2020 / 02

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.015

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Характеристика генотипа и фенотипа нетоксигенных штаммов Corynebacterium diphtheriae subsp. lausannense, выделенных на территории России

О. Ю. Борисова1,2, А. В. Чаплин1,2, Н. Т. Гадуа1, А. С. Пименова1, И. Н. Алексеева3, Г. Ф. Ракицкий3, С. С. Афанасьев1, Е. Е. Донских2, Л. И. Кафарская2
Информация об авторах

1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва, Россия

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

3 Краевая клиническая психиатрическая больница, Хабаровск, Россия

Для корреспонденции: Ольга Юрьевна Борисова
ул. Адмирала Макарова, д. 10, г. Москва, 125212; ur.liam@avosirobglo

Информация о статье

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского. Все пациентки подписали добровольное информированное согласие на участие в исследовании.

Вклад авторов: О. Ю. Борисова — молекулярно-генетические исследования, анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; А. В. Чаплин — филогенетический анализ, анализ данных, подготовка рукописи; Н. Т. Гадуа и А. С. Пименова — микробиологические исследования, подготовка рукописи; И. Н. Алексеева и Г. Ф. Ракицкий — обследование пациентов и первичная идентификация, подготовка рукописи; С. С. Афанасьев — молекулярно-генетические исследования, подготовка рукописи; Е. Е. Донских — анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; Л. И. Кафарская — анализ данных, подготовка рукописи.

Статья получена: 09.02.2020 Статья принята к печати: 28.03.2020 Опубликовано online: 18.03.2020
|
Рис. 1. Филогенетическое древо, построенное на основе штаммов С. diphtheriae с публично доступными просеквенированными геномами. Длины ветвей и использованный для укоренения геном C. ulcerans BR-AD22 не отображены. Числа на ветвях отображают уровни локальной поддержки. Серым цветом обозначены штаммы C. diphtheriae subsp. lausannense. Числа в скобках обозначают предсказанные сиквенс-типы по номенклатуре PubMLST (прочерки соответствуют неописанным сиквенс-типам)
Рис. 2. Клональный комплекс, реконструированный на основе данных PubMLST, к которому относятся штаммы подвида lausannense с публично доступными просеквенированными геномами
Рис. 3. Пример гель-электрофореза результатов ПЦР с праймерами ptsI_F — ptsI_R и narG_F — narG_R. М — маркер молекулярных весов ДНК GeneRuler 100 bp DNA Ladder (Thermo Fisher Scientific; США)
Рис. 4. Сахаролитическая активность штаммов C. diphtheriae subsp. lausannense — способность сбраживать N-aцетилглюкозамин. Положительный результат соответствует окрашиванию среды в малиновый цвет. 1, 2 — выделенные штаммы C. diphtheriae subsp. lausannense; 3 — штамм C. diphtheriae subsp. diphtheriae биовара gravis; 4 — штамм C. diphtheriae subsp. diphtheriae биовара mitis; 5 — отрицательный контроль
Таблица. Характеристика исследованных культур C. diphtheriae