2017 / 01

Следующая статья
DOI: 10.24075/brsmu.2017-01-02

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Генетический полиморфизм госпитальных штаммов Staphylococcus epidermidis, выделенных у новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии

А. Б. Гордеев1, Л. А. Любасовская1, Ю. В. Родченко1, Д. В. Дубоделов1, И. С. Мукосей2, Т. О. Кочеткова2, И. В. Никитина3, О. В. Ионов3, В. В. Зубков3, Д. Ю. Трофимов2, Т. В. Припутневич1
Информация об авторах

1 Отдел микробиологии и клинической фармакологии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

2 Отдел клинической и молекулярной генетики,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

3 Отдел неонатологии и педиатрии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

Для корреспонденции: Алексей Борисович Гордеев
ул. Академика Опарина, д. 4, г. Москва, 117997; ur.sertorp.agev@weedrog

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке Министерства образования и науки РФ (соглашение № 14.607.21.0019 от 05.06.2014,
шифр заявки 2014-14-579-0001-065).

Вклад авторов в работу: А. Б. Гордеев — проведение биоинформатического анализа нуклеотидных последовательностей, анализ литературы, подготовка черновика рукописи; Л. А. Любасовская — проведение микробиологических исследований, анализ литературы, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Ю. В. Родченко, Д. В. Дубоделов — проведение микробиологических исследований, подготовка черновика рукописи; И. С. Мукосей, Т. О. Кочеткова — полногеномное секвенирование и сборка нуклеотидных последовательностей; И. В. Никитина — планирование исследования, интерпретация данных; О. В. Ионов, В. В. Зубков — планирование исследования, организация взятия биологического материала; Д. Ю. Трофимов — планирование исследования, организация работы по полногеномному секвенированию; Т. В. Припутневич — планирование исследования, организация микробиологических исследований, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.

Статья получена: 02.02.2017 Статья принята к печати: 18.02.2017 Опубликовано online: 11.03.2017
|
  1. Otto M. Molecular basis of Staphylococcus epidermidis infections. Semin Immunopathol. 2012 Mar; 34 (2): 201–14.
  2. Любасовская Л. А., Корниенко М. А., Припутневич Т. В., Ильина Е. Н., Щеголев А. И. Микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика коагулазонегативных стафилококков, выделенных у новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии. Антибиот. и химиотер. 2013; 58 (3–4): 25–32.
  3. Miragaia M, Thomas JC, Couto I, Enright MC, de Lencastre H. Inferring a population structure for Staphylococcus epidermidis from multilocus sequence typing data. J Bacteriol. 2007 Mar; 189 (6): 2540–52.
  4. Salgueiro VC, Iorio NL, Ferreira MC, Chamon RC, Dos Santos KR. Methicillin resistance and virulence genes in invasive and nasal Staphylococcus epidermidis isolated from neonates. BMC Microbiol. 2017 Jan 13; 17 (1): 15.
  5. Becker K, Heilmann C, Peters G. Coagulase-negative staphylococci. Clin Microbiol Rev. 2014 Oct; 27 (4): 870–926.
  6. Flamm RK, Mendes RE, Ross JE, Sader HS, Jones RN. An international activity and spectrum analysis of linezolid: ZAAPS Program results for 2011. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013 Jun; 76 (2): 206–13.
  7. Mendes RE, Deshpande LM, Costello AJ, Farrell DJ. Molecular epidemiology of Staphylococcus epidermidis clinical isolates from U.S. hospitals. Antimicrob Agents Chemother. 2012 Sep; 56 (9): 4656–61.
  8. McManus BA, Coleman DC, Deasy EC, Brennan GI, O'Connell B, Monecke S, et al. Comparative genotypes, staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) genes and antimicrobial resistance amongst Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus isolates from infections in humans and companion animals. PLoS One. 2015 Sep 17; 10 (9): e0138079.
  9. Дубоделов Д. В., Любасовская Л. А., Шубина Е. С., Мукосей И. С., Коростин Д. О., Кочеткова Т. О. и др. Генетические детерминанты резистентности к β-лактамным антибиотикам госпитальных штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных у
  10. Larsen MV, Cosentino S, Rasmussen S, Friis C, Hasman H, Marvig RL, et al. Multilocus sequence typing of total-genome- sequenced bacteria. J Clin Microbiol. 2012 Apr; 50 (4): 1355–61.
  11. Zankari E, Hasman H, Cosentino S, Vestergaard M, Rasmussen S, Lund O, et al. Identification of acquired antimicrobial resistance genes. J Antimicrob Chemother. 2012 Nov; 67 (11): 2640–4.
  12. Benson DA, Cavanaugh M, Clark K, Karsch-Mizrachi I, Lipman DJ, Ostell J, et al. GenBank. Nucleic Acids Res. 2013 Jan; 41 (Database issue): D36–42.
  13. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990 Oct 5; 215 (3): 403–10.
  14. Rohde H, Kalitzky M, Kröger N, Scherpe S, Horstkotte MA, Knobloch JK, et al. Detection of virulence-associated genes not useful for discriminating between invasive and commensal Staphylococcus epidermidis strains from a bone marrow transplant unit. J Clin Microbiol. 2004 Dec; 42 (12): 5614–9.
  15. Thomas JC, Zhang L, Robinson DA. Differing lifestyles of Staphylococcus epidermidis as revealed through Bayesian clustering of multilocus sequence types. Infect Genet Evol. 2014 Mar; 22: 257–64.
  16. Rogers KL, Rupp ME, Fey PD. The presence of icaADBC is detrimental to the colonization of human skin by Staphylococcus epidermidis. Appl Environ Microbiol. 2008 Oct; 74 (19): 6155–7.
  17. Gu J, Li H, Li M, Vuong C, Otto M, Wen Y, et al. Bacterial insertion sequence IS256 as a potential molecular marker to discriminate invasive strains from commensal strains of Staphylococcus epidermidis. J Hosp Infect. 2005 Dec; 61 (4): 342–8.
  18. Conlan S, Mijares LA; NISC Comparative Sequencing Program, Becker J, Blakesley RW, Bouffard GG, et al. Staphylococcus epidermidis pan-genome sequence analysis reveals diversity of skin commensal and hospital infection-associated isolates. Genome Biol. 2012 Jul 25; 13 (7): R64.