ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Избирательное изменение экспрессии α-субъединиц интегринов в клетках кишечного эпителия Caco-2 при гипоксии в условиях микроциркуляции

Информация об авторах

1 Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», Москва, Россия

2 Art photonics GmbH, Берлин, Германия

Для корреспонденции: Диана Васильевна Мальцева
ул. Вавилова, д. 7, г. Москва, 117321; moc.liamg@avestlamd

Информация о статье

Финансирование: результаты получены при финансовой поддержке Российской Федерации в лице Министерства образования и науки. Уникальный идентификатор проекта RFMEFI61719X0056.

Благодарности: авторы выражают благодарность Центру коллективного пользования «Протеом человека» (ИБМХ) за возможность использования оборудования для анализа протеома, Центру высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины РНИМУ им. Н. И. Пирогова (Москва, Россия) за возможность использования молекулярно-генетических технологий.

Вклад авторов: Д. В. Мальцева — работа с культурой клеток, молекулярно-биологические исследования, анализ данных, подготовка рукописи статьи; А. А. Полозников — обработка данных протеомного и транскриптомного анализа, биоинформатический анализ, функциональный анализ генов, статистический анализ, подготовка рукописи статьи, организация исследования; В. Г. Артюшенко — обсуждение результатов исследования, рецензирование рукописи статьи.

Соблюдение этических стандартов: исследование проведено в соответствии с требованиями Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации.

Статья получена: 09.11.2020 Статья принята к печати: 01.12.2020 Опубликовано online: 16.12.2020
|

Кишечный эпителий постоянно находится в условиях физиологической гипоксии. Дополнительная тканевая гипоксия способна приводить к нарушению его функций и является признаком активного воспалительного процесса. В исследованиях in vitro значительную роль играют условия культивирования, поскольку в свою очередь могут влиять на свойства клеток. Целью работы было провести оценку экспрессии интегриновых рецепторов в клетках аденокарциномы толстого кишечника человека Caco-2 при моделировании условий гипоксии хлоридом кобальта (II) и микроциркуляции. С помощью транскриптомного анализа обнаружено значимое увеличение экспрессии генов α2- и α5-субъединиц интегриновых рецепторов ITGA2 и ITGA5 в условиях гипоксии и уменьшение ITGA5 при инкубировании в микрофлюидном чипе. Экспрессия β-субъединиц при этом не изменилась. При анализе микроРНК-транскриптомов выявлено уменьшение экспрессии микроРНК hsa-miR-766-3p и hsa-miR-23b-5p. В число валидированных мишеней обеих микроРНК входит мРНК гена ITGA5. Показано, что микроциркуляция позволяет создать для энтероцитов кишечника условия культивирования, более близкие к физиологическим. Представлено обсуждение возможного биологического значения выявленных изменений экспрессии профиля интегринов и роли микроциркуляции.

Ключевые слова: гипоксия, кишечная микробиота, микроРНК, мРНК, протеом, Caco-2, интегрины, микрофлюидный чип

КОММЕНТАРИИ (0)