ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Генетический полиморфизм госпитальных штаммов Staphylococcus epidermidis, выделенных у новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии
Информация об авторах
1 Отдел микробиологии и клинической фармакологии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва
2 Отдел клинической и молекулярной генетики,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва
3 Отдел неонатологии и педиатрии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва
Для корреспонденции: Алексей Борисович Гордеев
ул. Академика Опарина, д. 4, г. Москва, 117997; ur.sertorp.agev@weedrog
Информация о статье
Финансирование: работа выполнена при поддержке Министерства образования и науки РФ (соглашение № 14.607.21.0019 от 05.06.2014,
шифр заявки 2014-14-579-0001-065).
Вклад авторов в работу: А. Б. Гордеев — проведение биоинформатического анализа нуклеотидных последовательностей, анализ литературы, подготовка черновика рукописи; Л. А. Любасовская — проведение микробиологических исследований, анализ литературы, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Ю. В. Родченко, Д. В. Дубоделов — проведение микробиологических исследований, подготовка черновика рукописи; И. С. Мукосей, Т. О. Кочеткова — полногеномное секвенирование и сборка нуклеотидных последовательностей; И. В. Никитина — планирование исследования, интерпретация данных; О. В. Ионов, В. В. Зубков — планирование исследования, организация взятия биологического материала; Д. Ю. Трофимов — планирование исследования, организация работы по полногеномному секвенированию; Т. В. Припутневич — планирование исследования, организация микробиологических исследований, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.
Статья получена: 02.02.2017
Статья принята к печати: 18.02.2017
Опубликовано online: 11.03.2017
|
Таблица 1. Характеристики сборки геномов штаммов S. epidermidis на основе полногеномного секвенирования
Таблица 2. Анализ антибиотикорезистентности штаммов S. epidermidis
Примечание. R — резистентный штамм (resistant), S — чувствительный штамм (sensitive).
Таблица 3. Наличие генов резистентности у штаммов S. epidermidis
Примечание. Символами + и – обозначены наличие и отсутствие гена резистентности в геноме штамма. Ген aacA-aphD — устойчивость штаммов к амикацину, гентамицину, канамицину и тобрамицину; ген aadD — устойчивость к амикацину, канамицину, неомицину и тобрамицину; aphA — к канамицину и неомицину; blaZ — к пенициллинам; mecA — к бета-лактамным антибиотикам; fusB, fusC — к фузидиевой кислоте; vanA, vanB, vanZ — к ванкомицину; lnu(A), vga(A), vga(B) — к линкозамидам (клиндамицину); msr(A), mph(C) — к макролидным антибиотикам (эритромицину); erm(A), erm(B), erm(C) — к макролидным антибиотикам и линкозамидам одновременно; vat(B) — к стрептограмину B; tet(M), tet(K) — к тетрациклину; dfr(G), dfr(K) — к триметоприму.
Таблица 4. Наличие генов, ассоциированных с патогенностью, у штаммов S. epidermidis
Примечание. Символами + и – обозначены наличие и отсутствие гена резистентности в геноме штамма.
