2026 / 01

Следующая статья
DOI: 10.24075/vrgmu.2026.002
Авторские права: © 2026 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Сравнительные протеомные и генетические методы анализа при невынашивании беременности

П. А. Клименко1 , А. В. Лисица2 , Н. А. Петушкова2 , Н. Н. Вейко3 , С. В. Костюк3 , Е. С. Ершова3 , М. П. Клименко1 , А. А. Герасимова4 , О. В. Юсеф1 , С. И. Ващенко1 , М. А. Курцер1
Информация об авторах

1 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

2 Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В. Н. Ореховича, Москва, Россия

3 Институт биологии старения и медицины здорового долголетия с клиникой превентивной медицины ГНЦРФ РНЦХ имени Б. В. Петровского, Москва, Россия

4 Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы, Москва, Россия

Для корреспонденции: Петр Афанасьевич Клименко
ул. Новаторов, д. 3, г. Москва, 119421, Россия; ur.umsr@ap_oknemilk

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена в рамках Программы фундаментальных научных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период (2021–2030 годы) (№ 122030100170-5).

Благодарности: масс-спектрометрические измерения выполняли на оборудовании ЦКП «Протеом человека» Института биомедицинской химии (Россия).

Вклад авторов: равнозначный.

Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом РНИМУ им. Н. И. Пирогова (протокол № 228 от 17 апреля 2023 г.). Все обследованные подписали добровольное информированное согласие на участие в исследовании.

