ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Согласованная динамика сывороточного IgE и численности IgE+-клонотипов с уровнем пыльцы в воздухе при поллинозе
1 Сколковский институт науки и технологий, Москва, Россия
2 Институт биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Москва, Россия
3 Российский национальный исследовательский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
Для корреспонденции: Иван Владимирович Звягин
ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10, г. Москва, 117997; moc.liamg@nigayvzi
Финансирование: исследование выполнено при поддержке Совета по грантам Президента Российской Федерации (грант MK6000.2018.4).
Благодарности: выражаем большую признательность всем донорам, принявшим участие в исследовании.
Вклад авторов в работу: А. И. Микелов — определение уровня антител, подготовка библиотек кДНК IGH, анализ данных секвенирования и полученных результатов, дизайн исследования, подготовка рукописи; Д. Б. Староверов — выделение клеточных субпопуляций с помощью проточной цитофлюорометрии; Е. А. Комеч — сбор образцов крови, выделение клеточных субпопуляций с помощью проточной цитофлюорометрии; Ю. Б. Лебедев — анализ и обсуждение полученных результатов, консультативная поддержка; Д. М. Чудаков — анализ и обсуждение полученных результатов, консультативная поддержка подготовки библиотек кДНК; И. В. Звягин — подготовка библиотек кДНК IGH, анализ данных секвенирования и полученных результатов, дизайн исследования, подготовка рукописи, организация исследования.
- Bauchau V, Durham SR. Prevalence and rate of diagnosis of allergic rhinitis in Europe. European Respiratory Journal. 2004; 24 (5): 758–64. https://doi.org/10.1183/09031936.04.00013904.
- Biedermann T, Winther L, Till SJ, Panzner P, Knulst A, Valovirta E. Birch pollen allergy in Europe. Allergy. 2019; 74 (7): all.13758. https://doi.org/10.1111/all.13758.
- Penagos M, Eifan AO, Durham SR, Scadding GW. Duration of Allergen Immunotherapy for Long-Term Efficacy in Allergic Rhinoconjunctivitis. Current Treatment Options in Allergy. 2018; 5 (3): 275–90. https://doi.org/10.1007/s40521-018-0176-2.
- Balbino B, Conde E, Marichal T, Starkl P, Reber LL. Approaches to target IgE antibodies in allergic diseases. Pharmacology & Therapeutics. 2018; (191): 50–64. https://doi.org/10.1016/j. pharmthera.2018.05.015.
- Rudulier CD, Tonti E, James E, Kwok WW, Larché M. Modulation of CRTh2 expression on allergen specific T cells following peptide immunotherapy. Allergy. 2019; all.13867. https://doi.org/10.1111/ all.13867.
- Jiménez-Saiz R, Chu DK, Mandur TS, Walker TD, Gordon ME, Chaudhary R, et al. Lifelong memory responses perpetuate humoral TH2 immunity and anaphylaxis in food allergy. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 2017; 140 (6): 1604–15. https:// doi.org/10.1016/j.jaci.2017.01.018.
- Jiménez-Saiz R, Bruton K, Koenig JF, Waserman S, Jordana M. The IgE memory reservoir in food allergy. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 2018; 142 (5): 1441–3. https://doi. org/10.1016/j.jaci.2018.08.029.
- Beeh K, Beier J, Buhl R. Seasonal variations of serum-IgE and potential impact on dose-calculation of omalizumab (rhuMab-E25, anti-IgE). Pneumologie. 2004; 58 (08): 546–51. https://doi. org/10.1055/s-2004-818483.
- Sato K, Nakazawa T, Sahashi N, Kochibe N. Yearly and Seasonal Changes of Specific IgE to Japanese Cedar Pollen in a Young Population. Annals of Allergy, Asthma & Immunology. 1997; 79 (1): 57–61. https://doi.org/10.1016/S1081-1206(10)63085-2.
- Gleich GJ, Jacob GL, Yunginger JW, Henderson LL. Measurement of the absolute levels of IgE antibodies in patients with ragweed hay fever. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 1977; 60 (3): 188–98. https://doi.org/10.1016/0091-6749(77)90123-3.
- Turchaninova MA, Davydov A, Britanova OV, Shugay M, Bikos V, Egorov ES, et al. High-quality full-length immunoglobulin profiling with unique molecular barcoding. Nature Protocols. 2016; 11 (9): 1599–616. https://doi.org/10.1038/nprot.2016.093.
- Shugay M, Britanova OV, Merzlyak EM, Turchaninova MA, Mamedov IZ, Tuganbaev TR, et al. Towards error-free profiling of immune repertoires. Nature Methods. 2014; (11): 653. http:// dx.doi.org/10.1038/nmeth.2960.
- Bolotin DA, Poslavsky S, Mitrophanov I, Shugay M, Mamedov IZ, Putintseva EV, et al. MiXCR: software for comprehensive adaptive immunity profiling. Nature Methods. 2015; (12): 380. https://doi.org/10.1038/nmeth.3364.
- R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. 2013. URL http://www.R-project.org/.
- Wickham H. ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis. New York: Springer-Verlag, 2016. Retrieved from https://ggplot2. tidyverse.org.
- Gupta NT, Vander Heiden JA, Uduman M, Gadala-Maria D, Yaar G, Kleinstein SH. Change-O: a toolkit for analyzing large-scale B cell immunoglobulin repertoire sequencing data. Bioinformatics. 2015; 31 (20): 3356–8. DOI: 10.1093/bioinformatics/btv359.
- Sudhir Kumar, Glen Stecher, Koichiro Tamura. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets, Molecular Biology and Evolution. 2016; 33 (7): 1870–4. https:// doi.org/10.1093/molbev/msw054.
- Looney TJ, Lee JY, Roskin KM, Hoh RA, King J, Glanville J, et al. Human B-cell isotype switching origins of IgE. Journal of Allergy and Clinical Immunology. 2016; 137 (2): 579–86. https://doi. org/10.1016/j.jaci.2015.07.014.
- Horst A, Hunzelmann N, Arce S, Herber M, Manz RA, Radbruch A, et al. Detection and characterization of plasma cells in peripheral blood: Correlation of IgE+ plasma cell frequency with IgE serum titre. Clinical and Experimental Immunology. 2002; 130 (3): 370–8. https://doi.org/10.1046/j.1365-2249.2002.02025.x.