
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Особенности транскриптомного профиля FAP+-клеток в опухолях молочной железы различных молекулярно-биологических подтипов
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, Россия
Для корреспонденции: Евгения Сергеевна Григорьева
Переулок Кооперативный, д. 7, г. Томск, 634009, Россия; moc.liamg@se.aveyrogirg
Финансирование: работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (грант № 25-65-00021).
Вклад авторов: А. Ю. Калинчук — написание и оформление статьи; И. А. Пацкан — биоинформатический анализ; М. М. Штадельман — сбор и анализ данных; Е. С. Григорьева — интерпретация полученных данных; Л. А. Таширева — интерпретация полученных данных, разработка концепции. Все авторы участвовали в финальном редактировании статьи.
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом НИИ онкологии Томского НИМЦ (Протокол № 3 от 25 августа 2020 г.). Работа выполнена в соответствии с принципами Хельсинкской декларации (1964 г.) и ее поправками (1975 и 1983 гг.). Все пациентки предоставили письменное информированное согласие на участие в исследовании.
Понимание подтип-специфичной вариабельности функциональных программ FAP+ опухоль-ассоциированных фибробластов (ОАФ) является фундаментальным для разработки эффективных терапевтических стратегий, нацеленных на стромальные мишени. Целью работы было идентифицировать подтип-специфичные сигнальные пути, маркеры и молекулярные особенности FAP+ ОАФ. Исследовали образцы тканей, полученные от 15 пациенток с раком молочной железы (РМЖ). С помощью пространственного транскриптомного анализа продемонстрировано, что FAP+ ОАФ при люминальном РМЖ проявляют фенотип, характеризующийся организацией внеклеточного матрикса (GO:0030198, FDR q-value = 0,0307) и экспрессией генов, ассоциированных с метастазированием (COL10A1, MMP13, CXCL14, TSPAN8). В отличие от этого, FAP+ ОАФ при тройном негативном раке демонстрируют выраженный иммуномодуляторный фенотип со сверхэкспрессией генов иммуносупрессии (CD36, PLA2G2A, CHI3L1) и обогащением сигнальных путей иммунного ответа (иммунный ответ (GO:0006955, FDR q-value = 7,85e-17), ответ на воспаление (GO:0006954, FDR q-value = 2,79e-11), регуляция продукции цитокинов (GO:0001817, FDR q-value = 3,39e-10)). Идентифицированы также подтипспецифичные сигнатуры генов радиорезистентности: люминальные А- и Б-подтипы, показана активация путей репарации ДНК (IGF1R, ERBB3, CRIP1), в то время как тройные негативные опухоли демонстрируют обогащение маркеров эпителиально-мезенхимального перехода и стволовости (ZEB2, NOTCH4, FOXM1). Эти данные подчеркивают, что FAP+-фибробласты не являются однородной популяцией, а функционально специализируются в зависимости от подтипа опухоли, выступая в качестве архитекторов стромы при люминальном раке и регуляторов иммунного ответа при тройном негативном РМЖ.
Ключевые слова: рак молочной железы, фибробласты, опухолевое микроокружение, пространственная транскриптомика