Замершая беременность относится к числу наиболее распространенных форм ранних репродуктивных потерь и остается актуальной проблемой акушерства и гинекологии. Несмотря на достижения в области репродуктивной медицины, молекулярные механизмы, лежащие в основе прекращения развития эмбриона на ранних сроках гестации, изучены недостаточно. Целью сравнительного одноцентрового исследования было оценить уровень экспрессии генов TGF-β и MMP-9 в периферической крови женщин с физиологической и замершей беременностью и определить их потенциальную прогностическую значимость при оценке риска ранних репродуктивных потерь. В исследование были включены 40 беременных женщин: 20 пациенток с физиологически протекающей беременностью сроком 9–11 недель (контрольная группа) и 20 женщин с диагнозом замершей беременности (основная группа). Уровень экспрессии генов TGF-β и MMP-9 определяли методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени после выделения тотальной РНК из периферической крови. Для статистической обработки результатов использовали критерий Манна‒Уитни и ROC-анализ. Статистически значимых различий между исследуемыми группами по уровням экспрессии генов TGF-β и MMP-9 выявлено не было. Вместе с тем ROC-анализ позволил определить пороговые значения исследуемых показателей, обладающие определенной диагностической информативностью. Для MMP-9 наиболее информативным оказалось значение Ct ≤ 29, обеспечивающее чувствительность 80% и специфичность 60%. Для TGF-β пороговое значение Ct ≤ 27,4 характеризовалось чувствительностью 75% и специфичностью 70%. Полученные результаты свидетельствуют о потенциальной прогностической значимости исследуемых генов при оценке риска замершей беременности.