ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Получение рекомбинантного ингибитора рибонуклеаз в E. coli для использования в синтезе мРНК in vitro

М. В. Захарова1, А. А. Загоскин1,2, Р. А. Иванов2, М. О. Нагорных1,2
Информация об авторах

1 Институт биохимии и физиологии микроорганизмов Российской академии наук, Пущино, Россия

2 Научно-технологический университет «Сириус», Сочи, Россия

Для корреспонденции: Максим Олегович Нагорных
Проспект Науки, д. 5, г. Пущино, 142290, Россия; moc.liamg@rennabred

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке программы Министерства высшего образования и науки РФ (соглашение №. 075-10-2021-113, уникальный номер проекта RF----193021X0001).

Вклад авторов: М. В. Захарова — подбор условий наработки рекомбинантых белков, эксперименты по наработке в разных штаммах E. coli; А. А. Загоскин — хроматографическая очистка рекомбинантных белков; М. О. Нагорных — концепция работы, создание генетических конструкций, написание статьи; Р. А. Иванов — общее руководство.

Статья получена: 16.11.2023 Статья принята к печати: 17.12.2023 Опубликовано online: 31.12.2023
|
Рис. 1. Схематичные карты векторов для наработки ингибитора рибонуклеаз с вспомогательными полипептидами, повышающими растворимость рекомбинантных белков в E. Coli, для вариантов на основе вектора pET28a с промотором Т7 (А), для вариантов на основе вектора pSol с промотором PRha (Б). RNH1 — ген, кодирующий человеческий ингибитор рибонуклеазы; hPP — ген, кодирующий один из хелперных полипептидов (MBP, TIG, TSF, FH8, PpiB, YrhB, SUMO, TRX, GST). Остов вектора pET28a (pET28_backbone) содержит в себе ген устойчивости к канамицину, ориджин репликации pBR322, а также последовательность, кодирующую репрессор lacI. Остов вектора pSol (pSOL_backbone) содержит в себе ген устойчивости к канамицину, ориджин репликации pUC, промотор PRha, индуцируемый рамнозой и терминатор транскрипции
Рис. 2. Влияние вспомогательных полипептидов на растворимость ингибитора рибонуклеаз для вариантов на основе вектора pET28a с промотором Т7 (А), для вариантов на основе вектора pSol с промотором PRha (Б) при наработке в штамме E. coli BL21 (DE3) на 16 °С. Относительный уровень нерастворимой фракции (IS) обозначен красным цветом. Синим показан уровень наработки ингибитора рибонуклеаз в растворимой форме (SO). ОЕ плотности — относительные единицы измерения при денситометрии результатов ПААГ
Рис. 3. Выбор оптимального штамма E. coli для наработки рекомбинантного ингибитора рибонуклеаз в растворимой форме, c использованием векторов, кодирующих химерный белок, состоящий из комбинаций ингибитора рибонуклеаз с двумя вспомогательными полипептидами (MBP, TIG). Относительный уровень нерастворимой фракции (IS) обозначен красным цветом. Синим показан уровень наработки ингибитора рибонуклеаз в растворимой форме (SO). ОЕ плотности — относительные единицы измерения при денситометрии результатов ПААГ
Рис. 4. Влияние дополнительной коэкспрессии генов клеточных шаперонов dnaK, dnaJ, grpE (на рисунке обозначены как KJE), groES и groEL (обозначены как ELS) на наработку рекомбинантного ингибитора рибонуклеаз в штамме E. coli KRX при 16 °С. Относительный уровень нерастворимой фракции (IS) обозначен красным цветом. Синим показан уровень наработки ингибитора рибонуклеаз в растворимой форме (SO). ОЕ плотности — относительные единицы измерения при денситометрии результатов ПААГ