ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
Вестник РГМУ
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Генетическая характеристика штамма Aerococcus sp. 1KP-2016, выделенного от пациента с инфекцией кровотока
Информация об авторах
1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва, Россия
2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
Для корреспонденции: Андрей Викторович Чаплин
ул. Адмирала Макарова, д. 10, г. Москва, 125212, Россия; moc.liamg@kidemoloko
Информация о статье
Вклад авторов: А. В. Чаплин — филогенетический анализ, анализ данных, подготовка рукописи; И. А. Чагина, А. С. Пименова, Н. Т. Гадуа — микробиологические исследования, подготовка рукописи; Н. М. Каргальцева, Л. И. Кафарская — анализ литературы, подготовка рукописи; О. Ю. Борисова — молекулярно-генетические исследования, анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; Е. Е. Донских — анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи.
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом ФБУН МНИИЭМ им. Г. Н. Габричевского Роспотребнадзора (протокол № 28 от 18 ноября 2014 г.); от пациента получено добровольное письменное согласие на участие в исследовании
Статья получена: 22.03.2023
Статья принята к печати: 16.04.2023
Опубликовано online: 25.04.2023
|
Бактерии рода Aerococcus часто ассоциированы с инфекциями мочевыводящих путей и кровотока у человека. Штамм Aerococcus sp. 1KP-2016, выделенный из лейкоцитарного слоя крови, обладал последовательностью 16S рРНК, совпадающей на 98,7% и менее с ранее описанными представителями данного рода. Целью работы было провести полногеномное секвенирование Aerococcus 1KP-2016 с последующей филогенетической реконструкцией. Показано, что Aerococcus 1KP-2016 является представителем нового вида рода Aerococcus, наиболее близкого к Aerococcus viridans и Aerococcus urinaeequi. Геномная последовательность, имеющая длину 2,042 млн п.н. и GC-состав 38,5%, депонирована в DBJ/EMBL/GenBank под идентификатором NEEY00000000.
Ключевые слова: филогенетический анализ, Aerococcus, инфекция кровотока, лейкоцитарный слой крови, полногемномное секвенирование