ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Новый рекомбинантный ингибитор РНКаз LoRI для применения in vitro

Д. А. Сухов1,2,3, И. В. Холошенко1,4, Т. В. Петрова1, Г. А. Романенко1,2, М. Ю. Мышкин3, В. Ю. Кост3, Д. Ю. Трофимов1, Н. Ю. Усман5, Е. В. Барсова3,5
Информация об авторах

1 ООО «ДНК-Технология», Москва, Россия

2 МИРЭА — Российский технологический университет, Москва, Россия

3 Институт биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Москва, Россия

4 Московский государственный технический университет имени Н. Э. Баумана, Москва, Россия

5 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Наталья Юрьевна Усман
ул. Островитянова, д. 1/1, г. Москва, 117997, Россия; ur.relbmar@namsu_n

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено при финансовой поддержке ООО «ДНК-Технология».

Вклад авторов: Д. А. Сухов, Г. А. Романенко — инженерия, экспрессия и очистка белков; И. В. Холошенко, Т. В. Петрова — характеризация продукта, написание статьи; М. Ю. Мышкин — анализ структуры белка; В. Ю. Кост — дизайн исследования; Д. Ю. Трофимов — руководство проектом; Н. Ю. Усман — написание статьи; Е. В. Барсова — координация проекта, написание статьи.

Статья получена: 02.09.2024 Статья принята к печати: 09.10.2024 Опубликовано online: 28.10.2024
|
  1. Thomas SP, Kim E, Kim JS, Raines RT. Knockout of the ribonuclease inhibitorgGene leaves human cells vulnerable to secretory ribonucleases. Biochemistry. 2016; 55 (46): 6359–62. DOI: 10.1021/acs.biochem.6b01003.
  2. Abel RL, Haigis MC, Park C, Raines RT. Fluorescence assay for the binding of ribonuclease A to the ribonuclease inhibitor protein. Anal Biochem. 2002; 306 (1): 100–07. DOI: 10.1006/abio.2002.5678.
  3. Lee FS, Shapiro R, Vallee BL. Tight-binding inhibition of angiogenin and ribonuclease A by placental ribonuclease inhibitor [published correction appears in Biochemistry 1989 Mar 7; 28 (5): 2354]. Biochemistry. 1989; 28 (1): 225–30. DOI: 10.1021/bi00427a031.
  4. Nishibata Y, Koshimoto S, Ogaki K, Ishikawa E, Wada K, Yoshinari M, Ishizu A. RNase in the saliva can affect the detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 by real-time one-step polymerase chain reaction using saliva samples. Pathol Res Pract. 2021; 220: 153381. DOI: 10.1016/j.prp.2021.153381.
  5. Šiurkus J, Neubauer P. Heterologous production of active ribonuclease inhibitor in Escherichia coli by redox state control and chaperonin coexpression. Microb Cell Fact. 2011; 10: 65. DOI: 10.1186/1475-2859-10-65.
  6. Lee S, Kim SM, Lee RT. Thioredoxin and thioredoxin target proteins: from molecular mechanisms to functional significance. Antioxid Redox Signal. 2013; 18 (10): 1165–207. DOI: 10.1089/ars.2011.4322.
  7. LaVallie ER, Lu Z, Diblasio-Smith EA, Collins-Racie LA, McCoy JM. Thioredoxin as a fusion partner for production of soluble recombinant proteins in Escherichia coli. Methods Enzymol. 2000; 326: 322–40. DOI: 10.1016/s0076-6879(00)26063-1.
  8. Abramson J, Adler J, Dunger J, et al. Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3. Nature. 2024; 630: 493–500 DOI: 10.1038/s41586-024-07487-w.
  9. Kyratsous CA, Silverstein SJ, DeLong CR, Panagiotidis CA. Chaperone-fusion expression plasmid vectors for improved solubility of recombinant proteins in Escherichia coli. Gene. 2009; 440 (1–2): 9–15. DOI: 10.1016/j.gene.2009.03.011.
  10. Kobe B, Deisenhofer J. A structural basis of the interactions between leucine-rich repeats and protein ligands. Nature. 1995; 374 (6518): 183–6. DOI: 10.1038/374183a0.
  11. Dixon M, Webb EC. Enzymes. 2nd Edition. New York: Academic Press, 1964.
  12. Fominaya JM, Hofsteenge J. Inactivation of ribonuclease inhibitor by thiol-disulfide exchange. J Biol Chem. 1992; 267 (34): 24655–60.
  13. Klink TA, Vicentini AM, Hofsteenge J, Raines RT. High-level soluble production and characterization of porcine ribonuclease inhibitor. Protein Expr Purif. 2001; 22 (2): 174–9. DOI: 10.1006/prep.2001.1422.
  14. Dickson KA, Haigis MC, Raines RT. Ribonuclease inhibitor: structure and function. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 2005; 80: 349–74. DOI: 10.1016/S0079-6603(05)80009-1.