2021 / 05

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2021.048

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Микробиота эякулята у пациентов с нормозооспермией по результатам исследования методом ПЦР в реальном времени

Е. С. Ворошилина1,2, Д. Л. Зорников1, А. В. Иванов3,4, Д. Г. Почерников5, Е. А. Паначева1,2
Информация об авторах

1 Уральский государственный медицинский университет, Екатеринбург, Россия

2 Медицинский центр «Гармония», Екатеринбург, Россия

3 Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б. Н. Ельцина, Екатеринбург, Россия

4 Институт математики и механики имени Н. Н. Красовского, Екатеринбург, Россия

5 Ивановская государственная медицинская академия, Иваново, Россия

Для корреспонденции: Екатерина Сергеевна Ворошилина
ул. Репина, д. 3, г. Екатеринбург, 620028; moc.liamg@anilihsorov

Информация о статье

Благодарности: авторы благодарят директора медицинского центра «Гармония» (г. Екатеринбург) В. Н. Хаютина за возможность выполнения исследования на базе центра.

Вклад авторов: Е. С. Ворошилина — планирование эксперимента, проведение ПЦР-РВ, анализ данных, написание статьи; Д. Л. Зорников — анализ литературы, анализ данных, написание статьи; А. В. Иванов — статистическая обработка, кластерный анализ, написание статьи; Д. Г. Почерников — отбор пациентов, написание статьи; Е. А. Паначева — отбор пациентов, выполнение спермограмм и ПЦР-РВ, анализ литературы, анализ данных, написание статьи.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом Уральского государственного медицинского университета (протокол № 7 от 20 сентября 2019 г.). Все участники исследования подписали добровольное информированное согласие.

