Авторские права: © 2025 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Особенности транскриптомного профиля FAP+-клеток в опухолях молочной железы различных молекулярно-биологических подтипов

А. Ю. Калинчук, И. А. Пацкан, М. М. Штадельман, Е. С. Григорьева, Л. А. Таширева
Информация об авторах

Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, Россия

Для корреспонденции: Евгения Сергеевна Григорьева
Переулок Кооперативный, д. 7, г. Томск, 634009, Россия; moc.liamg@se.aveyrogirg

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (грант № 25-65-00021).

Вклад авторов: А. Ю. Калинчук — написание и оформление статьи; И. А. Пацкан — биоинформатический анализ; М. М. Штадельман — сбор и анализ данных; Е. С. Григорьева — интерпретация полученных данных; Л. А. Таширева — интерпретация полученных данных, разработка концепции. Все авторы участвовали в финальном редактировании статьи.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом НИИ онкологии Томского НИМЦ (Протокол № 3 от 25 августа 2020 г.). Работа выполнена в соответствии с принципами Хельсинкской декларации (1964 г.) и ее поправками (1975 и 1983 гг.). Все пациентки предоставили письменное информированное согласие на участие в исследовании.

Статья получена: 10.09.2025 Статья принята к печати: 08.10.2025 Опубликовано online: 16.10.2025
|

Понимание подтип-специфичной вариабельности функциональных программ FAP+ опухоль-ассоциированных фибробластов (ОАФ) является фундаментальным для разработки эффективных терапевтических стратегий, нацеленных на стромальные мишени. Целью работы было идентифицировать подтип-специфичные сигнальные пути, маркеры и молекулярные особенности FAP+ ОАФ. Исследовали образцы тканей, полученные от 15 пациенток с раком молочной железы (РМЖ). С помощью пространственного транскриптомного анализа продемонстрировано, что FAP+ ОАФ при люминальном РМЖ проявляют фенотип, характеризующийся организацией внеклеточного матрикса (GO:0030198, FDR q-value = 0,0307) и экспрессией генов, ассоциированных с метастазированием (COL10A1, MMP13, CXCL14, TSPAN8). В отличие от этого, FAP+ ОАФ при тройном негативном раке демонстрируют выраженный иммуномодуляторный фенотип со сверхэкспрессией генов иммуносупрессии (CD36, PLA2G2A, CHI3L1) и обогащением сигнальных путей иммунного ответа (иммунный ответ (GO:0006955, FDR q-value = 7,85e-17), ответ на воспаление (GO:0006954, FDR q-value = 2,79e-11), регуляция продукции цитокинов (GO:0001817, FDR q-value = 3,39e-10)). Идентифицированы также подтипспецифичные сигнатуры генов радиорезистентности: люминальные А- и Б-подтипы, показана активация путей репарации ДНК (IGF1R, ERBB3, CRIP1), в то время как тройные негативные опухоли демонстрируют обогащение маркеров эпителиально-мезенхимального перехода и стволовости (ZEB2, NOTCH4, FOXM1). Эти данные подчеркивают, что FAP+-фибробласты не являются однородной популяцией, а функционально специализируются в зависимости от подтипа опухоли, выступая в качестве архитекторов стромы при люминальном раке и регуляторов иммунного ответа при тройном негативном РМЖ.

Ключевые слова: рак молочной железы, фибробласты, опухолевое микроокружение, пространственная транскриптомика

КОММЕНТАРИИ (0)