ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
Авторские права: © 2025 принадлежат авторам. Лицензиат: РНИМУ им. Н.И. Пирогова.
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
Статья размещена в открытом доступе и распространяется на условиях лицензии Creative Commons Attribution (CC BY).
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Панель IFN-I-индуцируемых генов при системной склеродермии: потенциал биомаркера стратификации
Информация об авторах
1 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия
2 ООО «МайЛаборатори», Москва, Россия
3 Московский городской научно-исследовательский центр Больница № 52, Москва, Россия
4 Федеральный научно-клинический центр реаниматологии и реабилитологии, Москва, Россия
5 Институт биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова Российской академии наук, Москва, Россия
Для корреспонденции: Ольга Владимировна Британова
ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10, 117997, г. Москва, Россия, moc.liamg@natirblo; Зинаида Юрьевна Мутовина — ул. Пехотная, д. 3, 123182, г. Москва, Россия, ur.liam@anivotumz
Информация о статье
Финансирование: исследование выполнено на средства гранта Правительства Москвы (НИР № 1603-47/23 от 08.06.2023), спонсор — АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении».
Вклад авторов: З. Ю. Мутовина — концепция; Т. И. Журина, Р. Ф. Сайфуллин — сбор данных в сфере ревматологии и медицины; анализ литературы М. Ю. Мышкин — анализ данных; Л. С. Буфеева — сбор образцов, выделение РНК; И. А. Шагина — оптимизация и проведение RT-qPCR, первичный анализ данных, подготовка рукописи, анализ литературы; М. А.Турчанинова, О. А. Головина, О. В. Британова — подготовка рукописи, анализ литературы.
Соблюдение этических стандартов: исследование проведено в соответствии с требованиями Хельсинкской декларации. От всех пациентов получено добровольное информационное согласие в рамках прохождения обследования в стационаре (на взятие образцов биоматериала и проведение анализов).
Статья получена: 06.09.2025
Статья принята к печати: 08.10.2025
Опубликовано online: 21.10.2025
|
Рис. 1. Сравнение относительных уровней экспрессии исследуемых генов методом ОТ-ПЦР в реальном времени (p-value — по критерию Манна–Уитни) между образцами кожи в группах больных ССД (n = 23) и здоровых доноров (n = 3) (A), между образцами периферической крови в группах больных ССД (n = 35) и здоровых доноров (n = 31) (Б). Склерод. — склеродерма
Рис. 2. Сравнение интерфероновой сигнатуры в крови и коже пациентов с ССД. А. Сравнение относительных уровней экспрессии исследуемых генов IFIT3, IFI27, IFI44, ISG15, XAF1 в образцах РНК кожи и периферической крови пациентов с ССД (n = 10), представленных в виде боксплота. Применен парный критерий Уилкоксона. Б. Парная корреляция экспрессии генов панели IFN-I между кровью и кожей. В. В виде столбчатой диаграммы показаны средние значения логарифмов отношений экспрессии генов (log-fold-change) в коже к экспрессии генов в крови. Отрицательные значения указывают на большую экспрессию в крови, положительные — в коже. Г. Корреляция усредненной IFN-I-сигнатуры между кровью и кожей попарных образцов (n = 10), (R = 0,49; p = 0,15). Б, Г Использован коэффициент корреляции Спирмена (серые области — 95% ДИ). Д. Значения IFN-I-сигнатуры (z-score, нормировка по донорам) в образцах кожных биопсий: красные точки — здоровые доноры (n = 3), синие точки — пациенты с ССД (n = 23). E. Значения IFN-I-сигнатуры (z-score, нормировка по здоровым донорам) в образцах периферической крови. Красные точки — здоровые доноры (n = 31), синие точки — пациенты с ССД (n = 35, включая 10 парных образцов кожа/кровь). Пунктирной линией отмечен пороговый интервал
Рис. 3. Матрица корреляции уровня экспрессии генов IFN-I-сигнатуры (IFI44, IFIT3, ISG15, IFI27, XAF1) в образцах и клинических признаков в группе пациентов с ССД для образцов периферической крови (n = 35) (A) и для образцов пораженной кожи (n = 23) (Б). Экспрессия гена SFRP4 добавлена, как маркер заболевания. Цвет круга показывает знак и силу корреляции: синий — положительная, красный — отрицательная; чем насыщеннее цвет, тем ближе |r| к 1. Размер круга пропорционален модулю коэффициента корреляции Спирмена
Таблица 1. Результаты клинико-иммунологического обследования пациентов с ССД (n = 48)
Таблица 2. Уровень экспрессии генов в образцах кожи в группах больных ССД (n = 23) и здоровых доноров (n = 3) (A), в образцах периферической крови в группах больных ССД (n = 35) и здоровых доноров (n = 31) (Б)
Примечание: * iqr — межквартильное расстояние.
Таблица 3. Уровень экспрессии исследуемых генов IFIT3, IFI27, IFI44, ISG15, XAF1 в образцах РНК кожи и периферической крови этих же пациентов с ССД (n = 10)
Примечание: * — межквартильное расстояние.
Таблица 4. Значения корреляции между уровнем экспрессии генов IFN-I-сигнатуры (IFI44, IFIT3, ISG15, IFI27, XAF1) в образцах и клиническими признаками в группе пациентов с ССД в образцах крови (n = 35), (4А) и в образцах кожи (n = 23) (4Б)
