update of the treatment guidance document for Clostridium difficile infection. Clin Microbiol Infect. 2014; 20 (Suppl 2): 1–26.
  6. Enforcement Policy Regarding Investigational New Drug Requirements for Use of Fecal Microbiota for Transplantation to Treat Clostridium difficile Infection Not Responsive to Standard Therapies. 2013; www.fdagov.
  7. Щербаков П. Л., Белова Н. Д., Генерозов Э. В., Жгун Е. С., Иванова О. И., Ильина Е. Н. и др. Применение фекальной трансплантации в лечении заболеваний пищеварительного тракта (первый клинический опыт). Доктор.Ру. 2019; 3 (158): 40–46. DOI: 10.31550/1727-2378-2019-158-3-40-46.
  8. Якупова А. А., Абдулхаков С. Р., Сафин А. Г., Алиева И. М., Ослопова Ю. В., Абдулхаков Р. А. Трансплантация фекальной микробиоты: критерии выбора донора, подготовки и хранения биоматериала (обзор современных рекомендаций). Терапевтический архив. 2021; 93 (2): 215–21. DOI: 10.26442/0 0403660.2021.02.200615.
  9. Эйдельштейн М. В. Экстремально- и панрезистентные клоны бактериальных возбудителей в клинике. Тезисы докладов ежегодной Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП-2015)», 25 ноября 2015, Москва Журнал МедиАль. 2015; 3 (17).
  10. Туркутюков В. Б. Молекулярно-генетический мониторинг резистентности микроорганизмов к антибиотикам. Тихоокеанский медицинский журнал. 2011; 2 (44): 28–31.
  11. Zhuangab M, Achmonab Y, Cao Y, Liang X, Chen L, Wange H, et. al. Distribution of antibiotic resistance genes in the environment. Environmental Pollution. 2021; 285. Article 117402. DOI. org/10.1016/j.envpol.2021.117402.
  12. Roberts MC. Environmental macrolide–lincosamide–streptogramin and tetracycline resistant bacteria Front. Microbiol. 2011. Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2011.00040.
  13. Катосова Л. К., Лазарева А. В., Хохлова Т. А., Пономаренко О. А., Алябьева Н. М. Распространение и механизмы устойчивости к макролидам Streptococcus pyogenes, выделенных у детей. Антибиотики и химиотерапия. 2016; 61 (3–4): 23–29.
  14. Farrell DJ, Morrissey I, Bakker S, Morris L, Buckridge S, Felmingham D. Molecular epidemiology of multiresistant Streptococcus pneumoniae with both erm(B)- and mef(A)mediated macrolide resistance. J Clin Microbiol. 2004; 42 (2): 764–8. DOI: 10.1128/JCM.42.2.764–768.2004. PMID: 14766850; PMCID: PMC344484.
  15. Reinert RR, Ringelstein A, van der Linden M, Cil MY, Al-Lahham A, Schmitz FJ. Molecular epidemiology of macrolide-resistant Streptococcus pneumoniae isolates in Europe. J Clin Microbiol. 2005; 43 (3): 1294–300. DOI: 10.1128/JCM.43.3.12941300.2005. PMID: 15750098; PMCID: PMC1081259.
  16. Икрянникова Л. Н., Сенина М. Е., Лисицина Е. С., Огородова Л. М., Федосенко С. В., Карнаушкина М. А. и др. Видовая идентификация и анализ генетических маркеров лекарственной устойчивости стрептококков с помощью количественной мультиплексной полимеразной цепной реакции у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких. Пульмонология. 2014; (6): 40–48. Доступно по ссылке: https://doi.org/10.18093/0869-0189-2014-0-6-40-48.
  17. Федосенко С. В., Огородова Л. М., Ильина Е. Н., Сенина М. Е., Лисицина Е. С., Карнаушкина М. А. и др. Генетические детерминанты устойчивости орофарингеальных стрептококков к антибактериальным средствам у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких и больных бронхиальной астмой. Терапевтический архив. 2015; 87 (8): 51–57. DOI: 10.17116/terarkh201587851-57.
  18. Gosalbes MJ, Vallès Y, Jiménez-Hernández N, Balle C, Riva P, Miravet-Verde S, et al. High frequencies of antibiotic resistance genes in infants’ meconium and early fecal samples. J Dev Orig Health Dis. 2016; 7: 35–44. DOI: 10.1017/S2040174415001506.
  19. Эпштейн-Литвак Р. В., Вильшанская Ф. Л. Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника. Методические рекомендации. М., 1977; 20 с.
  20. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника: ОСТ 91500.11.0004-2003. Приказ Минздрава России № 231 от 09.06.03. (Отраслевой стандарт).
  21. U.S. Food and Drug Administration. Information pertaining to additional safety protections regarding use of fecal microbiota for transplantation — screening and testing of stool donors for multidrug resistant organisms. 2019. Available from: https://www. fda.gov/vaccines-blood-biologics/safety-availability-biologics/ information-pertaining-additional-safety-protections-regardinguse-fecal-microbiota-transplantation.
  22. Klassert TE, Zubiria-Barrera C, Kankel S, Stock M, Neubert R, Lorenzo-Diaz F, et.al. Early Bacterial Colonization and Antibiotic Resistance Gene Acquisition in Newborns. Front Cell Infect Microbiol. 2020; 10: 332. DOI: 10.3389/fcimb.2020.00332. PMID: 32754449; PMCID: PMC7366792.
  23. Zhang K, Jin M, Yang D, Shen Z, Liu W, Yin J, et al. Antibiotic resistance genes in gut of breast-fed neonates born by caesarean section originate from breast milk and hospital ward air. BMC Microbiol 22. 2022; 36. DOI: org/10.1186/s12866-022-02447-8.
  24. Huang MS, Cheng CC, Tseng SY, Lin YL, Lo HM, Chen PW. Most commensally bacterial strains in human milk of healthy mothers display multiple antibiotic resistance. Microbiology Open. 2019; 8 (1): e00618 doi.org/10.1002/mbo3.618.
  25. Carvalho MJ, Sands K, Thomson, Portal KE, Mathias J, Milton R, et al. Antibiotic resistance genes in the gut microbiota of mothers and linked neonates with or without sepsis from low- and middleincome countries. Nat Microbiol. 2022; 7: 1337–47. Available from: doi.org/10.1038/s41564-022-01184-y.