2022 / 06

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2022.073

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Подход к разработке пролекарства на основе Амикумацина А

В. И. Шмыгарев1, Ю. А. Прокопенко1, С. С. Терехов1, М. Ю. Захарова1, М. А. Дубинный1, И. В. Смирнов1, И. В. Ямпольский1,2, А. С. Царькова1,2
Информация об авторах

1 Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Москва

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Александра Сергеевна Царькова
ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10, г. Москва, 117997, Россия; moc.liamg@avokrastla

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке гранта Министерства Науки и Высшего образования Российской Федерации № 075-15-2021-1049.

Вклад авторов: Ю. А. Прокопенко — наработка и выделение Амикумацина; В. И. Шмыгарев — полный синтез инактивированного аналога Амикумацина А; С. С. Терехов, М. Ю. Захарова — проведение in vitro экспериментов с протеазой MPro; М. А. Дубинный — ЯМР-спектроскопия и анализ данных; А. С. Царькова — анализ литературы, обработка данных, написание статьи; И. В. Ямпольский, И. В. Смирнов — общее руководство проектом.

Соблюдение этических стандартов: работа проведена с соблюдение принципов Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации.

Статья получена: 15.11.2022 Статья принята к печати: 18.12.2022 Опубликовано online: 30.12.2022
|
  1. Kolahchi Z, De Domenico M, Uddin LQ, Cauda V, Grossmann I, Lacasa L, et al. COVID-19 and Its Global Economic Impact. Adv Exp Med Biol. 2021; 1318: 825‒37.
  2. Marabotti C. Efficacy and effectiveness of covid-19 vaccine - absolute vs. relative risk reduction. Expert Rev Vaccines. 2022; 21 (7): 873‒75.
  3. Olliaro P, Torreele E, Vaillant M. COVID-19 vaccine efficacy and effectiveness—the elephant (not) in the room. The Lancet Microbe. 2021; 2 (7): e279‒e280.
  4. Knoll MD, Wonodi C. Oxford-AstraZeneca COVID-19 vaccine efficacy. Lancet. 2021; 397 (10269): 72‒74.
  5. Jones I, Roy P. Sputnik V COVID-19 vaccine candidate appears safe and effective. Lancet. 2021; 397 (10275): 642‒3.
  6. Owen DR, Allerton CMN, Anderson AS, Aschenbrenner L, Avery M, Berritt S, et al. An oral SARS-CoV-2 Mpro inhibitor clinical candidate for the treatment of COVID-19. Science. 2021; 374: 1586‒93.
  7. de Vries M, Mohamed AS, Prescott RA, Valero-Jimenez AM, Desvignes L, O’Connor R, et al. A comparative analysis of SARS-CoV-2 antivirals characterizes 3CLpro inhibitor PF-00835231 as a potential new treatment for COVID-19. J Virol. 2021; 95 (10): e01819‒20.
  8. Saban M, Kaim A, Myers V, Wilf-Miron R. COVID-19 Vaccination, Morbidity, and Mortality During a 12-Month Period in Israel: Can We Maintain a “Herd Immunity” State? Popul Health Manag. 2022; 25 (5): 684.
  9. Stepanova M, Lam B, Younossi E, Felix S, Ziayee M, Price J, et al. The impact of variants and vaccination on the mortality and resource utilization of hospitalized patients with COVID-19. BMC Infect Dis. 2022; 22: 702.
  10. Itoh J, Omoto S, Shomura T, Nishizawa N, Miyado S, Yuda Y, et al. Amicoumacin-A, a new antibiotic with strong antiinflammatory and antiulcer activity. J Antibiot (Tokyo). 1981; 34 (5): 611‒3.
  11. Терехов С. С., Мокрушина Ю. А., Смирнов И. В., Габибов А. Г. Штамм Bacillus pumilus, продуцирующий антибиотик широкого спектра действия. RU2737856C1, 2020. Доступно по ссылке: https://patents.google.com/patent/RU2737856C1/en?oq=RU2737856C1.
  12. Terekhov SS, Smirnov IV, Malakhova MV, Samoilov AE, Manolo AI, Nazarov AS, et al. Ultrahigh-throughput functional profiling of microbiota communities. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018; 115 (38): 9551‒6.
  13. Zhang L, Lin D, Sun X, Curth U, Drosten C, Sauerhering L, et al. Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease provides a basis for design of improved α-ketoamide inhibitors. Science. 2020; 368 (6489): 409‒12.
  14. Zakharova MY, Kuznetsova AA, Uvarova VI, Fomina AD, Kozlovskaya LI, Kaliberda EN, et al. Pre-Steady-State Kinetics of the SARS-CoV-2 Main Protease as a Powerful Tool for Antiviral Drug Discovery. Front Pharmacol. 2021; 12: 3243.
  15. Baranova MN, Kudzhaev AM, Mokrushina YA, Babenko VV, Kornienko MA, Malakhova MV, et al. Deep Functional Profiling of Wild Animal Microbiomes Reveals Probiotic Bacillus pumilus Strains with a Common Biosynthetic Fingerprint. Int J Mol Sci. 2022; 23 (3): 1168.
  16. Vuong W, Khan MB, Fischer C, Arutyunova E, Lamer T, Shields J, et al. Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication. Nat Commun. 2020; 11: 4282.
  17. Schädel N, Icik E, Martini M, Altevogt L, Ramming I, Greulich A, et al. Synthesis of Imidazole and Histidine-Derived Cross-Linkers as Analogues of GOLD and Desmosine. Synthesis (Stuttg). 2021; 53 (13): 2260‒8.
  18. Mou K, Xu B, Ma C, Yang X, Zou X, Lü Y, et al. Novel CADD-based peptidyl vinyl ester derivatives as potential proteasome inhibitors. Bioorg Med Chem Lett. 2008; 18 (6): 2198‒202.
  19. Prokhorova IV, Akulich KA, Makeeva DS, Osterman IA, Skvortsov DA, Sergiev PV, et al. Amicoumacin A induces cancer cell death by targeting the eukaryotic ribosome. Sci Rep. 2016; 6: 27720.
  20. Maksimova EM, Vinogradova DS, Osterman IA, Kasatsky PS, Nikonov OS, Milón P, et al. Multifaceted Mechanism of Amicoumacin A Inhibition of Bacterial Translation. Front Microbiol. 2021; 12: 618857.
  21. Terekhov SS, Nazarov AS, Mokrushina YA, Baranova MN, Potapova NA, Malakhova MV, et al. Deep functional profiling facilitates the evaluation of the antibacterial potential of the antibiotic amicoumacin. Antibiotics. 2020; 9: 157.
  22. Terekhov SS, Mokrushina YA, Nazarov AS, Zlobin A, Zalevsky A, Bourenkov G, et al. A kinase bioscavenger provides antibiotic resistance by extremely tight substrate binding. Sci Adv. 2020; 6 (26): eaaz9861.
  23. Therapeutics and COVID-19: living guideline, Geneva: World Health Organization c2022 [cited 2022 Dec 19]. Available from: https://app.magicapp.org/#/guideline/nBkO1E/section/nYlJyL.