2020 / 02

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2020.015

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Характеристика генотипа и фенотипа нетоксигенных штаммов Corynebacterium diphtheriae subsp. lausannense, выделенных на территории России

О. Ю. Борисова1,2, А. В. Чаплин1,2, Н. Т. Гадуа1, А. С. Пименова1, И. Н. Алексеева3, Г. Ф. Ракицкий3, С. С. Афанасьев1, Е. Е. Донских2, Л. И. Кафарская2
Информация об авторах

1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва, Россия

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

3 Краевая клиническая психиатрическая больница, Хабаровск, Россия

Для корреспонденции: Ольга Юрьевна Борисова
ул. Адмирала Макарова, д. 10, г. Москва, 125212; ur.liam@avosirobglo

Информация о статье

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Московского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского. Все пациентки подписали добровольное информированное согласие на участие в исследовании.

Вклад авторов: О. Ю. Борисова — молекулярно-генетические исследования, анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; А. В. Чаплин — филогенетический анализ, анализ данных, подготовка рукописи; Н. Т. Гадуа и А. С. Пименова — микробиологические исследования, подготовка рукописи; И. Н. Алексеева и Г. Ф. Ракицкий — обследование пациентов и первичная идентификация, подготовка рукописи; С. С. Афанасьев — молекулярно-генетические исследования, подготовка рукописи; Е. Е. Донских — анализ данных, анализ литературы, подготовка рукописи; Л. И. Кафарская — анализ данных, подготовка рукописи.

Статья получена: 09.02.2020 Статья принята к печати: 28.03.2020 Опубликовано online: 18.03.2020
|
  1. World Health Organization. Diphtheria reported cases. Available from: http://apps.who.int/immunization_monitoring/ globalsummary/timeseries/tsincidencediphtheria.html.
  2. Якимова Т. Н., Маркина С. С., Максимова Н. М. Дифтерия сегодня. ЗНиСО. 2013; 249 (12): 18–9.
  3. О заболеваемости дифтерией и состоянии антитоксического противодифтерийного иммунитета населения России. Информационное письмо № 02/14390-2019-27 от 10.10.2019. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор). Russian.
  4. Romney MG, Roscoe DL, Bernard K, Lai S, Efstratiou A, Clarke AM. Emergence of an invasive clone of nontoxigenic Corynebacterium diphtheriae in the urban poor population of Vancouver, Canada. J Clin Microbiol. 2006 May; 44 (5): 1625–9.
  5. Hirata J, Pereira GA, Filardy AA, Gomes DLR, Damasco PV, Rosa ACP, et al. Potential pathogenic role of aggregative-adhering Corynebacterium diphtheriae of different clonal groups in endocarditis. Brazilian J Med Biol Res. 2008; 41 (11): 986–91.
  6. Gubler J, Huber-Schneider C, Gruner E, Altwegg M. An Outbreak of Nontoxigenic Corynebacterium diphtheriae Infection: Single Bacterial Clone Causing Invasive Infection Among Swiss Drug Users. Clin Infect Dis. 1998 Nov; 27 (5): 1295–8.
  7. FitzGerald RP, Rosser AJ, Perera DN. Non-toxigenic penicillin-resistant cutaneous C. diphtheriae infection: A case report and review of the literature. J Infect Public Health. 2015 Jan 1; 8 (1): 98–100.
  8. Edwards B, Hunt AC, Hoskisson PA. Recent cases of non-toxigenic Corynebacterium diphtheriae in Scotland: Justification for continued surveillance. Journal of Medical Microbiology. 2011; (60): 561–2.
  9. Funke G, Von Graevenitz A, Clarridge JE, Bernard KA. Clinical microbiology of Coryneform bacteria. Clinical Microbiology Reviews. 1997; (10): 125–59.
  10. Bernard KA, Funke G. Corynebacterium. In: Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. Chichester, UK: John Wiley & Sons, Ltd, 2015; p. 1–70.
  11. Trost E, Blom J, de Soares SC, Huang IH, Al-Dilaimi A, Schröder J, et al. Pangenomic study of Corynebacterium diphtheriae that provides insights into the genomic diversity of pathogenic isolates from cases of classical diphtheria, endocarditis, and pneumonia. J Bacteriol. 2012; 194 (12): 3199–215.
  12. Sangal V, Burkovski A, Hunt AC, Edwards B, Blom J, Hoskisson PA. A lack of genetic basis for biovar differentiation in clinically important Corynebacterium diphtheriae from whole genome sequencing. Infect Genet Evol. 2014; 21 (November): 54–7.
  13. Sangal V, Hoskisson PA. Evolution, epidemiology and diversity of Corynebacterium diphtheriae: New perspectives on an old foe. Infect Genet Evol. 2016; (43): 364–70.
  14. Bolt F, Cassiday P, Tondella ML, DeZoysa A, Efstratiou A, Sing A, et al. Multilocus Sequence Typing Identifies Evidence for Recombination and Two Distinct Lineages of Corynebacterium diphtheriae. J Clin Microbiol. 2010; 48 (11): 4177–85.
  15. Tagini F, Pillonel T, Croxatto A, Bertelli C, Koutsokera A, Lovis A, et al. Distinct genomic features characterize two clades of Corynebacterium diphtheriae: Proposal of Corynebacterium diphtheriae Subsp. diphtheriae Subsp. nov. and Corynebacterium diphtheriae Subsp. lausannense Subsp. nov. Front Microbiol. 2018 Aug 17; (9): 1743.
  16. Li L, Stoeckert CJ, Roos DS. OrthoMCL: identification of ortholog groups for eukaryotic genomes. Genome Res. 2003; 13 (9): 2178–89.
  17. Edgar RC. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Res. 2004; 32 (5): 1792–7.
  18. Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2 — Approximately maximum-likelihood trees for large alignments. PLoS One. 2010 Mar 10; 5 (3).
  19. Nascimento M, Sousa A, Ramirez M, Francisco AP, Carriço JA, Vaz C. PHYLOViZ 2.0: Providing scalable data integration and visualization for multiple phylogenetic inference methods. Bioinformatics. 2017; 33 (1): 128–9.
  20. Nakao H, Mazurova IK, Glushkevich T, Popovic T. Analysis of heterogeneity of Corynebacterium diphtheriae toxin gene, tox, and its regulatory element, dtxR, by direct sequencing. Res Microbiol. 1997; 148 (1): 45–54.
  21. Chagina IA, Perevarova YuS, Perevarov VV, Chaplin AV, Borisova OYu, Kafarskaya LI, et al. Polymorphism of the dtxR gene in the currently existing strains of Сorynebacterium diphtheriae. Bulletin of RSMU. 2017; (1): 31–37.
  22. Farfour E, Badell E, Dinu S, Guillot S, Guiso N. Microbiological changes and diversity in autochthonous non-toxigenic Corynebacterium diphtheriae isolated in France. Clin Microbiol Infect. 2013; 19 (10): 980–7.