Диагностика микобактериальной коинфекции — одна из актуальных проблем здравоохранения. Целью исследования было определить дискриминирующую способность метода мультиплексной ПЦР видовой идентификации при выявлении смешанных популяций микобактерий. Исследование выполнено на модельных образцах, представляющих собой смесь ДНК микобактерий двух видов в соотношении 1 : 1, 1 : 9, 1 : 99 и 1 : 999 с разной суммарной концентрацией ДНК (от 10³ ГЭ/мл до 10⁶ ГЭ/мл). Модельные образцы исследовали набором «Амплитуб-РВ-дифференциация» («Синтол»; Россия), основанном на мультиплексной ПЦР. Показано, что набор способен выявлять смеси видов микобактерий с высокой дискриминирующей способностью. Дискриминирующая способность метода ПЦР в режиме реального времени при анализе смеси ДНК двух видов микобактерий зависела от суммарного содержания ДНК в образце и варьировала от 0,1% для высоконагруженных образцов (суммарная концентрация ДНК × 10⁶ ГЭ/мл) до 50% для низконагруженных образцов (суммарная концентрация ДНК × 10³ ГЭ/мл) и соответствовала количеству ДНК вида в смеси не менее 5 × 10² ГЭ/мл. При количестве ДНК каждого вида в смеси не менее 5 × 10² ГЭ/мл результат ПЦР на выявление коинфекции не зависел от вида микобактерий, входящих в смесь, что необходимо учитывать при анализе результатов ПЦР.