Статья получена: 16.09.2021 Статья принята к печати: 06.10.2021 Опубликовано online: 28.10.2021
|
  1. Baud D, Pattaroni C, Vulliemoz N, Castella V, Marsland BJ, Stojanov M. Sperm Microbiota and Its Impact on Semen Parameters. Front Microbiol. 2019; 10: 234. Published 2019 Feb 12. DOI: 10.3389/fmicb.2019.00234.
  2. EAU Guidelines. Edn. presented at the EAU Annual Congress Milan Italy 2021. Available from: https://uroweb.org/guideline/ urological-infections/.
  3. Ochsendorf FR. Sexually transmitted infections: impact on male fertility. Andrologia. 2008; 40 (2): 72–5. DOI: 10.1111/j.14390272.2007.00825.x.
  4. Schuppe HC, Pilatz A, Hossain H, Diemer T, Wagenlehner F, Weidner W. Urogenital Infection as a Risk Factor for Male Infertility. Dtsch Arztebl Int. 2017; 114 (19): 339–46. DOI: 10.3238/ arztebl.2017.0339.
  5. Baud D, Vulliemoz N, Ammerdorffer A, Gyger J, Greub G, Castella V, et al. Waddlia chondrophila, a Chlamydia-related bacterium, has a negative impact on human spermatozoa. Hum Reprod. 2018; 33 (1): 3–10. DOI: 10.1093/humrep/dex342.
  6. Hou D, Zhou X, Zhong X, Settles ML, Herring J, Wang L, et al. Microbiota of the seminal fluid from healthy and infertile men. Fertil Steril. 2013; 100 (5): 1261–9. DOI: 10.1016/j. fertnstert.2013.07.1991.
  7. Liu CM, Osborne BJ, Hungate BA, Liu CM, Osborne BJ, Hungate BA, et al. The semen microbiome and its relationship with local immunology and viral load in HIV infection. PLoS Pathog. 2014; 10 (7): e1004262. DOI: 10.1371/journal.ppat.1004262.
  8. Mändar R, Punab M, Korrovits P, Türk S, Ausmees K, Lapp E, et al. Seminal microbiome in men with and without prostatitis. Int J Urol. 2017; 24 (3): 211–6. DOI: 10.1111/iju.13286.
  9. Weng SL, Chiu CM, Lin FM, Huang WC, Liang C, Yang T, et al. Bacterial communities in semen from men of infertile couples: metagenomic sequencing reveals relationships of seminal microbiota to semen quality. PLoS One. 2014; 9 (10): e110152. DOI: 10.1371/journal.pone.0110152.
  10. Štšepetova J, Baranova J, Simm J, Parm Ü, Rööp T, Sokmann S, et al. The complex microbiome from native semen to embryo culture environment in human in vitro fertilization procedure. Reprod Biol Endocrinol. 2020; 18 (1): 3. DOI: 10.1186/s12958-019-0562-z.
  11. Kiessling AA, Desmarais BM, Yin HZ, Loverde J, Eyre RC. Detection and identification of bacterial DNA in semen. Fertil Steril. 2008; 90 (5): 1744–56. DOI: 10.1016/j.fertnstert.2007.08.083.
  12. Ворошилина Е. С., Зорников Д. Л., Паначева Е. А. Сравнительное исследование микробиоты эякулята методом количественной ПЦР и культуральным методом. Вестник Российского государственного медицинского университета. 2019; 1: 44–9. DOI: 10.24075/vrgmu.2019.009.
  13. Почерников Д. Г., Витвицкая Ю. Г., Болдырева М. Н., Галкина И. С. Информативность биоматериала для исследования микробиоты урогенитального тракта мужчин методом ПЦР-РВ (пилотное исследование). Экспериментальная и клиническая урология. 2019; 2: 128– 133. DOI: 10.29188/2222-8543-2019-11-2-128-132.
  14. WHO. Laboratory manual for the examination and processing of human semen. 5th ed. Geneva: WHO; 2010.
  15. Jain AK, Murty MN, Flynn PJ. Data clustering: a review. ACM computing surveys (CSUR). 1999; 31 (3): 264–323.
  16. Arthur D, Vassilvitskii S. K-means++: the advantages of careful seeding. In: Hal Gabow, editor. Proceedings of the Eighteenth Annual ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms (Proceedings in Applied Mathematics) 18th ed. Society for Industrial and Applied Mathematics (3 January 2007); p. 1027– 35. DOI: 10.1145/1283383.1283494.
  17. Rousseeuw PJ. Silhouettes: A graphical aid to the interpretation and validation of cluster analysis. J Comput Appl Math. 1987; 20; 53–65.
  18. Davies DL, Bouldin DW. A Cluster Separation Measure. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. PAMI1. 1979; 2: 224–7.
  19. de Goffau MC, Lager S, Salter SJ, Wagner J, Kronbichler A, Charnock-Jones DS, et al. Recognizing the reagent microbiome. Nat Microbiol. 2018; 3 (8): 851–3.
  20. Yang H, Zhang J, Xue Z, Zhao C, Lei L, Wen Y, et al. Potential Pathogenic Bacteria in Seminal Microbiota of Patients with Different Types of Dysspermatism. Sci Rep. 2020; 10 (1): 6876. DOI: 10.1038/s41598-020-63787-x.
  21. Ворошилина Е. С., Зорников Д. Л., Иванов А. В., Почерников Д. Г., Паначева Е. А. Микробиота эякулята: кластерный анализ результатов, полученных при исследовании методом ПЦРРВ. Вестник Российского государственного медицинского университета. 2020; 5: 66–73. DOI: 10.24075/vrgmu.2020.064.
  22. Ivanov IB, Kuzmin MD, Gritsenko VA. Microflora of the seminal fluid of healthy men and men suffering from chronic prostatitis syndrome. Int J Androl. 2009; 32 (5): 462–7. DOI: 10.1111/j.13652605.2008.00878.x.
  23. Почерников Д. Г., Постовойтенко Н. Т., Гетьман В. В., Галкина И. С. Диагностическая значимость выявления Lactobacillus spp. в эякуляте. Вестник Российского государственного медицинского университета. 2020; 3: 42– 48. DOI: 10.24075/vrgmu.2020.039.
  24. Lipsky BA, Byren I, Hoey CT. Treatment of bacterial prostatitis. Clin Infect Dis. 2010; 50 (12): 1641–52. DOI: 10.1086/652861.