Авторские права: © 2024 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Штаммы Mycobacterium tuberculosis с мутациями в gyrA различаются по уровню конкурентного фитнеса

Информация об авторах

1 Центральный научно-исследовательский институт туберкулеза, Москва, Россия

2 Московский государственный медико-стоматологический университет имени А. И. Евдокимова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Софья Николаевна Андреевская
Яузская аллея, д. 2 стр. 1А, г. Москва, 107564, Россия; ur.liam@aifosdna

Информация о статье

Финансирование: исследование проведено в рамках выполнения работ по Государственному заданию ФГБНУ "ЦНИИТ" № НИОКТР 122041100246-3 «Межвидовой и внутривидовой полиморфизм микобактерий у больных туберкулезом и микобактериозом на фоне специфической терапии».

Вклад авторов: Л. Н. Черноусова, А. Эргешов — разработка дизайна исследования; В. В. Устинова, Е. А. Киселева — проведение эксперимента; Т. Г. Смирнова — проведение эксперимента, анализ полученных данных; Е. Е. Ларионова — анализ полученных данных; Э. В. Севастьянова — обзор публикаций по теме исследования; С. Н. Андреевская — анализ полученных данных, написание рукописи.

Статья получена: 05.11.2024 Статья принята к печати: 29.11.2024 Опубликовано online: 19.12.2024
|
  1. Eldholm V, Balloux F. Antimicrobial Resistance in Mycobacterium tuberculosis: The Odd One Out. Trends Microbiol. 2016; 24 (8): 637–48.
  2. O'Neill MB, Mortimer TD, Pepperell CS. Diversity of Mycobacterium tuberculosis across Evolutionary Scales. PLoS Pathog. 2015; 11 (11): e1005257.
  3. Vargas R, Freschi L, Marin M, Epperson LE, Smith M, Oussenko I, et al. In-host population dynamics of Mycobacterium tuberculosis complex during active disease. Elife. 2021; 10: e61805.
  4. McIvor A, Koornhof H, Kana BD. Relapse, re-infection and mixed infections in tuberculosis disease. Pathog Dis. 2017; 75 (3).
  5. Ye M, Yuan W, Molaeipour L, Azizian K, Ahmadi A, Kouhsari E. Antibiotic heteroresistance in Mycobacterium tuberculosis isolates: a systematic review and meta-analysis. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2021; 20 (1): 73.
  6. Zetola NM, Shin SS, Tumedi KA, Moeti K, Ncube R, Nicol M et al. Mixed Mycobacterium tuberculosis complex infections and false-negative results for rifampin resistance by GeneXpert MTB/RIF are associated with poor clinical outcomes. J Clin Microbiol. 2014; 52 (7): 2422–9.
  7. Andersson DI, Nicoloff H, Hjort K. Mechanisms and clinical relevance of bacterial heteroresistance. Nat Rev Microbiol. 2019; 17 (8): 479–96.
  8. Ford C, Yusim K, Ioerger T, Feng S, Chase M, Greene M, et al. Mycobacterium tuberculosis–heterogeneity revealed through whole genome sequencing. Tuberculosis (Edinb). 2012; 92 (3): 194–201.
  9. Chen J, Huang F, Yin X, Gu D. Assessments of Different Methods for Testing Heteroresistance to Rifampicin in Tubercle Bacillus. J Nanosci Nanotechnol. 2018; 18 (12): 8414–8.
  10. Chen L, Zhang J, Zhang H. Heteroresistance of Mycobacterium tuberculosis Strains May Be Associated More Strongly With Poor Treatment Outcomes Than Within-Host Heterogeneity of M. tuberculosis Infection. J Infect Dis. 2016; 214 (8): 1286–7.
  11. Rigouts L, Miotto P, Schats M, Lempens P, Cabibbe AM, Galbiati S, et al. Fluoroquinolone heteroresistance in Mycobacterium tuberculosis: detection by genotypic and phenotypic assays in experimentally mixed populations. Sci Rep. 2019; 9 (1): 11760.
  12. Global tuberculosis report 2023. Geneva: World Health Organization, 2023; 75 p.
