Метод сканирующей электронной микроскопии (СЭМ) в настоящее время позволяет анализировать поверхности различных материалов, в том числе эукариотических клеток. Способность клеток различных тканей организма прикрепляться и расти на поверхности материалов для имплантации служит важной характеристикой их биосовместимости. СЭМ позволяет напрямую визуализировать характер контакта клеток с поверхностью. Однако методика подготовки проб к анализу традиционно требует высокой степени обезвоживания образца и применения токсичного тетраоксида осмия. Целью работы было провести оптимизацию методики подготовки животных клеток, растущих на поверхности биокерамических образцов, к анализу с помощью СЭМ. В работе предложена методика подготовки мезенхимальных стволовых клеток жировой ткани человека, выращенных на поверхности трех типов биокерамических образцов, к анализу с помощью СЭМ. Она включает фиксацию с помощью альдегида, спиртовое обезвоживание, подкрашивание красителем Гимзы и высушивание с последующим напылением золота. Предложен также алгоритм поиска прикрепленных клеток на поверхности пористого и шероховатого материала. Данный подход позволяет быстро подготовить клетки к СЭМ-анализу без использования высокотоксичных реагентов.