ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Гипоксия усиливает трансцитоз в энтероцитах кишечника

Д. В. Мальцева1, М. Ю. Шкурников1,2, С. А. Нерсисян1, С. В. Никулин1, А. А. Курносов1, М. П. Райгородская3, А. И. Осипьянц2,4, Е. А. Тоневицкий5
Информация об авторах

1 Национальный исследовательский университет Высшая школа экономики, Москва, Россия

2 Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена — филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии, Москва, Россия

3 Научно-технический центр «БиоКлиникум», Москва, Россия

4 Дальневосточный федеральный университет, Владивосток, Россия

5 Фонд развития инновационного научно-технологического центра «Долина Менделеева», Москва, Россия

Для корреспонденции: Диана Васильевна Мальцева
ул. Вавилова, д. 7, г. Москва, 117321; moc.liamg@avestlamd

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при финансовой поддержке государства в лице Минобрнауки России, уникальный идентификатор соглашения: RFMEFI61719X0056.

Благодарности: авторы благодарят Центр коллективного пользования «Протеом человека» (ИБМХ) за возможность использования оборудования.

Вклад авторов: Д. В. Мальцева — молекулярно-биологические исследования, анализ данных, написание статьи; М. Ю. Шкурников — обработка данных транскриптома, секвенирования, статистический анализ; С. А. Нерсисян — обработка данных секвенирования, биоинформатический анализ, функциональный анализ генов; С. В. Никулин — работа с культурой клеток, подготовка образцов для анализа протеома, обработка данных протеома; А. А. Курносов — подготовка образцов для секвенирования микроРНК, анализ данных; М. П. Райгородская — анализ экспрессии генов методом ПЦР-РВ, транскриптомный анализ; А. И. Осипьянц — культуральная работа, подготовка образцов для анализа протеома и транскриптома; Е. А. Тоневицкий — организация исследования, анализ данных, написание статьи.

Статья получена: 08.08.2020 Статья принята к печати: 21.08.2020 Опубликовано online: 28.08.2020
|
Рис. 1. Зависимость трансэпителиального сопротивления (TEER) от времени при обработке энтероцитов кишечника растительным лектином рицином
Рис. 2. Оценка количества биотинилированного лектина рицин, подвергнувшегося трансцитозу энтероцитами кишечника в стандартных условиях культивирования (контроль) и в условиях гипоксии; * — доля лектина, подвергнувшегося трансцитозу через 6 ч в условиях гипоксии достоверно отличается от контроля (p < 0,05)
Таблица 1. Дифференциально экспрессированные гены, вовлеченные во внутриклеточный транспорт везикул
Примечание: * — представлено отношение уровней экспрессии (выраженных в условных единицах) при гипоксии к контрольным образцам; результаты получены с помощью микрочипов. Отрицательное число означает, что экспрессия данного гена уменьшилась в соответствующее число раз
Таблица 2. Дифференциально экспрессированные микроРНК, регулирующие экспрессию белков внутриклеточного транспорта везикул
Примечание: * — представлено отношение уровней экспрессии (выраженных в условных единицах) при гипоксии к контрольным образцам; результаты получены с помощью NGS. Отрицательное число означает, что экспрессия данной микроРНК уменьшилась в соответствующее число раз