ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Мутационные основы формирования устойчивости к меропенему у Pseudomonas aeruginosa
Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
ул. Островитянова, д. 1, г. Москва, 117997, Россия: Для корреспонденции: Игорь Викторович Чеботарь
ur.xednay@nnrazin
Финансирование: работа выполнена при поддержке гранта Российского научного фонда (проект № 20-15-00235).
Благодарности: авторы благодарят Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н. И. Пирогова Минздрава РФ за консультации по методической части исследования.
Вклад авторов: И. В. Чеботарь — концептуализация, подготовка рукописи; Ю. А. Бочарова — методология, формальный анализ; А. В. Чаплин — формальный анализ данных секвенирования; Т. А. Савинова — формальный анализ данных секвенирования; Ю. А. Василиадис — методология, выполнение секвенирования; Н. А. Маянский — концептуализация, редактирование рукописи.
Соблюдение этических стандартов: исследование выполнено с соблюдением принципов Хельсинкской декларации и норм работ с условно- патогенными организмами.
Резистентные к карбапенемам штаммы Pseudomonas aeruginosa расценивают в качестве критически опасных патогенов первого уровня приоритета. Расшифровка механизмов формирования устойчивости к карбапенемам является актуальной задачей современной медицинской науки. Целью работы было описать разнообразие и закрепление мутаций, ассоциированных с формированием карбапенемрезистентности в процессе адаптации P. aeruginosa к повышающимся концентрациям меропенема. Объектами исследования были изоляты P. aeruginosa, полученные при росте референтного штамма P. aeruginosa ATCC 27853 в градиенте возрастающих концентраций меропенема. Оценку чувствительности изолятов к меропенему выполняли при помощи е-тестов (эпсилометрический метод) с меропенемом и при помощи метода дилюции антибиотика в агаре. Геномы изолятов были секвенированы на полногеномном секвенаторе MGISEQ-2000. Полученные результаты показали, что формирование высоких уровней резистентности к меропенему у P. aeruginosa в эксперименте происходит в короткие сроки (6 суток). Эволюция резистентности сопряжена с процессом клонирования, при котором происходит возникновение множества клонов с различными генотипами. Основой клонирования является мутагенез, в который вовлечены 11 генов, включая oprD, pbuE, nalD, nalC, spoT, mlaA, mexD, mexR, oprM, mraY, pbp3. Часть образовавшихся клонов, независимо от уровня их резистентности к меропенему, не получают прогрессивного развития и вытесняются более успешными клонами.
Ключевые слова: резистентность, мутации, Pseudomonas aeruginosa, антибиотики, меропенем