ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Исследование долгосрочного эффекта высоких доз циклофосфамида на репертуар Т-клеточных рецепторов T-лимфоцитов периферической крови у пациентов с аутоиммунными васкулитами

Информация об авторах

1 Группа структурной организации Т-клеточного иммунитета, отдел геномики адаптивного иммунитета, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, Москва

2 Первый Московский государственный медицинский университет имени И. М. Сеченова (Сеченовский Университет), Москва

Для корреспонденции: Ольга Владимировна Британова
ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10, г. Москва, 117997; moc.liamg@natirblo

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке Российского научного фонда, грант № 16-15-00149. В исследовании было использовано оборудование Центра коллективного пользования ИБХ РАН, поддержанного Министерством образования и науки России, идентификатор соглашения — RFMEFI62117X0018.

Вклад всех авторов в работу равнозначен: подбор и анализ литературы, планирование исследования, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи, внесение исправлений.

Статья получена: 04.10.2017 Статья принята к печати: 25.10.2017 Опубликовано online: 14.01.2018
|
  1. Brodsky RA. High dose cyclophosphamide treatment for autoimmune disorders. ScientificWorldJournal. 2002 Jun 28; 2: 1808–15. DOI: 10.1100/tsw.2002.863.
  2. DeZern AE, Styler MJ, Drachman DB, Hummers LK, Jones RJ, Brodsky RA Repeated treatment with high dose cyclophosphamide for severe autoimmune diseases. Am J Blood Res. 2013; 3 (1): 84–90.
  3. Gladstone DE, Golightly MG, Brannagan TH 3rd. High dose cyclophosphamide preferentially targets naïve T (CD45/CD4/RA+) cells in CIDP and MS patients. J Neuroimmunol. 2007 Oct; 190 (1–2): 121–6. DOI: 10.1016/j.jneuroim.2007.07.005.
  4. Britanova OV, Shugay M, Merzlyak EM, Staroverov DB, Putintseva EV, Turchaninova MA et al. Dynamics of Individual T Cell Repertoires: From Cord Blood to Centenarians. J Immunol. 2016 Jun 15; 196 (12): 5005–13. DOI: 10.4049/jimmunol.1600005.
  5. Wilde B, Thewissen M, Damoiseaux J, van Paassen P, Witzke O, Tervaert JWC. T cells in ANCA-associated vasculitis: what can we learn from lesional versus circulating T cells? Arthritis Res Ther. 2010; 12 (1): 204. DOI: 10.1186/ar2923.
  6. McKinney EF, Willcocks LC, Broecker V, Smith KGC. The immunopathology of ANCA-associated vasculitis. Semin Immunopathol. 2014 Jul; 36 (4): 461–78. DOI: 10.1007/s00281-014-0436-6.
  7. Giscombe R, Wang XB, Kakoulidou M, Lefvert AK. Characterization of the expanded T-cell populations in patients with Wegener's granulomatosis. J Intern Med. 2006 Sep; 260 (3): 224–30. DOI: 10.1111/j.1365-2796.2006.01688.x.
  8. Ruth AJ, Kitching AR, Kwan RY, Odobasic D, Ooi JD, Timoshanko J et al. Anti-neutrophil cytoplasmic antibodies and effector CD4+ cells play nonredundant roles in anti-myeloperoxidase crescentic glomerulonephritis. J Am Soc Nephrol. 2006 Jul; 17 (7): 1940–9. DOI: 10.1681/ASN.2006020108.
  9. Kanakry CG, Ganguly S, Zahurak M, Bolaños-Meade J, Thoburn C, Perkins B et al. Aldehyde dehydrogenase expression drives human regulatory T cell resistance to posttransplantation cyclophosphamide. Sci Transl Med. 2013 Nov 13; 5 (211): 211ra157. DOI: 10.1126/scitranslmed.3006960.
  10. Kanakry CG, Coffey DG, Towlerton AM, Vulic A, Storer BE, Chou J et al. Origin and evolution of the T cell repertoire after posttransplantation cyclophosphamide. JCI Insight. 2016; 1 (5): e86252. DOI: 10.1172/jci.insight.86252.
