ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
МЕТОД
Нокдаун генов с использованием малых интерферирующих РНК
Информация об авторах
1 Лаборатория функциональной геномики,Медико-генетический научный центр, Москва
2 Лаборатория медицинских генетических технологий, отдел фундаментальных исследований НИМСИ,Московский государственный медико-стоматологический университет имени А. И. Евдокимова, Москва
3 Лаборатория функционального анализа генома,Московский физико-технический институт (государственный университет), Долгопрудный
Для корреспонденции: Скоблов Михаил Юрьевич
ул. Москворечье, д. 1, Москва, 115478; moc.liamg@volboksm
Информация о статье
Вклад авторов в работу: Ю. В. Вяхирева — анализ литературы, планирование исследования, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; А. Ю. Филатова — анализ литературы, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; И. А. Кривошеева — анализ литературы, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; М. Ю. Скоблов — подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.
Статья получена: 25.06.2017
Статья принята к печати: 28.06.2017
Опубликовано online: 19.07.2017
|
Рис. 2. График анализа значений детектируемых ∆∆Ct для разных эффективностей трансфекции при различной эффективности нокдауна
Рис. 3. Пример электрофореза качественно выделенных из лизата РНК. 1 — полоса, соответствующая 28S рРНК, 2 — полоса, соответствующая 18S рРНК
Рис. 4. Пример гистограммы, составляемой по итогам анализа результатов ПЦР в режиме «реального времени»
Рис. 5. Пример результатов МТТ-теста при нокдауне гена HOXA7 (Tang и соавт. [55])
Таблица 1. Правила позиционирования нуклеотидов в составе siРНК. AS — антисмысловая цепь siРНК, S — смысловая цепь siРНК. Серые клетки обозначают позиции нуклеотидов в последовательности siРНК (Lagana и соавт., [26])
Таблица 3. Схема проведения эксперимента по оптимизации трансфекции в 96-луночном формате
Таблица 4. Расчет количества siРНК и реагента Metafectene для разных видов планшетов на одну трансфекцию (протокол производителя Metafectene [42])