Статья получена: 08.12.2025 Статья принята к печати: 19.01.2026 Опубликовано online: 28.01.2026
|
  1. Сидельникова В. М. Привычная потеря беременности. М.: Триада-Х, 2002; 32 с.
  2. Tarrade A, Lai Kuen R, Malassiné A, et al. Characterization of human villous and extravillous trophoblasts isolated from first trimester placenta. Lab Invest. 2001; 81 (9): 1199–211. Available from: https://doi.org/10.1038/labinvest.3780334.
  3. Elguoshy A, Magdeldin S, Xu B, et al. Why are they missing? Bioinformatics characterization of missing human proteins. J Proteomics. 2016; 149: 7–14. Available from: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2016.08.005.
  4. Zhou L, Wong L, Wen Bin Goh W. Understanding missing proteins: a functional perspective. Drug Discov Today. 2018; 23 (3): 644– 51. Available from: https://doi.org/10.1016/j.drudis.2017.11.011.
  5. Malinovskaya E, Ershova E, Golimbet V, et al. Copy number of human ribosomal genes with aging: unchanged mean, but narrowed range and decreased variance in elderly group. Front Genet. 2018; 9: 306. Available from: https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00306.
  6. Ляпунова Н. А., Вейко Н. Н. Рибосомные гены в геноме человека: идентификация четырех фракций, их локализация в ядрышке и метафазных хромосомах. Генетика. 2010; 46 (9): 1205–9.
  7. Пороховник Л. Н., Еголина Н. А., Косякова Н. В., и др. Зиготический и эмбриональный отбор по геномной дозе активных рибосомных генов как один из возможных факторов сниженной плодовитости супружеских пар. Медицинская генетика. 2012; 11 (6): 31–4.
  8. Veiko N, Ershova E, Porokhovnik L, et al. Ribosomal, telomere, and mitochondrial repeat copy number variations in female genomes during ovarian stimulation and the prediction of in vitro fertilization outcome: a pilot study. Front Biosci (Schol Ed). 2023; 15 (3): 9. Available from: https://doi.org/10.31083/j.fbs1503009.
  9. Shkrigunov T, Pogodin P, Zgoda V, et. al. Protocol for Increasing the Sensitivity of MS-Based Protein Detection in Human Chorionic Villi. Curr Issues Mol Biol. 2022; 44 (5): 2069–88. Available from: https://doi.org/10.3390/cimb44050140.
  10. Smith P, Krohn R, Hermanson G, et al. Measurement of Protein Using Bicinchoninic Acid Anal Biochem. 1985; 150 (1): 76–85. Available from: https://doi.org/10.1016/0003-2697(85)90442-7.
  11. Shevchenko A, Tomas H, Havlis J, et al. In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes. Nat Protoc. 2006; 1 (6): 2856–60. Available from: https://doi.org/10.1038/nprot.2006.468.
  12. Vaudel M, Barsnes H, Berven F, et al. SearchGUI: An open-source graphical user interface for simultaneous OMSSA and X!Tandem searches. Proteomics. 2011; 11 (5): 996–9. Available from: https://doi.org/10.1002/pmic.201000595.
  13. Vaudel M, Burkhart J, Zahedi R, et al. PeptideShaker enables reanalysis of MS-derived proteomics data sets. Nat Biotechnol. 2015; 33 (1): 22–4. Available from: https://doi.org/10.1038/nbt.3109.
  14. Neilson K, Keighley T, Pascovici D, et al. Label-free quantitative shotgun proteomics using normalized spectral abundance factors. Methods Mol Biol. 2013; 1002: 205–22. Available from: https://doi.org/10.1007/978-1-62703-360-2_17.
  15. Godini R, Fallahi H. Dynamics changes in the transcription factors during early human embryonic development. J Cell Physiol. 2019; 234 (5): 6489–502. Available from: https://doi.org/10.1002/jcp.27386.
  16. Пороховник Л. Н., Вейко Н. Н., Ершова Е. С., и др. Копийность рибосомной ДНК (рДНК) в геномах женщин как фактор успешности ЭКО и наличия осложнений беременности. Медицинская генетика. 2019; 18 (11): 14–25. Available from: https://doi.org/10.25557/2073-7998.2019.11.14-25.
  17. Liao C, Pang N, Liu Z, et al. Transient inhibition of rDNA transcription in donor cells improves ribosome biogenesis and preimplantation development of embryos derived from somatic cell nuclear transfer. FASEB J. 2020; 34 (6): 8283–95. Available from: https://doi.org/10.1096/fj.202000025RR.
  18. Hammarström S. The carcinoembryonic antigen (CEA) family: structures, suggested functions and expression in normal and malignant tissues. Semin Cancer Biol. 1999; 9 (2): 67–81. Available from: https://doi.org/10.1006/scbi.1998.0119.
  19. An Online Catalog of Human Genes and Genetic Disorders: PREGNANCY-SPECIFIC BETA-1-GLYCOPROTEIN 11; PSG11. Available from: https://omim.org/entry/176401.
  20. Su X, Zhang J, Yang W, et al. Identification of the Prognosis-Related lncRNAs and Genes in Gastric Cancer. Front Genet. 2020; 11: 22. Available from: https://doi.org/10.3389/fgene.2020.00027.
  21. Khan W, Hammarström S. Identification of a new carcinoembryonic antigen (CEA) family member in human fetal liver--cloning and sequence determination of pregnancy-specific glycoprotein 7. Biochem Biophys Res Commun. 1990; 168 (1): 214–25. Available from: https://doi.org/10.1016/0006-291x(90)91696-p.
  22. Jamioł M, Wawrzykowski J, Mojsym W, et al. Activity of selected glycosidases and availability of their substrates in bovine placenta during pregnancy and parturition with and without retained foetal membranes. Reprod Domest Anim. 2020; 55 (9): 1093–102. Available from: https://doi.org/10.1111/rda.13747.
  23. Sui L, An L, Tan K, et al. Dynamic Proteomic Profiles of In Vivo- and In Vitro-Produced Mouse Postimplantation Extraembryonic Tissues and Placentas. Biol Reprod. 2014; 91 (155): 1–16. Available from: https://doi.org/10.1095/biolreprod.114.124248.
  24. Watanabe N, Kato T, Fujita A, et al. Cooperation between mDia1 and ROCK in Rho-induced actin reorganization. Nat Cell Biol. 1999; 1 (3): 136–43. Available from: https://doi.org/10.1038/11056.
  25. Wirrig E, Snarr B, Chintalapudi M, et al. Cartilage link protein 1 (Crtl1), an extracellular matrix component playing an important role in heart development. Dev Biol. 2007; 310 (2): 291–303. Available from: https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2007.07.041.
  26. Veiko N, Ershova S, Veiko R, et al. Mild cognitive impairment is associated with low copy number of ribosomal genes in the genomes of elderly people. Front Genet. 2022; 13: 967448. Available from: https://doi.org/10.3389/fgene.2022.967448.
  27. Ershova E, Malinovskaya E, Golimbet V, et al. Copy number variations of satellite III (1q12) and ribosomal repeats in health and schizophrenia. Schizophr Res. 2020; 223: 199–212. Available from: https://doi.org/10.1016/j.schres.2020.07.022.
  28. Кондратьева Е., Ершова Е., Николаева Е., и др. Результаты изучения комплекса рибосомных генов человека при муковисцидозе. Пульмонология. 2023; 33 (1): 7–16. Available from: https://doi.org/10.18093/0869-0189-2023-33-1-7-16.
  29. Sun Y, Hu X, Qiu D, et al. rDNA Transcription in Developmental Diseases and Stem Cells. Stem Cell Rev Rep. 2023; 19 (4): 839– 52. Available from: https://doi.org/10.1007/s12015-023-10504-6.