  11. Britanova OV, Putintseva EV, Shugay M, Merzlyak EM, Turchaninova MA, Staroverov DB et al. Age-related decrease in TCR repertoire diversity measured with deep and normalized sequence profiling. J Immunol. 2014 Mar 15; 192 (6): 2689–98. PubMed PMID:24510963 doi: 10.4049/jimmunol.1302064.
  12. Shugay M, Britanova OV, Merzlyak EM, Turchaninova MA, Mamedov IZ, Tuganbaev TR et al. Towards error-free profiling of immune repertoires. Nat Methods. 2014 Jun; 11 (6): 653–5. DOI: 10.1038/nmeth.2960.
  13. Shugay M, Bagaev DV, Turchaninova MA, Bolotin DA, Britanova OV, Putintseva EV et al. VD Jtools: Unifying Post-analysis of T Cell Receptor Repertoires. PLoS Comput Biol. 2015 Nov 25; 11 (11): e1004503. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004503.
  14. Bolotin DA, Poslavsky S, Mitrophanov I, Shugay M, Mamedov I, Putintseva E et al. MiXCR: software for comprehensive adaptive immunity profiling. Nat Methods. 2015 May; 12 (5): 380–1. DOI: 10.1038/nmeth.3364.
  15. 15. Egorov ES, Merzlyak EM, Shelenkov AA, Britanova OV, Sharonov GV, Staroverov DB et al. Quantitative profiling of immune repertoires for minor lymphocyte counts using unique molecular identifiers. J Immunol. 2015; 194 (12): 6155–63. DOI: 10.4049/jimmunol.1500215.
  16. Pogorelyy MV, Elhanati Y, Marcou Q, Sycheva AL, Komech EA, Nazarov VI et al. Persisting fetal clonotypes influence the structure and overlap of adult human T cell receptor repertoires. PLoS Comput Biol. 2017 Jul 6; 13 (7): e1005572. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005572.
  17. Grunewald J, Halapi E, Wahlström J, Giscombe R, Nityanand S, Sanjeevi C et al. T-cell expansions with conserved T-cell receptor beta chain motifs in the peripheral blood of HLA-DRB1*0401 positive patients with necrotizing vasculitis. Blood. 1998; 92 (10): 3737–44.
  18. Müschen M, Warskulat U, Perniok A, Even J, Moers C, Kismet B et al. Involvement of Soluble CD95 in Churg-Strauss Syndrome. Am J Pathol. 1999 Sep; 155 (3): 915–25. DOI: 10.1016/S0002-9440(1)65191-7.
  19. Link CS, Eugster A, Heidenreich F, Rücker-Braun E, Schmiedgen M, Oelschlägel U et al. Abundant cytomegalovirus (CMV) reactive clonotypes in the CD8+ T cell receptor alpha repertoire following allogeneic transplantation. Clin Exp Immunol. 2016 Jun; 184 (3): 389–402. DOI: 10.1111/cei.12770.
  20. Ruggiero E, Nicolay JP, Fronza R, Arens A, Paruzynski A, Nowrouzi A et al. High-resolution analysis of the human T-cell receptor repertoire. Nat Commun. 2015 Sep 1; 6: 8081. DOI: 10.1038/ncomms9081.
  21. Faham M, Carlton V, Moorhead M, Zheng J, Klinger M, Pepin F et al. Discovery of T Cell Receptor β Motifs Specific to HLA-B27-Positive Ankylosing Spondylitis by Deep Repertoire Sequence Analysis. Arthritis Rheumatol. 2017 Apr; 69 (4): 774–84. DOI: 10.1002/art.40028.
  22. Komech Е, Zvyagin I, Shmidt E, Klimenko A, Shostak N, Mamedov I, Lebedev Y. Shared T-cell clones are found in synovial fluid of patients with ankylosing spondylitis. In: Abstract book of 12th EJI-EFIS Tatra Immunology Conference; 2016 Sep 3–7; Strbske Pleso, Slovakia. p. 39.
  23. Guida G, Vallario A, Stella S, Boita M, Circosta P, Mariani S et al. Clonal CD8+ TCR-Vbeta expanded populations with effector memory phenotype in Churg Strauss syndrome. Clin Immunol. 2008 Jul; 128 (1): 94–102. DOI: 10.1016/j.clim.2008.03.505.