В последние годы благодаря внедрению метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) значительно расширился спектр микроорганизмов, выявляемых в мочеполовом тракте мужчин, детализировано представление о структуре бактериальных компонентов микробиома. Одной из наименее изученных групп микроорганизмов остается Lactobacillus spp. При ведении пациентов с репродуктивными нарушениями авторами накоплен клинический опыт, демонстрирующий возможную взаимосвязь изменения уровня половых гормонов и основных показателей спермограммы с наличием Lactobacillus spp. в эякуляте. Целью работы было сравнить уровни лютеинизирующего гормона, фолликулостимулирующего гормона, тестостерона, эстрадиола, пролактина, прогестерона, а также глобулина, связывающего половые гормоны (ГСПГ), в сыворотке крови и изменения показателей спермограммы у 210 мужчин при выявлении в эякуляте Lactobacillus spp. и при их отсутствии. В основную группу были включены 105 мужчин, в эякуляте которых по данным ПЦР-РВ выявлены Lactobacillus spp. в количестве (Lg) ≥ 103. Контрольная группа включала 105 мужчин, у которых отсутствовали Lactobacillus spp. и структура бактериального компонента микробиома эякулята соответствовала норме. В основной группе по сравнению с контрольной у мужчин чаще встречались гормональные нарушения: отклонение от нормы уровней трех и более гормонов (р = 0,04), гиперэстрадиолемия (р = 0,05) и повышение уровня ГСПГ (р = 0,01). Установлено, что наличие Lactobacillus spp. в эякуляте мужчин основной группы ассоциировано с олигоастенотератозооспермией (р < 0,01), со снижением концентрации сперматозоидов (р = 0,01), с ухудшением их подвижности (р < 0,01) и нарушением морфологии (р < 0,01). Таким образом, присутствие в эякуляте Lactobacillus spp. может служить дополнительным маркером нарушения гормонального фона и фертильности у мужчин.