2025 / 06

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2025.066
Авторские права: © 2025 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).

МЕТОД

Детекция Salmonella enterica петлевой изотермальной амплификацией ДНК с использованием флуоресцентно меченого петлевого праймера

Д. В. Шамовская1 , М. А. Гордукова2 , М. А. Смертина1 , Е. В. Галеева2 , И. П. Оскорбин1 , Е. А. Храпов1 , У. А. Боярских1 , М. Л. Филипенко1,3
Информация об авторах

1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, Россия

2 Детская городская клиническая больница № 9 им. Г. Н. Сперанского, Москва, Россия

3 Институт трансляционной медицины и биотехнологий, Сеченовский университет, Москва, Россия

Для корреспонденции: Максим Леонидович Филипенко
ул. Проспект Лаврентьева, д. 8, г. Новосибирск, 630090, Россия; moc.liamg@oknepiliflm

Информация о статье

Финансирование: исследование поддержано в рамках государственного задания ИХБФМ СО РАН № 125012300671-8.

Вклад авторов: Д. В. Шамовская, М. А. Смертина, Е. А. Храпов — оптимизация и валидация LAMP на клинических образцах; М. А. Гордукова, Е. В. Галеева — сбор клинических образцов и данных пациентов; И. П. Оскорбин — планирование экспериментов LAMP; У. А. Боярских — дизайн праймеров LAMP; М. Л. Филипенко — идея исследования, написание и редактирование статьи.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом ИХБФМ СО РАН (протокол № 4 от 25 мая 2022 г.), этическим комитетом при ГБУЗ «ДГКБ № 9 им. Г. Н. Сперанского ДЗМ» (протокол № 44 от 19 апреля 2022 г.). Пациенты подписали добровольное информированное согласие.

Статья получена: 23.11.2025 Статья принята к печати: 13.12.2025 Опубликовано online: 22.12.2025
|
  1. Hugas M, Beloeil PA. Controlling Salmonella along the food chain in the European Union — progress over the last ten years. Eurosurveillance. 2014; 19 (19): 1–4. DOI: 10.2807/1560-7917.ES2014.19.19.20804.
  2. de Jong HK, Parry CM, van der Poll T, Wiersinga WJ. Host-Pathogen Interaction in Invasive Salmonellosis. PLoS Pathog. 2012; 8–10: 1002933. DOI: 10.1371/journal.ppat.1002933.
  3. Pimenov NV, Laishevtcev AI. Modern methods of epizootic and epidemiological monitoring in the poultry industry on the example of Salmonella infection. Russ J Agric Socio-Economic Sci. 2017; 64–4: 257–69. DOI: 10.18551/rjoas.2017-04.33.
  4. Fu H, Xu W, Huang M, Cong Y. Molecular Detection of Salmonella. J Food Prot. 2025; 88–12:100659. DOI: 10.1016/j.jfp.2025.100659.
  5. Chirambo AC, Nyirenda TS, Jambo N, Msefula C, Kamngona A, Molina S, et al. Performance of molecular methods for the detection of Salmonella in human stool specimens. Wellcome Open Res. 2021; 5: 237. DOI: 10.12688/wellcomeopenres.16305.2.
  6. Notomi T. Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 2000; 28–12: 63e–63. DOI: 10.1093/nar/28.12.e63.
  7. Garg N, Ahmad FJ, Kar S. Recent advances in loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for rapid and efficient detection of pathogens. Curr Res Microb Sci. 2022; 3: 100120. DOI: 10.1016/j.crmicr.2022.100120.
  8. Liu N, Zou D, Dong D, Yang Z, Ao D, Liu W, et al. Development of a multiplex loop-mediated isothermal amplification method for the simultaneous detection of Salmonella spp. and Vibrio parahaemolyticus. Sci Rep. 2017; 7–1: 45601. DOI: 10.1038/srep45601.
  9. Yang Q, Domesle KJ, Ge B. Loop-Mediated Isothermal Amplification for Salmonella Detection in Food and Feed: Current Applications and Future Directions. Foodborne Pathog. Dis. 2018; 15–6: 309–31. DOI: 10.1089/fpd.2018.2445.
  10. Zhuang L, Gong J, Li Q, Zhu C, Yu Y, Dou X, et al. Detection of Salmonella spp. by a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method targeting bcfD gene. Lett Appl Microbiol. 2014; 59–6: 658–64. DOI: 10.1111/lam.12328.
  11. Chen S, Wang F, Beaulieu JC, Stein RE, Ge B. Rapid Detection of Viable Salmonellae in Produce by Coupling Propidium Monoazide with Loop-Mediated Isothermal Amplification. Appl Environ Microbiol. 2011; 77–12: 4008–16. DOI: 10.1128/AEM.00354-11.
  12. Gadkar VJ, Goldfarb DM, Gantt S, Tilley PAG. Real-time Detection and Monitoring of Loop Mediated Amplification (LAMP) Reaction Using Self-quenching and De-quenching Fluorogenic Probes. Sci Rep. 2018; 8–1: 5548. DOI: 10.1038/s41598-018-23930-1.
  13. Lee S-Y, Oh S-W. Point-of-Care Diagnostic System for Viable Salmonella Species via Improved Propidium Monoazide and Recombinase Polymerase Amplification Based Nucleic Acid Lateral Flow. Diagnostics. 2024; 14–8: 831. DOI: 10.3390/diagnostics14080831.
  14. Abdullah J, Saffie N, Sjasri FAR, Husin A, Abdul-Rahman Z, Ismail A, et al. Rapid detection of Salmonella Typhi by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method. Brazilian J. Microbiol. 2014; 45–4: 1385–91. DOI: 10.1590/S1517-83822014000400032.
  15. Oscorbin IP, Belousova EA, Boyarskikh UA, Zakabunin AI, Khrapov EA, Filipenko ML. Derivatives of Bst-like Gss-polymerase with improved processivity and inhibitor tolerance. Nucleic Acids Res. 2017; 45–16: 9595–10. DOI: 10.1093/nar/gkx645.
  16. Pusterla N, Naranatt P, Swadia H, Winfield L, Hartwig A, Barnum S, et al. Multi-Centered Field Evaluation of a Salmonella spp. Point-of-Care PCR Assay Using Equine Feces and Environmental Samples. J Equine Vet Sci. 2023; 126: 104538. DOI: 10.1016/j.jevs.2023.104538.
  17. Zhang X, Zhao Y, Zeng Y, Zhang C. Evolution of the Probe-Based Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assays in Pathogen Detection. Diagnostics. 2023; 13–9: 1530. DOI: 10.3390/diagnostics13091530.