ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Возможности использования профилирования экспрессии мРНК для прогноза прогрессирования локальных стадий колоректального рака

С. В. Гончаров, В. К. Боженко, М. В. Захаренко, А. А. Чаптыков, Т. М. Кулинич, В. А. Солодкий
Информация об авторах

Российский научный центр рентгенорадиологии, Москва, Россия

Для корреспонденции: Сергей Владимирович Гончаров
ул. Профсоюзная, д. 86, 117997, г. Москва, Россия; ur.liam@5109

Информация о статье

Финансирование: работа поддержана грантом РНФ 22-15-00448.

Вклад авторов: С. В. Гончаров, В. К. Боженко, В. А. Солодкий — концепция и дизайн исследования; В. К. Боженко, С. В. Гончаров, Т. М. Кулинич, М. В. Захаренко, В. А. Солодкий — cбор и обработка материала; С. В. Гончаров, А. А. Чаптыков, В. К. Боженко, Т. М. Кулинич — написание текста; С. В. Гончаров, А. А. Чаптыков, В. К. Боженко, Т. М. Кулинич, М. В. Захаренко, В. А. Солодкий — редактирование.

Статья получена: 13.09.2023 Статья принята к печати: 01.12.2023 Опубликовано online: 23.12.2023
|
Рис. 1. Точность прогнозирования с использованием традиционных клинико-морфологических факторов риска прогрессирования КРР
Рис. 2. Точность прогноза логит-модели с использованием профилей экспрессии мРНК восьми генов
Рис. 3. Распределение индивидуального прогноза в модели с использованием клинико-морфологических факторов риска прогрессирования
Таблица 1. Гены, включенные в анализ
Таблица 2. Логит-модель с использованием традиционных критериев прогнозирования риска прогрессирования КРР
Примечание: Дифференцировка опухоли (G) — принимает значение «0», если степень дифференцировки G1 или G2, и «1» если G3; если нет признаков ангиолимфатической и/или лимфоваскулярной инвазии при гистологическом исследовании, то попеременная принимает значение «0», и «1» — если хоть один из таковых есть; соотношение числа метастатических лимфоузлов к общему числу, удаленных в операционном препарате. Принимает значение от 0 до 1; Возраст — возраст пациента, равный полному числу лет; Локализация – локализация опухоли: принимает значение «0» при правосторонней локализации опухоли (слепая, восходящая, поперечноободочная кишка) и «1» — при левосторонней (нисходящая ободочная, сигмовидная, прямая кишка); 0,332 — постоянный коэффициент (константа) в модели.
Таблица 3. Матрица классификации логит-модели на основании традиционных клинико-морфологических факторов риска прогрессирования КРР
Таблица 4. Логит-модель с использованием профилей экспрессии мРНК
Примечание: Дифференцировка опухоли (G) — принимает значение «0», если степень дифференцировки G1 или G2, и «1», если G3; если нет признаков ангиолимфатической и/или лимфоваскулярной инвазии при гистологическом исследовании, то попеременная принимает значение «0», и «1», если хоть один из таковых есть; соотношение числа метастатических лимфоузлов к общему числу, удаленных в операционном препарате. Принимает значение от 0 до 1; Возраст — возраст пациента, равный полному числу лет; CCNB1, Ki67, GRB7, IGF1, Il2, Il6, Il8, GATA3 — уровни экспрессии соответствующего гена в опухоли; 11,05 — постоянный коэффициент в модели.
Таблица 5. Матрица классификации логит-модели с использованием профилей экспрессии мРНК восьми генов