Рис. 1. Схема получения библиотек кДНК Т-клеточных рецепторов (T-cell receptors, TCR). Свитч-адаптер содержит уникальную последовательность, обозначенную на рисунке штрих-кодом. Наличие молекулярного баркода позволяет производить коррекцию ошибок, как в упрощенном виде показано на последнем этапе. Амплифицированный фрагмент содержит последовательность CDR3 бета-цепи TCR, которая определяет разнообразие рецепторов

Рис. 2. Доля наивных Т-клеток среди CD3⁺-лимфоцитов периферической крови и разнообразие репертуаров бета-цепей Т-клеточных рецепторов (T-cell receptors, TCR) у пациентов с аутоиммунными васкулитами, получавшими терапию циклофосфамидом в высоких дозах (синие точки), и здоровых людей (оранжевые точки). (А) Доля наивных Т-клеток в общем пуле CD3⁺-лимфоцитов. Точки нанесены на график с учетом возраста участников исследования. (Б) Разнообразие TCR, оцененное по индексу Chao1. Основной вклад в значение индекса вносят клоны с низкой встречаемостью, т. е. преимущественно TCR наивных Т-лимфоцитов. (В) Разнообразие вариантов последовательности CDR3 на 25 000 случайных молекул кДНК бета-цепей TCR. (Г) Разнообразие бета-цепей TCR, оцененное по индексу Шеннона–Винера. Важно равномерное распределение клонотипов в репертуаре TCR. (Д) Доля наивных Т-клеток в общем пуле CD3⁺-лимфоцитов с учетом значений индекса Chao1. (Е) Количество «публичных» клонотипов в клонсетах в зависимости от возраста донора. Для (Б–Е) произведены расчеты на 25 000 произвольно выбранных молекул кДНК бета-цепей TCR