ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Избирательное изменение экспрессии α-субъединиц интегринов в клетках кишечного эпителия Caco-2 при гипоксии в условиях микроциркуляции
Информация об авторах
1 Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», Москва, Россия
2 Art photonics GmbH, Берлин, Германия
Для корреспонденции: Диана Васильевна Мальцева
ул. Вавилова, д. 7, г. Москва, 117321; moc.liamg@avestlamd
Информация о статье
Финансирование: результаты получены при финансовой поддержке Российской Федерации в лице Министерства образования и науки. Уникальный идентификатор проекта RFMEFI61719X0056.
Благодарности: авторы выражают благодарность Центру коллективного пользования «Протеом человека» (ИБМХ) за возможность использования оборудования для анализа протеома, Центру высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины РНИМУ им. Н. И. Пирогова (Москва, Россия) за возможность использования молекулярно-генетических технологий.
Вклад авторов: Д. В. Мальцева — работа с культурой клеток, молекулярно-биологические исследования, анализ данных, подготовка рукописи статьи; А. А. Полозников — обработка данных протеомного и транскриптомного анализа, биоинформатический анализ, функциональный анализ генов, статистический анализ, подготовка рукописи статьи, организация исследования; В. Г. Артюшенко — обсуждение результатов исследования, рецензирование рукописи статьи.
Соблюдение этических стандартов: исследование проведено в соответствии с требованиями Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации.
Статья получена: 09.11.2020
Статья принята к печати: 01.12.2020
Опубликовано online: 17.12.2020
|
Рис. 1. Эквивалентная электрическая схема, использованная для вычисления основных электрических параметров монослоя клеток
Рис. 2. Результаты оценки жизнеспособности клеток Caco-2 после 96 ч культивирования в мембранных вставках без покрытия белками, покрытых коллагеном IV и ламинином 332
Рис. 3. Зависимость трансэпителиального сопротивления (TEER) от времени при нормоксии и гипоксии
Рис. 4. Позиции связывания микроРНК hsa-miR-23b-5p и hsa-miR-766-3p с 3'-нетранслируемой областью мРНК ITGA5
Таблица 1. Праймеры для ПЦР-РВ. Нуклеотидные последовательности приведены в направлении от 5′- к 3′-концу
Таблица 2. Дифференциальная экспрессия генов, вовлеченных в ответ на гипоксию*
Примечание: * — для анализа список генов, вовлеченных в ответ на гипоксию, сформирован на основании более ранних результатов [26]. ** — показано отношение уровней экспрессии (выраженных в условных единицах) в условиях моделирования гипоксии к контрольным образцам (p < 0,05 в ПЦР-РВ и микрочипах). Экспрессия всех представленных генов была увеличена при имитации гипоксии по отношению к контрольным образцам.
Таблица 3. Дифференциальная экспрессия генов сигнального пути HIF-1
Примечание: * — приведено отношение уровней экспрессии (выраженных в условных единицах) в условиях моделирования гипоксии к контрольным образцам; результаты получены с помощью микрочипового транскриптомного анализа.