  13. Huo F, Ma Y, Li S, Xue Y, Shang Y, Dong L, et al. Specific gyrA gene mutations correlate with high prevalence of discordant levofloxacin resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates from Beijing, China. J Mol Diagn. 2020; 22 (9): 1199–204.
  14. WHO consolidated guidelines on drug-resistant tuberculosis treatment. Geneva: World Health Organization, 2019; 104 p.
  15. Nahid P, Mase SR, Migliori GB, Sotgiu G, Bothamley GH, Brozek JL, et al. Treatment of Drug-Resistant Tuberculosis. An Official ATS/CDC/ERS/IDSA Clinical Practice Guideline. Am J Respir Crit Care Med. 2019; 200 (10): e93–e142.
  16. Jouet A, Gaudin C, Badalato N, Allix-Béguec C, Duthoy S, Ferré A, et al. Deep amplicon sequencing for culture-free prediction of susceptibility or resistance to 13 anti-tuberculous drugs. Eur Respir J. 2021; 57 (3): 2002338.
  17. Zhang X, Zhao B, Liu L, Zhu Y, Zhao Y, Jin Q. Subpopulation analysis of heteroresistance to fluoroquinolone in Mycobacterium tuberculosis isolates from Beijing, China. J Clin Microbiol. 2012; 50 (4): 1471–4.
  18. Campbell PJ, Morlock GP, Sikes RD, Dalton TL, Metchock B, Starks AM, et al. Molecular detection of mutations associated with first- and second-line drug resistance compared with conventional drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob Agents Chemother. 2011; 55 (5): 2032–41.
  19. Baffoe-Bonnie A, Houpt ER, Turner L, Dodge D, Heysell SK. Drug-Susceptible and Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis in a Single Patient. Emerg Infect Dis. 2019; 25 (11): 2120–1.
  20. Андреевская С. Н., Смирнова Т. Г., Черноусова Л. Н., Ларионова Е. Е., Киселева Е. А., Эргешов А. Особенности генотипической резистентности к фторхинолонам у Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Российской Федерации. Вестник РГМУ. 2022; (5): 23–31.
  21. Kodio O, Georges Togo AC, Sadio Sarro YD, Fane B, Diallo F, Somboro A. et al. Competitive fitness of Mycobacterium tuberculosis in vitro. Int J Mycobacteriol. 2019; 8 (3): 287–91.
  22. Алешина Е. С., Дроздова Е. А., Романенко Н. А. Культивирование микроорганизмов как основа биотехнологического процесса: учебное пособие. Оренбург: ООО ИПК «Университет», 2017; 191 с.
  23. Gagneux S, Long CD, Small PM, Van T, Schoolnik GK, Bohannan BJ. The competitive cost of antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis. Science. 2006; 312 (5782): 1944–6.
  24. Peddireddy V, Doddam SN, Ahmed N. Mycobacterial Dormancy Systems and Host Responses in Tuberculosis. Front Immunol. 2017; 8: 84.
  25. An Q, Lin R, Yang Q, Wang C, Wang D. Evaluation of genetic mutations associated with phenotypic resistance to fluoroquinolones, bedaquiline, and linezolid in clinical Mycobacterium tuberculosis: A systematic review and metaanalysis. J Glob Antimicrob Resist. 2023; 34: 214–26.
  26. Chan RC, Hui M, Chan EW, Au TK, Chin ML, Yip CK, et al. Genetic and phenotypic characterization of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Hong Kong. J Antimicrob Chemother 2007; 59 (5): 866–73.
  27. Casali N, Nikolayevskyy V, Balabanova Y, Harris SR, Ignatyeva O, Kontsevaya I, et al. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population. Nat Genet. 2014; 46 (3): 279–86.
  28. Gomez JE, McKinney JD. M. tuberculosis persistence, latency, and drug tolerance. Tuberculosis (Edinb). 2004; 84 (1–2): 29–44.
  29. Mitchison DA, Coates AR. Predictive in vitro models of the sterilizing activity of anti-tuberculosis drugs. Curr Pharm Des. 2004; 10 (26): 3285–95.